190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3347 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3347  transposase Tn3  100 
 
 
161 aa  322  1e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0077216  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  95.65 
 
 
989 aa  317  3.9999999999999996e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  95.65 
 
 
988 aa  317  5e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  95.65 
 
 
988 aa  317  5e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  95.65 
 
 
988 aa  317  5e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  95.65 
 
 
988 aa  317  5e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5050  TnpA family transposase  98.14 
 
 
264 aa  316  7e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  95.65 
 
 
964 aa  316  7.999999999999999e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  94.41 
 
 
988 aa  312  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  94.41 
 
 
988 aa  310  4.999999999999999e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  93.17 
 
 
988 aa  309  1e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  93.17 
 
 
988 aa  309  1e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  93.79 
 
 
990 aa  308  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  93.79 
 
 
990 aa  308  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  93.79 
 
 
988 aa  307  2.9999999999999997e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2317  transposase Tn3  93.79 
 
 
339 aa  307  4e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000027108  hitchhiker  0.0000324498 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  94.38 
 
 
988 aa  307  4e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  92.55 
 
 
755 aa  304  3e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  92.55 
 
 
990 aa  304  4.0000000000000004e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  92.55 
 
 
990 aa  304  4.0000000000000004e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  92.55 
 
 
990 aa  304  4.0000000000000004e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  92.55 
 
 
990 aa  304  4.0000000000000004e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  91.93 
 
 
988 aa  302  1.0000000000000001e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  91.93 
 
 
990 aa  301  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  86.96 
 
 
989 aa  285  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  87.18 
 
 
988 aa  273  6e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  87.18 
 
 
988 aa  273  6e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  87.18 
 
 
606 aa  272  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0150  Tn1721 transposase  87.18 
 
 
310 aa  271  3e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.751061 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1576  transposase  87.18 
 
 
203 aa  270  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0122395  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0035  transposase  87.18 
 
 
255 aa  270  8.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.401081  normal  0.351265 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  85.26 
 
 
988 aa  269  1e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  85.26 
 
 
988 aa  269  1e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  83.02 
 
 
1015 aa  269  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  80.25 
 
 
985 aa  251  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3718  transposase Tn3 family protein  79.75 
 
 
305 aa  251  4.0000000000000004e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.396342  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  73.91 
 
 
988 aa  244  4e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  73.91 
 
 
988 aa  244  4e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  73.91 
 
 
988 aa  244  4e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  68.35 
 
 
862 aa  228  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  68.35 
 
 
994 aa  228  3e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  69.23 
 
 
994 aa  228  3e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  68.35 
 
 
550 aa  227  5e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0355  transposase  70.7 
 
 
224 aa  227  6e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  67.95 
 
 
994 aa  221  4e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  58.97 
 
 
992 aa  202  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  60.25 
 
 
996 aa  192  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  60 
 
 
996 aa  190  8e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  60 
 
 
996 aa  190  8e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  60 
 
 
996 aa  190  8e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  60.26 
 
 
992 aa  187  4e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  60.26 
 
 
992 aa  187  4e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  59.46 
 
 
988 aa  180  6e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  58.33 
 
 
991 aa  180  6e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  59.46 
 
 
988 aa  180  7e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3995  Tn3 family transposase  68.6 
 
 
126 aa  179  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1277  Tn3 family transposase  68.6 
 
 
126 aa  179  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3243  Tn3 family transposase  68.6 
 
 
126 aa  179  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.744119  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  58.82 
 
 
991 aa  178  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  58.82 
 
 
991 aa  178  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  58.23 
 
 
983 aa  175  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  57.05 
 
 
999 aa  175  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  54.9 
 
 
988 aa  174  5e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1822  transposase Tn3 family protein  49.69 
 
 
371 aa  169  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0196  transposase  50.64 
 
 
338 aa  168  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0202  transposase  50.64 
 
 
246 aa  168  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.295684  hitchhiker  6.17068e-17 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0239  transposase  50.64 
 
 
246 aa  167  4e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  57.97 
 
 
961 aa  166  9e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0072  transposase  57.97 
 
 
546 aa  166  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.520579  normal  0.363066 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  48.75 
 
 
987 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  50.64 
 
 
983 aa  161  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8035  transposase  51.61 
 
 
179 aa  160  7e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2047  transposase  48.08 
 
 
217 aa  159  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4311  TOBE domain-containing protein  54.11 
 
 
573 aa  155  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3676  transposase Tn3 family protein  53.9 
 
 
772 aa  147  6e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.635368 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4366  TnpA family transposase  50.89 
 
 
112 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.914851 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0079  transposase  39.74 
 
 
435 aa  118  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.776565  normal  0.783345 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  40.52 
 
 
771 aa  114  6.9999999999999995e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  42.31 
 
 
997 aa  111  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  41.03 
 
 
1006 aa  108  4.0000000000000004e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3666  transposase Tn3 family protein  46.83 
 
 
924 aa  106  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376312  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1226  transposase Tn3  39.75 
 
 
993 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6606  transposase Tn3 family protein  39.75 
 
 
993 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0187013 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  46.83 
 
 
976 aa  106  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2512  transposase Tn3  38.85 
 
 
989 aa  101  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227381  normal  0.0913005 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3470  transposase Tn3 family protein  38.93 
 
 
1028 aa  98.6  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4556  transposase Tn3 family protein  38.93 
 
 
1028 aa  99  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.875652 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0192  transposase Tn3 family protein  38.93 
 
 
1026 aa  99  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1989  transposase Tn3 family protein  38.93 
 
 
1026 aa  99  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00240  transposase  36.67 
 
 
212 aa  92.8  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  37.33 
 
 
991 aa  92  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  37.33 
 
 
991 aa  92  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02944  Tn5044 transposase  35.14 
 
 
990 aa  90.5  8e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0926862  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6852  transposase Tn3 family protein  37.59 
 
 
994 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_24  transposase  37.41 
 
 
1019 aa  88.6  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.207727  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4723  transposase, Tn3 family  37.91 
 
 
1075 aa  88.2  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5358  transposase Tn3 family protein  34.29 
 
 
990 aa  87.4  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17398 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5398  transposase Tn3 family protein  37.18 
 
 
1029 aa  86.7  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0815937  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00623  transposase  36.43 
 
 
986 aa  85.9  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1962  transposase Tn3 family protein  33.56 
 
 
929 aa  84  9e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>