203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4311 on replicon NC_009431
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  68.19 
 
 		 961 aa  788    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0072  transposase  69.88 
 
 		 546 aa  726    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.520579  normal  0.363066 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3676  transposase Tn3 family protein  78.27 
 
 		 772 aa  898    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.635368 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4311  TOBE domain-containing protein  100 
 
 		 573 aa  1151    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  44.01 
 
 		 1015 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  43.03 
 
 		 988 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  43.5 
 
 		 988 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  42.69 
 
 		 988 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  42.46 
 
 		 988 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  42.46 
 
 		 988 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  42.46 
 
 		 988 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  42.17 
 
 		 988 aa  447  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  42.17 
 
 		 988 aa  447  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  42.46 
 
 		 988 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  42.17 
 
 		 988 aa  445  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  42.17 
 
 		 988 aa  445  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  42.69 
 
 		 988 aa  445  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  42.46 
 
 		 988 aa  444  1e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  44.1 
 
 		 606 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  42.41 
 
 		 988 aa  442  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  41.67 
 
 		 985 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  42.11 
 
 		 964 aa  437  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  41.87 
 
 		 989 aa  434  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  41.94 
 
 		 988 aa  435  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  41.95 
 
 		 755 aa  432  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  42.63 
 
 		 988 aa  432  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  42.63 
 
 		 988 aa  432  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  42.63 
 
 		 988 aa  432  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  41.72 
 
 		 990 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  41.78 
 
 		 990 aa  429  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  41.95 
 
 		 990 aa  431  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  41.95 
 
 		 990 aa  431  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  41.95 
 
 		 990 aa  431  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  41.95 
 
 		 990 aa  431  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  41.72 
 
 		 990 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  41.4 
 
 		 989 aa  423  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  41.18 
 
 		 988 aa  419  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  41.18 
 
 		 988 aa  421  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  43.99 
 
 		 996 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  44.18 
 
 		 996 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  44.18 
 
 		 996 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  44.18 
 
 		 996 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  34.27 
 
 		 992 aa  403  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  40.66 
 
 		 988 aa  401  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  39.51 
 
 		 994 aa  397  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  39.18 
 
 		 999 aa  392  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  40.69 
 
 		 994 aa  392  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  40.69 
 
 		 994 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  40.69 
 
 		 862 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  41.65 
 
 		 550 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  38.43 
 
 		 991 aa  383  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  41.44 
 
 		 991 aa  382  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  41.44 
 
 		 991 aa  382  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  37.24 
 
 		 983 aa  374  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  41.51 
 
 		 992 aa  373  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  41.51 
 
 		 992 aa  373  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  35.12 
 
 		 987 aa  348  1e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3567  transposase Tn3 family protein  39.71 
 
 		 877 aa  331  2e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0660182  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  39.2 
 
 		 983 aa  330  4e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3718  transposase Tn3 family protein  53.11 
 
 		 305 aa  290  3e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.396342  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0150  Tn1721 transposase  48.1 
 
 		 310 aa  274  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.751061 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0196  transposase  40.37 
 
 		 338 aa  259  9e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0035  transposase  52.08 
 
 		 255 aa  240  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.401081  normal  0.351265 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1822  transposase Tn3 family protein  35.57 
 
 		 371 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  33.39 
 
 		 976 aa  229  9e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3666  transposase Tn3 family protein  33.39 
 
 		 924 aa  229  1e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376312  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  30.32 
 
 		 771 aa  228  2e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  34.5 
 
 		 968 aa  228  3e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  30.38 
 
 		 1006 aa  216  7e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0358  transposase Tn3 family protein  41.48 
 
 		 273 aa  206  8e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0202  transposase  42.61 
 
 		 246 aa  206  9e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.295684  hitchhiker  6.17068e-17 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0239  transposase  42.61 
 
 		 246 aa  206  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  30.44 
 
 		 997 aa  206  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0079  transposase  31.26 
 
 		 435 aa  200  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.776565  normal  0.783345 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  28.94 
 
 		 991 aa  197  5.000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  28.94 
 
 		 991 aa  197  5.000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3470  transposase Tn3 family protein  28.68 
 
 		 1028 aa  182  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0192  transposase Tn3 family protein  28.68 
 
 		 1026 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1989  transposase Tn3 family protein  28.68 
 
 		 1026 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4556  transposase Tn3 family protein  28.49 
 
 		 1028 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.875652 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1323  transposase Tn3 family protein  27.78 
 
 		 989 aa  179  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.32373 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1576  transposase  51.69 
 
 		 203 aa  177  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0122395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5398  transposase Tn3 family protein  30.02 
 
 		 1029 aa  176  7e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0815937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5358  transposase Tn3 family protein  26.58 
 
 		 990 aa  176  9e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17398 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00623  transposase  26.28 
 
 		 986 aa  175  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1962  transposase Tn3 family protein  28.27 
 
 		 929 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2512  transposase Tn3  26.77 
 
 		 989 aa  173  5.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227381  normal  0.0913005 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4723  transposase, Tn3 family  29.13 
 
 		 1075 aa  170  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4366  TnpA family transposase  69.64 
 
 		 112 aa  170  7e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.914851 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3715  transposase Tn3 family protein  34.45 
 
 		 731 aa  169  9e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2047  transposase  41.79 
 
 		 217 aa  169  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2470  transposase Tn3  26.97 
 
 		 977 aa  167  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0197511 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0355  transposase  51.88 
 
 		 224 aa  165  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02944  Tn5044 transposase  26.6 
 
 		 990 aa  164  4.0000000000000004e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0926862  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0116  transposase Tn3 family protein  25.79 
 
 		 1018 aa  163  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0069  TnpA family transposase  26.55 
 
 		 946 aa  163  8.000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.724381  hitchhiker  0.00503767 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0570  TnpA family transposase  26.55 
 
 		 946 aa  163  8.000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0569559 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0418  TnpA family transposase  26.55 
 
 		 969 aa  163  9e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.524573  normal  0.229677 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0454  TnpA family transposase  26.55 
 
 		 969 aa  163  9e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0489  TnpA family transposase  26.55 
 
 		 969 aa  163  9e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.384834  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>