185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00240 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00240  transposase  100 
 
 		 212 aa  436  1e-121  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2512  transposase Tn3  67.24 
 
 		 989 aa  256  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227381  normal  0.0913005 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02944  Tn5044 transposase  64.97 
 
 		 990 aa  240  1e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0926862  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1226  transposase Tn3  64.71 
 
 		 993 aa  237  9e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6606  transposase Tn3 family protein  64.71 
 
 		 993 aa  237  9e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0187013 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6852  transposase Tn3 family protein  63.28 
 
 		 994 aa  229  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4307  transposase Tn3 family protein  60.95 
 
 		 995 aa  218  6e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4363  transposase Tn3 family protein  60.36 
 
 		 995 aa  217  1e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0457124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0079  transposase Tn3 family protein  60.45 
 
 		 1006 aa  215  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0025  transposase Tn3 family protein  60.45 
 
 		 1006 aa  215  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00623  transposase  56.02 
 
 		 986 aa  195  4.0000000000000005e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5358  transposase Tn3 family protein  52.98 
 
 		 990 aa  191  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17398 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2394  transposase Tn3 family protein  50.58 
 
 		 1007 aa  175  6e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2107  transposase Tn3 family protein  50.58 
 
 		 1007 aa  175  6e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35740  putative transposase  50 
 
 		 1004 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000831562  decreased coverage  4.65352e-19 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3065  transposase  50 
 
 		 1004 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2964  Tn4652, transposase  50.6 
 
 		 1004 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0744329 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2106  transposase  50 
 
 		 1059 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.818957  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4134  transposase Tn3 family protein  47.27 
 
 		 1028 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.160281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4443  transposase Tn3 family protein  46.51 
 
 		 999 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.597289  normal  0.3426 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5050  transposase Tn3 family protein  46.51 
 
 		 999 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1731  transposase Tn3 family protein  46.51 
 
 		 999 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.473502  normal  0.357058 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4333  transposase Tn3 family protein  46.51 
 
 		 999 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0519662 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1842  transposase Tn3 family protein  44.19 
 
 		 1012 aa  150  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.550818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2486  transposase Tn3  42.86 
 
 		 1013 aa  141  9e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147103  normal  0.0287681 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0016  Tn5044 putative transposase  57.66 
 
 		 130 aa  137  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000111219  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  40.11 
 
 		 988 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  40.11 
 
 		 988 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1576  transposase  36.96 
 
 		 203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0122395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0035  transposase  36.96 
 
 		 255 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.401081  normal  0.351265 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  36.96 
 
 		 606 aa  114  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  36.41 
 
 		 988 aa  114  7.999999999999999e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  36.41 
 
 		 988 aa  114  7.999999999999999e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  36.96 
 
 		 988 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0150  Tn1721 transposase  36.96 
 
 		 310 aa  114  8.999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.751061 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  36.96 
 
 		 988 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3718  transposase Tn3 family protein  40.51 
 
 		 305 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.396342  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  38.46 
 
 		 988 aa  112  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  37.87 
 
 		 990 aa  112  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  37.87 
 
 		 990 aa  112  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  37.87 
 
 		 990 aa  112  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  37.87 
 
 		 990 aa  112  6e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  37.87 
 
 		 755 aa  111  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  37.87 
 
 		 990 aa  111  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  37.87 
 
 		 990 aa  111  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  37.87 
 
 		 990 aa  110  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  36.72 
 
 		 988 aa  110  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  36.72 
 
 		 988 aa  110  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  36.72 
 
 		 988 aa  110  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  37.87 
 
 		 964 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  38.46 
 
 		 988 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  37.28 
 
 		 988 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  37.28 
 
 		 988 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  37.87 
 
 		 989 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  37.28 
 
 		 988 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  37.28 
 
 		 988 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  37.87 
 
 		 988 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  37.87 
 
 		 988 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  37.87 
 
 		 988 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  38.89 
 
 		 989 aa  108  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  39.16 
 
 		 992 aa  108  6e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  39.16 
 
 		 992 aa  108  6e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2317  transposase Tn3  39.13 
 
 		 339 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000027108  hitchhiker  0.0000324498 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0196  transposase  35.62 
 
 		 338 aa  105  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0202  transposase  35.62 
 
 		 246 aa  105  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.295684  hitchhiker  6.17068e-17 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0239  transposase  35.62 
 
 		 246 aa  104  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0355  transposase  36.09 
 
 		 224 aa  101  8e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  34.38 
 
 		 961 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2047  transposase  33.73 
 
 		 217 aa  100  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5050  TnpA family transposase  33.87 
 
 		 264 aa  100  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0072  transposase  34.38 
 
 		 546 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.520579  normal  0.363066 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  33.14 
 
 		 1015 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  37.43 
 
 		 985 aa  99.8  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  32.93 
 
 		 992 aa  98.6  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  34.32 
 
 		 994 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  34.32 
 
 		 550 aa  97.4  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  34.32 
 
 		 994 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  34.32 
 
 		 862 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  33.53 
 
 		 983 aa  97.4  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2112  transposase Tn3 family protein  31.58 
 
 		 988 aa  97.8  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  34.27 
 
 		 771 aa  96.7  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  32.1 
 
 		 987 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  34.12 
 
 		 997 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1822  transposase Tn3 family protein  32.91 
 
 		 371 aa  95.5  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3347  transposase Tn3  36.67 
 
 		 161 aa  92.8  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0077216  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  32.12 
 
 		 983 aa  92.4  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  32.6 
 
 		 994 aa  92.8  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  34.34 
 
 		 996 aa  92  6e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  35.22 
 
 		 996 aa  91.7  8e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  35.22 
 
 		 996 aa  91.7  8e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  35.22 
 
 		 996 aa  91.7  8e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_24  transposase  34.73 
 
 		 1019 aa  91.3  9e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.207727  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  32.77 
 
 		 991 aa  90.9  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  32.77 
 
 		 991 aa  90.9  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0079  transposase  33.15 
 
 		 435 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.776565  normal  0.783345 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  32.94 
 
 		 1006 aa  89.4  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  33.14 
 
 		 991 aa  89.4  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  33.14 
 
 		 991 aa  89.4  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  30.86 
 
 		 988 aa  88.6  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  30.86 
 
 		 988 aa  88.2  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>