215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_B0088 on replicon NC_010157
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  100 
 
 
771 aa  1587    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0079  transposase  76.3 
 
 
435 aa  681    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.776565  normal  0.783345 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  53.31 
 
 
997 aa  628  1e-178  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  52.55 
 
 
1006 aa  618  1e-175  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  52.06 
 
 
991 aa  593  1e-168  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  52.06 
 
 
991 aa  593  1e-168  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5398  transposase Tn3 family protein  45.67 
 
 
1029 aa  524  1e-147  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0815937  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19600  transposase, TnpA family  45.45 
 
 
1028 aa  494  9.999999999999999e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.546457  normal  0.0923144 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4723  transposase, Tn3 family  43.28 
 
 
1075 aa  459  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4775  transposase Tn3 family protein  37.94 
 
 
838 aa  351  2e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.855357  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2347  transposase Tn3  44.74 
 
 
916 aa  333  5e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.669911  normal  0.26387 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  36.94 
 
 
964 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  35.69 
 
 
988 aa  328  3e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  35.69 
 
 
988 aa  328  3e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  36.49 
 
 
988 aa  326  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  36.49 
 
 
988 aa  326  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  36.49 
 
 
988 aa  326  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  36.49 
 
 
988 aa  326  1e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  36.08 
 
 
988 aa  325  2e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  36.77 
 
 
988 aa  324  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  36.54 
 
 
988 aa  324  5e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  35.22 
 
 
988 aa  324  5e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  35.22 
 
 
988 aa  324  5e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  36.32 
 
 
988 aa  323  7e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  36.32 
 
 
988 aa  322  9.999999999999999e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  35.4 
 
 
988 aa  321  3e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  35.75 
 
 
990 aa  321  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  35.75 
 
 
990 aa  321  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  35.52 
 
 
606 aa  320  7.999999999999999e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  35.4 
 
 
988 aa  320  7.999999999999999e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  36.43 
 
 
989 aa  319  1e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  35.41 
 
 
990 aa  318  3e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  35.23 
 
 
990 aa  317  7e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  35.23 
 
 
990 aa  317  7e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  35.23 
 
 
990 aa  317  7e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  35.23 
 
 
755 aa  315  9.999999999999999e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  35.23 
 
 
990 aa  315  9.999999999999999e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  33.97 
 
 
989 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  32.62 
 
 
983 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  33.39 
 
 
985 aa  301  4e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  34.19 
 
 
988 aa  300  8e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  34.19 
 
 
988 aa  300  8e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  34.19 
 
 
988 aa  300  8e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  33.51 
 
 
1015 aa  297  4e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  31.01 
 
 
987 aa  297  6e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  32.69 
 
 
994 aa  286  1.0000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3666  transposase Tn3 family protein  33.81 
 
 
924 aa  284  4.0000000000000003e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376312  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  33.81 
 
 
976 aa  283  6.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  32.87 
 
 
994 aa  283  1e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  32.87 
 
 
994 aa  282  2e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  32.87 
 
 
862 aa  282  2e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  29.61 
 
 
992 aa  280  6e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  32.8 
 
 
550 aa  273  7e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  30.66 
 
 
991 aa  261  5.0000000000000005e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  32.46 
 
 
961 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  32.21 
 
 
968 aa  253  7e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  29.3 
 
 
991 aa  253  1e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  29.3 
 
 
991 aa  253  1e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3764  Tn3 family transposase  86.61 
 
 
154 aa  251  3e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0072  transposase  32.18 
 
 
546 aa  249  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.520579  normal  0.363066 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0196  transposase  37.69 
 
 
338 aa  243  7e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1822  transposase Tn3 family protein  35.29 
 
 
371 aa  243  7e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  30.1 
 
 
999 aa  242  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  30 
 
 
988 aa  242  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  29.83 
 
 
988 aa  240  9e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  28.95 
 
 
988 aa  239  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  30.53 
 
 
996 aa  236  1.0000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  29.86 
 
 
996 aa  230  7e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  29.86 
 
 
996 aa  230  7e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  29.86 
 
 
996 aa  230  7e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3676  transposase Tn3 family protein  29.46 
 
 
772 aa  225  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.635368 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4311  TOBE domain-containing protein  30.32 
 
 
573 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  29.98 
 
 
992 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  29.98 
 
 
992 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2106  transposase  28.84 
 
 
1059 aa  219  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.818957  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  29.96 
 
 
983 aa  218  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00623  transposase  27.67 
 
 
986 aa  216  9.999999999999999e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5358  transposase Tn3 family protein  26.75 
 
 
990 aa  216  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17398 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2512  transposase Tn3  27.6 
 
 
989 aa  211  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227381  normal  0.0913005 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3718  transposase Tn3 family protein  37.18 
 
 
305 aa  207  5e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.396342  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1226  transposase Tn3  26.35 
 
 
993 aa  206  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6606  transposase Tn3 family protein  26.35 
 
 
993 aa  206  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0187013 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35740  putative transposase  26.73 
 
 
1004 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000831562  decreased coverage  4.65352e-19 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3065  transposase  26.73 
 
 
1004 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2964  Tn4652, transposase  26.54 
 
 
1004 aa  200  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0744329 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1842  transposase Tn3 family protein  26.94 
 
 
1012 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.550818  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0150  Tn1721 transposase  38.49 
 
 
310 aa  194  4e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.751061 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4307  transposase Tn3 family protein  25 
 
 
995 aa  192  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4443  transposase Tn3 family protein  27.17 
 
 
999 aa  188  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.597289  normal  0.3426 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5050  transposase Tn3 family protein  27.17 
 
 
999 aa  188  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2486  transposase Tn3  25.69 
 
 
1013 aa  188  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147103  normal  0.0287681 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1731  transposase Tn3 family protein  27.17 
 
 
999 aa  188  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.473502  normal  0.357058 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4333  transposase Tn3 family protein  27.17 
 
 
999 aa  188  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0519662 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2394  transposase Tn3 family protein  26.24 
 
 
1007 aa  187  5e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2107  transposase Tn3 family protein  26.24 
 
 
1007 aa  187  5e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02944  Tn5044 transposase  26.33 
 
 
990 aa  187  6e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0926862  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6852  transposase Tn3 family protein  26.06 
 
 
994 aa  187  8e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4134  transposase Tn3 family protein  28.04 
 
 
1028 aa  187  9e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.160281  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4363  transposase Tn3 family protein  24.2 
 
 
995 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0457124  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0025  transposase Tn3 family protein  26.43 
 
 
1006 aa  183  9.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>