219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2667 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  39.16 
 
 		 988 aa  675    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  39.16 
 
 		 988 aa  675    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  38 
 
 		 989 aa  648    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  100 
 
 		 961 aa  1942    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  39.77 
 
 		 988 aa  664    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  40.16 
 
 		 988 aa  684    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  40.14 
 
 		 988 aa  684    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  39.12 
 
 		 988 aa  677    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  39.12 
 
 		 988 aa  677    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  38.5 
 
 		 989 aa  665    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  39.12 
 
 		 988 aa  677    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  39.12 
 
 		 988 aa  677    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  39.43 
 
 		 988 aa  684    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  39.86 
 
 		 988 aa  659    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  39.86 
 
 		 988 aa  659    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  39.86 
 
 		 988 aa  659    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  39.18 
 
 		 990 aa  675    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  39.03 
 
 		 964 aa  667    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0072  transposase  100 
 
 		 546 aa  1020    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.520579  normal  0.363066 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  39.38 
 
 		 990 aa  675    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  39.38 
 
 		 990 aa  675    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  39.38 
 
 		 990 aa  675    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  39.57 
 
 		 988 aa  670    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  39.57 
 
 		 988 aa  670    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  39.38 
 
 		 990 aa  674    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  39.88 
 
 		 988 aa  667    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  39.07 
 
 		 985 aa  672    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4311  TOBE domain-containing protein  68.19 
 
 		 573 aa  780    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  39.59 
 
 		 990 aa  677    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1567  transposase  99.43 
 
 		 358 aa  704    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.385647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  39.43 
 
 		 988 aa  684    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  40.72 
 
 		 1015 aa  696    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  39.16 
 
 		 988 aa  674    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3676  transposase Tn3 family protein  63.42 
 
 		 772 aa  985    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.635368 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  39.18 
 
 		 990 aa  675    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  39.57 
 
 		 996 aa  631  1e-179  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  40.21 
 
 		 992 aa  623  1e-177  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  40.21 
 
 		 992 aa  623  1e-177  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  33.78 
 
 		 992 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  39.26 
 
 		 996 aa  612  1e-173  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  39.26 
 
 		 996 aa  612  1e-173  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  39.26 
 
 		 996 aa  612  1e-173  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  36.58 
 
 		 994 aa  590  1e-167  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  35.54 
 
 		 988 aa  579  1e-164  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  36.21 
 
 		 994 aa  580  1e-164  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  36.21 
 
 		 994 aa  581  1e-164  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  35.11 
 
 		 983 aa  570  1e-161  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  36.38 
 
 		 991 aa  568  1e-160  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  36.25 
 
 		 999 aa  558  1e-157  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  35.84 
 
 		 983 aa  546  1e-154  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  40.71 
 
 		 755 aa  537  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  35.99 
 
 		 991 aa  537  1e-151  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  35.99 
 
 		 991 aa  537  1e-151  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  33.26 
 
 		 987 aa  527  1e-148  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  37.14 
 
 		 862 aa  527  1e-148  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  35.5 
 
 		 988 aa  525  1e-147  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  35.43 
 
 		 988 aa  524  1e-147  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4307  hypothetical protein  60.45 
 
 		 400 aa  484  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  44.7 
 
 		 606 aa  464  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3567  transposase Tn3 family protein  33.33 
 
 		 877 aa  451  1e-125  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0660182  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  44.4 
 
 		 550 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3715  transposase Tn3 family protein  32.62 
 
 		 731 aa  363  8e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  29.08 
 
 		 1006 aa  320  6e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3718  transposase Tn3 family protein  53.12 
 
 		 305 aa  315  2.9999999999999996e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.396342  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0203  transposase  30.3 
 
 		 738 aa  304  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000452446 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0150  Tn1721 transposase  53.96 
 
 		 310 aa  294  6e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.751061 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  29.65 
 
 		 968 aa  290  1e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  27.17 
 
 		 997 aa  283  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0196  transposase  41.8 
 
 		 338 aa  279  2e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  27.87 
 
 		 991 aa  279  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  27.87 
 
 		 991 aa  279  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3465  transposase Tn3 family protein  32.93 
 
 		 526 aa  271  5e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1822  transposase Tn3 family protein  39.22 
 
 		 371 aa  266  1e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  28.78 
 
 		 976 aa  266  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0035  transposase  54.89 
 
 		 255 aa  259  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.401081  normal  0.351265 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  32.46 
 
 		 771 aa  258  3e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2107  transposase Tn3 family protein  26.62 
 
 		 1007 aa  254  4.0000000000000004e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2394  transposase Tn3 family protein  26.62 
 
 		 1007 aa  254  4.0000000000000004e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3666  transposase Tn3 family protein  29.28 
 
 		 924 aa  248  4.9999999999999997e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376312  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5398  transposase Tn3 family protein  26.19 
 
 		 1029 aa  243  9e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0815937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19600  transposase, TnpA family  27.25 
 
 		 1028 aa  241  4e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.546457  normal  0.0923144 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1821  transposase Tn3 family protein  27.42 
 
 		 612 aa  241  4e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4723  transposase, Tn3 family  27.26 
 
 		 1075 aa  238  6e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0238  transposase  28.52 
 
 		 613 aa  234  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3677  hypothetical protein  63.79 
 
 		 174 aa  233  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.472291 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2486  transposase Tn3  26.35 
 
 		 1013 aa  232  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147103  normal  0.0287681 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1842  transposase Tn3 family protein  25.43 
 
 		 1012 aa  231  5e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.550818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5358  transposase Tn3 family protein  24.02 
 
 		 990 aa  224  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17398 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0079  transposase  32.51 
 
 		 435 aa  222  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.776565  normal  0.783345 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0239  transposase  46.64 
 
 		 246 aa  219  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0202  transposase  46.19 
 
 		 246 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.295684  hitchhiker  6.17068e-17 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4119  hypothetical protein  72.41 
 
 		 179 aa  213  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5067  transposase Tn3 family protein  24.42 
 
 		 969 aa  213  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0388929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00623  transposase  24.34 
 
 		 986 aa  210  8e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0358  transposase Tn3 family protein  42.21 
 
 		 273 aa  210  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35740  putative transposase  23.37 
 
 		 1004 aa  209  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000831562  decreased coverage  4.65352e-19 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3065  transposase  23.37 
 
 		 1004 aa  209  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2964  Tn4652, transposase  23.51 
 
 		 1004 aa  205  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0744329 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0197  transposase  28.11 
 
 		 523 aa  205  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4307  transposase Tn3 family protein  22.64 
 
 		 995 aa  205  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>