196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_B0035 on replicon NC_011092
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  99.61 
 
 
988 aa  520  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  99.22 
 
 
988 aa  519  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0150  Tn1721 transposase  99.61 
 
 
310 aa  517  1e-146  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.751061 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  99.61 
 
 
606 aa  519  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0035  transposase  100 
 
 
255 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.401081  normal  0.351265 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  94.51 
 
 
988 aa  498  1e-140  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  94.51 
 
 
988 aa  498  1e-140  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  86.27 
 
 
988 aa  451  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  86.27 
 
 
988 aa  451  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  86.27 
 
 
988 aa  451  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  86.67 
 
 
964 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  86.27 
 
 
988 aa  451  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  85.49 
 
 
988 aa  447  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  86.27 
 
 
988 aa  447  1e-125  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  86.8 
 
 
988 aa  449  1e-125  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  85.1 
 
 
988 aa  444  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  85.88 
 
 
988 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  86 
 
 
988 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  86 
 
 
988 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  82.81 
 
 
989 aa  431  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  84.06 
 
 
755 aa  432  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  84.06 
 
 
990 aa  432  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  84.06 
 
 
990 aa  432  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  84.06 
 
 
990 aa  432  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  84.06 
 
 
990 aa  432  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  84.46 
 
 
990 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  84.46 
 
 
990 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  83.67 
 
 
990 aa  430  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  79.45 
 
 
985 aa  417  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  80.48 
 
 
989 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  79.6 
 
 
1015 aa  411  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1576  transposase  99 
 
 
203 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0122395  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  74.12 
 
 
988 aa  399  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  74.12 
 
 
988 aa  399  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  74.12 
 
 
988 aa  399  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3718  transposase Tn3 family protein  76.08 
 
 
305 aa  394  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.396342  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  68.92 
 
 
994 aa  359  2e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  68.92 
 
 
994 aa  359  2e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  68.92 
 
 
862 aa  360  2e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  68.92 
 
 
550 aa  358  5e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  66.53 
 
 
994 aa  347  8e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  57.6 
 
 
992 aa  319  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  56.8 
 
 
992 aa  297  9e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  56.8 
 
 
992 aa  297  9e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2317  transposase Tn3  87.43 
 
 
339 aa  293  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000027108  hitchhiker  0.0000324498 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  58.27 
 
 
996 aa  290  1e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0196  transposase  52.38 
 
 
338 aa  288  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  57.87 
 
 
996 aa  288  6e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  57.87 
 
 
996 aa  288  6e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  57.87 
 
 
996 aa  288  6e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  52.99 
 
 
987 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1822  transposase Tn3 family protein  53.39 
 
 
371 aa  280  1e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0202  transposase  51.42 
 
 
246 aa  280  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.295684  hitchhiker  6.17068e-17 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5050  TnpA family transposase  86.83 
 
 
264 aa  280  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0239  transposase  51.42 
 
 
246 aa  279  4e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  55.12 
 
 
991 aa  278  7e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  55.12 
 
 
991 aa  278  7e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  53.78 
 
 
983 aa  276  3e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  52.76 
 
 
988 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  52.76 
 
 
988 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  53.15 
 
 
991 aa  272  3e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  52.4 
 
 
988 aa  272  5.000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3347  transposase Tn3  87.18 
 
 
161 aa  270  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0077216  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  53.36 
 
 
999 aa  268  5e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0355  transposase  65.2 
 
 
224 aa  265  5e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  54.89 
 
 
961 aa  259  3e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0072  transposase  54.89 
 
 
546 aa  259  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.520579  normal  0.363066 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  50.39 
 
 
983 aa  241  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4311  TOBE domain-containing protein  52.08 
 
 
573 aa  240  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3676  transposase Tn3 family protein  49.36 
 
 
772 aa  228  9e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.635368 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2047  transposase  46.61 
 
 
217 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8035  transposase  55.17 
 
 
179 aa  196  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3995  Tn3 family transposase  71.55 
 
 
126 aa  181  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1277  Tn3 family transposase  71.55 
 
 
126 aa  181  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3243  Tn3 family transposase  71.55 
 
 
126 aa  181  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.744119  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  40.87 
 
 
997 aa  176  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  40 
 
 
1006 aa  175  8e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  37.75 
 
 
771 aa  172  5e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0079  transposase  37.2 
 
 
435 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.776565  normal  0.783345 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3666  transposase Tn3 family protein  42.22 
 
 
924 aa  167  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376312  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  42.22 
 
 
976 aa  167  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2512  transposase Tn3  36.03 
 
 
989 aa  162  4.0000000000000004e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227381  normal  0.0913005 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3567  transposase Tn3 family protein  53.57 
 
 
877 aa  158  7e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0660182  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5398  transposase Tn3 family protein  38 
 
 
1029 aa  158  9e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0815937  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5358  transposase Tn3 family protein  36.05 
 
 
990 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17398 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00623  transposase  36.75 
 
 
986 aa  152  4e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  36.08 
 
 
991 aa  152  5e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  36.08 
 
 
991 aa  152  5e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1226  transposase Tn3  35.9 
 
 
993 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6606  transposase Tn3 family protein  35.9 
 
 
993 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0187013 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6852  transposase Tn3 family protein  35.74 
 
 
994 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02944  Tn5044 transposase  37.18 
 
 
990 aa  149  5e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0926862  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4775  transposase Tn3 family protein  36.9 
 
 
838 aa  145  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.855357  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4443  transposase Tn3 family protein  35.9 
 
 
999 aa  142  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.597289  normal  0.3426 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4333  transposase Tn3 family protein  35.9 
 
 
999 aa  142  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0519662 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1731  transposase Tn3 family protein  35.9 
 
 
999 aa  142  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.473502  normal  0.357058 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5050  transposase Tn3 family protein  35.9 
 
 
999 aa  142  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2106  transposase  34.57 
 
 
1059 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.818957  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_24  transposase  35.98 
 
 
1019 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.207727  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4556  transposase Tn3 family protein  36.07 
 
 
1028 aa  139  6e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.875652 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>