193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C1576 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C1576  transposase  100 
 
 
203 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0122395  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  99 
 
 
988 aa  406  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  98.51 
 
 
988 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0150  Tn1721 transposase  99 
 
 
310 aa  403  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.751061 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  99 
 
 
606 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0035  transposase  99 
 
 
255 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.401081  normal  0.351265 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  93.5 
 
 
988 aa  387  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  93.5 
 
 
988 aa  387  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  85.79 
 
 
964 aa  342  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  85.28 
 
 
988 aa  341  5e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  85.28 
 
 
988 aa  341  5e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  85.28 
 
 
988 aa  341  5e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  85.28 
 
 
988 aa  341  5e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  86.39 
 
 
988 aa  338  2.9999999999999998e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  84.69 
 
 
988 aa  337  9e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  85.28 
 
 
988 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  84.77 
 
 
988 aa  336  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  84.18 
 
 
988 aa  333  1e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  85.34 
 
 
988 aa  332  2e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  85.34 
 
 
988 aa  332  2e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  83.94 
 
 
755 aa  326  1.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  83.94 
 
 
990 aa  325  2.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  83.94 
 
 
990 aa  325  2.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  83.94 
 
 
990 aa  325  2.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  83.94 
 
 
990 aa  326  2.0000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  82.23 
 
 
989 aa  324  6e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  83.42 
 
 
990 aa  324  6e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  83.42 
 
 
990 aa  324  6e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  83.42 
 
 
990 aa  323  8.000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  77.55 
 
 
985 aa  313  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  76.92 
 
 
1015 aa  309  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  74.74 
 
 
988 aa  304  6e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  74.74 
 
 
988 aa  304  6e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  74.74 
 
 
988 aa  304  6e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  78.12 
 
 
989 aa  303  9.000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2317  transposase Tn3  87.43 
 
 
339 aa  295  5e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000027108  hitchhiker  0.0000324498 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3718  transposase Tn3 family protein  73.47 
 
 
305 aa  290  1e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.396342  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5050  TnpA family transposase  86.83 
 
 
264 aa  280  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  68.23 
 
 
862 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  68.23 
 
 
994 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  68.23 
 
 
994 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  68.23 
 
 
550 aa  272  3e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3347  transposase Tn3  87.18 
 
 
161 aa  270  9e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0077216  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0355  transposase  67.86 
 
 
224 aa  264  5e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  64.32 
 
 
994 aa  261  6.999999999999999e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  58.12 
 
 
992 aa  242  3e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  60.82 
 
 
996 aa  241  6e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  60.31 
 
 
996 aa  238  4e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  60.31 
 
 
996 aa  238  4e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  60.31 
 
 
996 aa  238  4e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  56.19 
 
 
992 aa  227  9e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  56.19 
 
 
992 aa  227  9e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  56.85 
 
 
991 aa  221  4.9999999999999996e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  56.85 
 
 
991 aa  221  4.9999999999999996e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  55.84 
 
 
991 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  55.1 
 
 
999 aa  214  7e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  53.19 
 
 
988 aa  211  7e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  52.31 
 
 
988 aa  209  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  52.31 
 
 
988 aa  209  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1822  transposase Tn3 family protein  50.26 
 
 
371 aa  207  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0202  transposase  48.7 
 
 
246 aa  204  9e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.295684  hitchhiker  6.17068e-17 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0196  transposase  48.7 
 
 
338 aa  203  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0239  transposase  48.7 
 
 
246 aa  203  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  56.07 
 
 
961 aa  197  7e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0072  transposase  56.07 
 
 
546 aa  197  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.520579  normal  0.363066 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  53.06 
 
 
983 aa  196  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8035  transposase  55.17 
 
 
179 aa  196  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  48.97 
 
 
983 aa  192  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  46.15 
 
 
987 aa  192  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2047  transposase  47.45 
 
 
217 aa  192  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3995  Tn3 family transposase  71.55 
 
 
126 aa  181  9.000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1277  Tn3 family transposase  71.55 
 
 
126 aa  181  9.000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3243  Tn3 family transposase  71.55 
 
 
126 aa  181  9.000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.744119  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4311  TOBE domain-containing protein  51.69 
 
 
573 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3676  transposase Tn3 family protein  49.13 
 
 
772 aa  166  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.635368 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  43.52 
 
 
997 aa  141  6e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  41.33 
 
 
1006 aa  139  3e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  36.98 
 
 
771 aa  132  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0079  transposase  36.65 
 
 
435 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.776565  normal  0.783345 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2512  transposase Tn3  37.23 
 
 
989 aa  128  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227381  normal  0.0913005 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3666  transposase Tn3 family protein  43.21 
 
 
924 aa  127  8.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376312  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  43.21 
 
 
976 aa  127  9.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4366  TnpA family transposase  51.79 
 
 
112 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.914851 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1226  transposase Tn3  41.51 
 
 
993 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6606  transposase Tn3 family protein  41.51 
 
 
993 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0187013 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  37.76 
 
 
991 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  37.76 
 
 
991 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02944  Tn5044 transposase  37.85 
 
 
990 aa  117  9e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0926862  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5398  transposase Tn3 family protein  38.59 
 
 
1029 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0815937  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00240  transposase  36.96 
 
 
212 aa  115  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6852  transposase Tn3 family protein  35.71 
 
 
994 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5358  transposase Tn3 family protein  34.86 
 
 
990 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17398 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00623  transposase  35.43 
 
 
986 aa  112  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4775  transposase Tn3 family protein  37.31 
 
 
838 aa  112  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.855357  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2106  transposase  35.33 
 
 
1059 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.818957  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4556  transposase Tn3 family protein  37.72 
 
 
1028 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.875652 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0192  transposase Tn3 family protein  37.72 
 
 
1026 aa  109  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1989  transposase Tn3 family protein  37.72 
 
 
1026 aa  109  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3470  transposase Tn3 family protein  37.72 
 
 
1028 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19600  transposase, TnpA family  36.9 
 
 
1028 aa  108  6e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.546457  normal  0.0923144 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>