198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1989 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011885  Cyan7425_0116  transposase Tn3 family protein  45.71 
 
 
1018 aa  940    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3470  transposase Tn3 family protein  99.32 
 
 
1028 aa  2125    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0215  transposase  46.53 
 
 
1015 aa  948    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal  0.20757 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4556  transposase Tn3 family protein  98.63 
 
 
1028 aa  2110    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.875652 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0192  transposase Tn3 family protein  100 
 
 
1026 aa  2137    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1962  transposase Tn3 family protein  61.3 
 
 
929 aa  1195    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1989  transposase Tn3 family protein  100 
 
 
1026 aa  2137    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4478  transposase Tn3 family protein  35.45 
 
 
1009 aa  625  1e-177  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000650614 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1476  transposase Tn3 family protein  35.45 
 
 
1009 aa  625  1e-177  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000034033 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5340  transposase  35.45 
 
 
1009 aa  625  1e-177  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1851  transposase Tn3 family protein  35.45 
 
 
1009 aa  625  1e-177  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000277691 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6457  transposase Tn3  34.85 
 
 
1008 aa  621  1e-176  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4490  transposase Tn3 family protein  34.5 
 
 
1010 aa  611  1e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.666147  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4353  transposase Tn3 family protein  34.5 
 
 
1010 aa  611  1e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3466  transposase Tn3 family protein  33.86 
 
 
992 aa  531  1e-149  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4112  transposase Tn3 family protein  32.9 
 
 
1006 aa  524  1e-147  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0051  hypothetical protein  30.75 
 
 
1015 aa  466  1e-129  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.107009  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3469  transposase Tn3 family protein  31.31 
 
 
883 aa  381  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02953  Transposase Tn3  30.84 
 
 
831 aa  377  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.225091  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1970  TnpA family transposase  26.37 
 
 
1020 aa  294  6e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02020  transposase  24.56 
 
 
1019 aa  270  8.999999999999999e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_24  transposase  24.61 
 
 
1019 aa  256  1.0000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.207727  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  31.05 
 
 
996 aa  240  8e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01406  Transposase Tn3  44.74 
 
 
267 aa  239  2e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  31.2 
 
 
994 aa  234  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  31.2 
 
 
994 aa  234  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  31.24 
 
 
862 aa  233  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  28.91 
 
 
983 aa  229  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  29.55 
 
 
987 aa  228  4e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  30.89 
 
 
996 aa  224  8e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  30.89 
 
 
996 aa  224  8e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  30.89 
 
 
996 aa  224  8e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  25.96 
 
 
990 aa  221  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  25.96 
 
 
990 aa  221  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  27.96 
 
 
988 aa  220  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  27.96 
 
 
988 aa  220  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  27.96 
 
 
988 aa  220  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  32.46 
 
 
550 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  31.02 
 
 
994 aa  219  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6928  transposase Tn3 family protein  23.39 
 
 
1027 aa  219  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  30.11 
 
 
989 aa  218  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  25.26 
 
 
1015 aa  218  4e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  28.45 
 
 
990 aa  217  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  28.45 
 
 
990 aa  217  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  28.45 
 
 
990 aa  217  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  26.01 
 
 
990 aa  216  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  28.39 
 
 
755 aa  215  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  30.07 
 
 
988 aa  215  3.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  25.76 
 
 
990 aa  215  3.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  29.92 
 
 
988 aa  214  7.999999999999999e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  30.19 
 
 
988 aa  214  9e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  30.19 
 
 
988 aa  214  9e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  30.19 
 
 
988 aa  214  9e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  30.19 
 
 
988 aa  214  9e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  30.74 
 
 
988 aa  213  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  31.1 
 
 
988 aa  213  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  31.1 
 
 
988 aa  213  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  30.74 
 
 
988 aa  213  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  25.07 
 
 
985 aa  213  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  28.27 
 
 
988 aa  211  5e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  31.98 
 
 
988 aa  211  5e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  29.79 
 
 
988 aa  211  6e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  28.53 
 
 
988 aa  211  8e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  28.53 
 
 
988 aa  211  8e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  29.6 
 
 
968 aa  209  3e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  30.03 
 
 
964 aa  209  3e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  31.5 
 
 
988 aa  209  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  31.4 
 
 
606 aa  207  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  29.32 
 
 
988 aa  206  1e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  29.69 
 
 
988 aa  204  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  29.47 
 
 
961 aa  204  9e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  24.46 
 
 
992 aa  202  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  24.86 
 
 
976 aa  202  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  25.36 
 
 
989 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3666  transposase Tn3 family protein  25.15 
 
 
924 aa  201  7e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376312  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  23.23 
 
 
997 aa  196  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  28.83 
 
 
991 aa  195  4e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  28.83 
 
 
991 aa  195  4e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  24.38 
 
 
1006 aa  194  6e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0072  transposase  30.5 
 
 
546 aa  194  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.520579  normal  0.363066 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  26.54 
 
 
991 aa  193  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  27.56 
 
 
983 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  27.08 
 
 
999 aa  189  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4311  TOBE domain-containing protein  28.49 
 
 
573 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3676  transposase Tn3 family protein  27.6 
 
 
772 aa  174  5.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.635368 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  26.03 
 
 
771 aa  173  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  26.83 
 
 
992 aa  169  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  26.83 
 
 
992 aa  169  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4723  transposase, Tn3 family  26.68 
 
 
1075 aa  167  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0196  transposase  32.64 
 
 
338 aa  165  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3567  transposase Tn3 family protein  30.81 
 
 
877 aa  165  4.0000000000000004e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0660182  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5398  transposase Tn3 family protein  27.7 
 
 
1029 aa  164  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0815937  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  21.19 
 
 
991 aa  162  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  21.19 
 
 
991 aa  162  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1822  transposase Tn3 family protein  30.3 
 
 
371 aa  162  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0079  transposase  28.12 
 
 
435 aa  162  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.776565  normal  0.783345 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3718  transposase Tn3 family protein  35.69 
 
 
305 aa  150  9e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.396342  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4770  Tn5044 transposase  41.24 
 
 
188 aa  150  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.653954 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0150  Tn1721 transposase  34.91 
 
 
310 aa  150  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.751061 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3479  Tn5044 transposase  46.98 
 
 
156 aa  149  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>