223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1704 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  100 
 
 		 1006 aa  2018    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  49.95 
 
 		 997 aa  909    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5398  transposase Tn3 family protein  41.3 
 
 		 1029 aa  722    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0815937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19600  transposase, TnpA family  41.69 
 
 		 1028 aa  711    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.546457  normal  0.0923144 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  49.05 
 
 		 991 aa  883    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  49.05 
 
 		 991 aa  883    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4723  transposase, Tn3 family  41.73 
 
 		 1075 aa  664    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  52.55 
 
 		 771 aa  618  1e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0079  transposase  60.7 
 
 		 435 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.776565  normal  0.783345 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2347  transposase Tn3  42.03 
 
 		 916 aa  543  1e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.669911  normal  0.26387 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  33.1 
 
 		 988 aa  458  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  33.1 
 
 		 988 aa  458  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  31.9 
 
 		 988 aa  442  9.999999999999999e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  31.56 
 
 		 988 aa  431  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  31.56 
 
 		 988 aa  431  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  31.56 
 
 		 988 aa  431  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  31.56 
 
 		 988 aa  431  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  31.27 
 
 		 989 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  32.14 
 
 		 1015 aa  429  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  31.57 
 
 		 988 aa  426  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  31.36 
 
 		 988 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  31.29 
 
 		 989 aa  423  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  31.15 
 
 		 988 aa  422  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  31.09 
 
 		 988 aa  419  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  31.15 
 
 		 964 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  30.94 
 
 		 988 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  30.94 
 
 		 988 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  31.24 
 
 		 988 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  29.39 
 
 		 987 aa  413  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  31.7 
 
 		 988 aa  416  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  31.26 
 
 		 990 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  31.26 
 
 		 990 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  31.43 
 
 		 990 aa  411  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  31.43 
 
 		 990 aa  411  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  31.43 
 
 		 990 aa  411  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  31.54 
 
 		 990 aa  413  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  31.01 
 
 		 994 aa  411  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  31.01 
 
 		 994 aa  411  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  31.36 
 
 		 990 aa  408  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  28.48 
 
 		 983 aa  403  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  31.58 
 
 		 985 aa  406  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  31.26 
 
 		 994 aa  400  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  32.74 
 
 		 976 aa  394  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  30 
 
 		 988 aa  392  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  30 
 
 		 988 aa  392  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  30 
 
 		 988 aa  392  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3666  transposase Tn3 family protein  33.33 
 
 		 924 aa  377  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376312  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  30.42 
 
 		 991 aa  376  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  30.42 
 
 		 991 aa  376  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  31.57 
 
 		 996 aa  372  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  31.57 
 
 		 996 aa  372  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  31.57 
 
 		 996 aa  372  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  26.54 
 
 		 992 aa  368  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  31.07 
 
 		 996 aa  369  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  28.92 
 
 		 988 aa  365  3e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  31.22 
 
 		 968 aa  365  3e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  30.99 
 
 		 862 aa  362  2e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  28.92 
 
 		 991 aa  347  6e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  29.21 
 
 		 999 aa  342  2.9999999999999998e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  32.5 
 
 		 755 aa  340  9.999999999999999e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  29.77 
 
 		 992 aa  337  5.999999999999999e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  29.77 
 
 		 992 aa  337  5.999999999999999e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4775  transposase Tn3 family protein  52.13 
 
 		 838 aa  329  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.855357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  29.08 
 
 		 961 aa  320  6e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  28.4 
 
 		 983 aa  311  4e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  34.26 
 
 		 606 aa  308  4.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  34.93 
 
 		 550 aa  294  5e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5358  transposase Tn3 family protein  25.4 
 
 		 990 aa  290  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17398 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00623  transposase  25.15 
 
 		 986 aa  285  4.0000000000000003e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  27.5 
 
 		 988 aa  283  1e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  27.5 
 
 		 988 aa  281  3e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1226  transposase Tn3  24.97 
 
 		 993 aa  274  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6606  transposase Tn3 family protein  24.97 
 
 		 993 aa  274  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0187013 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3567  transposase Tn3 family protein  28.16 
 
 		 877 aa  263  8.999999999999999e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0660182  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3698  transposase Tn3 family protein  24.97 
 
 		 974 aa  259  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0861191  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6852  transposase Tn3 family protein  24.53 
 
 		 994 aa  255  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02944  Tn5044 transposase  23.8 
 
 		 990 aa  250  9e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0926862  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0196  transposase  38.81 
 
 		 338 aa  249  1e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3661  transposase Tn3 family protein  26.49 
 
 		 950 aa  250  1e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1822  transposase Tn3 family protein  37.14 
 
 		 371 aa  242  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3676  transposase Tn3 family protein  29.19 
 
 		 772 aa  239  2e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.635368 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5067  transposase Tn3 family protein  24.46 
 
 		 969 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0388929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2106  transposase  24.61 
 
 		 1059 aa  234  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.818957  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4307  transposase Tn3 family protein  21.51 
 
 		 995 aa  230  9e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4363  transposase Tn3 family protein  22.33 
 
 		 995 aa  230  1e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0457124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3715  transposase Tn3 family protein  27.48 
 
 		 731 aa  230  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2512  transposase Tn3  23.41 
 
 		 989 aa  229  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227381  normal  0.0913005 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3695  transposase Tn3 family protein  25.18 
 
 		 969 aa  224  6e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2394  transposase Tn3 family protein  22.94 
 
 		 1007 aa  221  6e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2107  transposase Tn3 family protein  22.94 
 
 		 1007 aa  221  6e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4333  transposase Tn3 family protein  23.68 
 
 		 999 aa  220  8.999999999999998e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0519662 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5050  transposase Tn3 family protein  23.68 
 
 		 999 aa  220  8.999999999999998e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4443  transposase Tn3 family protein  23.68 
 
 		 999 aa  220  8.999999999999998e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.597289  normal  0.3426 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1731  transposase Tn3 family protein  23.68 
 
 		 999 aa  220  8.999999999999998e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.473502  normal  0.357058 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2486  transposase Tn3  23.72 
 
 		 1013 aa  217  9e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147103  normal  0.0287681 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0072  transposase  30.16 
 
 		 546 aa  216  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.520579  normal  0.363066 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2112  transposase Tn3 family protein  26.29 
 
 		 988 aa  215  2.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0025  transposase Tn3 family protein  22.54 
 
 		 1006 aa  214  9e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0079  transposase Tn3 family protein  22.54 
 
 		 1006 aa  214  9e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0203  transposase  24.93 
 
 		 738 aa  213  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000452446 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>