232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4598 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  85.12 
 
 		 988 aa  1736    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  85.12 
 
 		 988 aa  1736    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  84.43 
 
 		 989 aa  1741    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  41 
 
 		 988 aa  764    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  39.12 
 
 		 961 aa  677    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  46.81 
 
 		 996 aa  889    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  40.46 
 
 		 983 aa  769    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  93.83 
 
 		 988 aa  1917    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  44.73 
 
 		 992 aa  951    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  87.78 
 
 		 990 aa  1802    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  55.63 
 
 		 994 aa  1090    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  95.14 
 
 		 988 aa  1941    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  41.73 
 
 		 988 aa  703    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  38.38 
 
 		 991 aa  668    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  47.07 
 
 		 996 aa  887    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  90.28 
 
 		 988 aa  1831    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  79.45 
 
 		 606 aa  974    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  72.77 
 
 		 988 aa  1476    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  87.78 
 
 		 990 aa  1802    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  100 
 
 		 988 aa  2028    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  95.96 
 
 		 989 aa  1949    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  96.15 
 
 		 988 aa  1959    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  71.37 
 
 		 1015 aa  1472    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  88.08 
 
 		 755 aa  1373    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  100 
 
 		 988 aa  2028    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  100 
 
 		 988 aa  2028    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  38.58 
 
 		 991 aa  657    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  38.58 
 
 		 991 aa  657    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3465  transposase Tn3 family protein  85.24 
 
 		 526 aa  914    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  47.07 
 
 		 996 aa  887    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  47.07 
 
 		 996 aa  887    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  61.23 
 
 		 988 aa  1229    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  61.23 
 
 		 988 aa  1229    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  61.23 
 
 		 988 aa  1229    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  77.74 
 
 		 985 aa  1599    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  91.8 
 
 		 964 aa  1863    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  40.87 
 
 		 987 aa  762    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  90.38 
 
 		 988 aa  1842    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3715  transposase Tn3 family protein  63.54 
 
 		 731 aa  926    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  87.07 
 
 		 990 aa  1788    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  87.07 
 
 		 990 aa  1788    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  87.07 
 
 		 990 aa  1788    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  41.73 
 
 		 988 aa  704    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  72.27 
 
 		 988 aa  1470    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  72.27 
 
 		 988 aa  1470    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  86.77 
 
 		 990 aa  1778    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  38.38 
 
 		 999 aa  654    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  100 
 
 		 988 aa  2028    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  72.57 
 
 		 988 aa  1469    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  43.98 
 
 		 992 aa  789    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  43.98 
 
 		 992 aa  789    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  87.07 
 
 		 990 aa  1789    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  55.03 
 
 		 994 aa  1092    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  63.54 
 
 		 550 aa  716    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  55.13 
 
 		 994 aa  1093    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  56.89 
 
 		 862 aa  995    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3567  transposase Tn3 family protein  37.76 
 
 		 877 aa  590  1e-167  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0660182  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  35.92 
 
 		 983 aa  586  1e-166  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3676  transposase Tn3 family protein  38.72 
 
 		 772 aa  519  1.0000000000000001e-145  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.635368 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0150  Tn1721 transposase  86.41 
 
 		 310 aa  512  1e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.751061 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3718  transposase Tn3 family protein  77.55 
 
 		 305 aa  480  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.396342  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0035  transposase  86.27 
 
 		 255 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.401081  normal  0.351265 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0072  transposase  46.61 
 
 		 546 aa  449  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.520579  normal  0.363066 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4311  TOBE domain-containing protein  42.11 
 
 		 573 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  31.56 
 
 		 1006 aa  431  1e-119  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0203  transposase  33.33 
 
 		 738 aa  429  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000452446 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  32.99 
 
 		 968 aa  415  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  30.23 
 
 		 997 aa  393  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  32.99 
 
 		 976 aa  391  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1822  transposase Tn3 family protein  49.46 
 
 		 371 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3666  transposase Tn3 family protein  33.37 
 
 		 924 aa  376  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376312  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2083  transposase Tn3 family protein  44.29 
 
 		 440 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1821  transposase Tn3 family protein  33.22 
 
 		 612 aa  369  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0358  transposase Tn3 family protein  65.04 
 
 		 273 aa  360  9e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0238  transposase  33.22 
 
 		 613 aa  360  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0196  transposase  48.21 
 
 		 338 aa  348  3e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  28.61 
 
 		 991 aa  344  5e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  28.61 
 
 		 991 aa  344  5e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1576  transposase  85.28 
 
 		 203 aa  341  5e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0122395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2317  transposase Tn3  95.93 
 
 		 339 aa  338  2.9999999999999997e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000027108  hitchhiker  0.0000324498 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  36.49 
 
 		 771 aa  326  1e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5050  TnpA family transposase  94.77 
 
 		 264 aa  325  2e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0197  transposase  32.82 
 
 		 523 aa  323  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19600  transposase, TnpA family  29.53 
 
 		 1028 aa  322  1.9999999999999998e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.546457  normal  0.0923144 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4723  transposase, Tn3 family  28.73 
 
 		 1075 aa  319  2e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2512  transposase Tn3  26.56 
 
 		 989 aa  317  8e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227381  normal  0.0913005 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3347  transposase Tn3  95.65 
 
 		 161 aa  317  9e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0077216  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5398  transposase Tn3 family protein  29.12 
 
 		 1029 aa  314  5.999999999999999e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0815937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00623  transposase  25.59 
 
 		 986 aa  304  6.000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02944  Tn5044 transposase  26.54 
 
 		 990 aa  294  7e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0926862  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4443  transposase Tn3 family protein  26.61 
 
 		 999 aa  288  5e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.597289  normal  0.3426 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1731  transposase Tn3 family protein  26.61 
 
 		 999 aa  288  5e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.473502  normal  0.357058 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5050  transposase Tn3 family protein  26.61 
 
 		 999 aa  288  5e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4333  transposase Tn3 family protein  26.61 
 
 		 999 aa  288  5e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0519662 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1226  transposase Tn3  26.57 
 
 		 993 aa  287  8e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6606  transposase Tn3 family protein  26.57 
 
 		 993 aa  287  8e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0187013 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5358  transposase Tn3 family protein  24.77 
 
 		 990 aa  286  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17398 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2106  transposase  27.16 
 
 		 1059 aa  280  7e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.818957  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2486  transposase Tn3  25.85 
 
 		 1013 aa  279  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147103  normal  0.0287681 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6852  transposase Tn3 family protein  27.03 
 
 		 994 aa  278  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>