198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1962 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009998  Sbal195_4556  transposase Tn3 family protein  61.01 
 
 
1028 aa  1184    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.875652 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3470  transposase Tn3 family protein  61.3 
 
 
1028 aa  1182    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0215  transposase  45.46 
 
 
1015 aa  833    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal  0.20757 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0116  transposase Tn3 family protein  45.36 
 
 
1018 aa  852    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0192  transposase Tn3 family protein  61.3 
 
 
1026 aa  1182    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1962  transposase Tn3 family protein  100 
 
 
929 aa  1927    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1989  transposase Tn3 family protein  61.3 
 
 
1026 aa  1182    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5340  transposase  33.88 
 
 
1009 aa  538  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6457  transposase Tn3  34.15 
 
 
1008 aa  536  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1851  transposase Tn3 family protein  33.88 
 
 
1009 aa  538  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000277691 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1476  transposase Tn3 family protein  33.88 
 
 
1009 aa  538  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000034033 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4478  transposase Tn3 family protein  33.88 
 
 
1009 aa  538  1e-151  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000650614 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4490  transposase Tn3 family protein  33.37 
 
 
1010 aa  525  1e-147  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.666147  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4353  transposase Tn3 family protein  33.37 
 
 
1010 aa  525  1e-147  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3466  transposase Tn3 family protein  34.32 
 
 
992 aa  503  1e-141  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4112  transposase Tn3 family protein  33.7 
 
 
1006 aa  496  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0051  hypothetical protein  29.83 
 
 
1015 aa  398  1e-109  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.107009  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02953  Transposase Tn3  31.8 
 
 
831 aa  356  1e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.225091  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3469  transposase Tn3 family protein  31.52 
 
 
883 aa  352  2e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1970  TnpA family transposase  25.54 
 
 
1020 aa  270  8.999999999999999e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02020  transposase  25.75 
 
 
1019 aa  253  1e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  25.49 
 
 
983 aa  243  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_24  transposase  24.2 
 
 
1019 aa  242  2.9999999999999997e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.207727  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01406  Transposase Tn3  45.08 
 
 
267 aa  229  2e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  26.1 
 
 
968 aa  228  5.0000000000000005e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  25 
 
 
987 aa  226  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6928  transposase Tn3 family protein  24.92 
 
 
1027 aa  221  3.9999999999999997e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  29.24 
 
 
996 aa  217  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  25.08 
 
 
994 aa  213  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  25.08 
 
 
994 aa  213  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  26.98 
 
 
862 aa  212  3e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  24.53 
 
 
992 aa  210  8e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  29.25 
 
 
996 aa  206  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  29.25 
 
 
996 aa  206  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  29.25 
 
 
996 aa  206  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  30.78 
 
 
550 aa  204  5e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  25.26 
 
 
1015 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  28.6 
 
 
988 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  28.55 
 
 
988 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  24.51 
 
 
976 aa  201  5e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  25.11 
 
 
990 aa  200  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3666  transposase Tn3 family protein  24.85 
 
 
924 aa  199  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376312  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  25.11 
 
 
990 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  25.11 
 
 
990 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  25.11 
 
 
990 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  25.66 
 
 
994 aa  199  2.0000000000000003e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  25.11 
 
 
990 aa  198  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  25.34 
 
 
988 aa  196  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  24.83 
 
 
988 aa  196  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  24.92 
 
 
985 aa  195  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  25.16 
 
 
988 aa  193  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  29.87 
 
 
988 aa  193  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  29.87 
 
 
988 aa  193  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  29.87 
 
 
988 aa  193  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  24.97 
 
 
989 aa  192  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  24.63 
 
 
964 aa  192  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  27.3 
 
 
755 aa  192  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  24.74 
 
 
988 aa  191  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  24.07 
 
 
988 aa  190  8e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  24.77 
 
 
990 aa  190  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  24.77 
 
 
990 aa  190  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  30.76 
 
 
988 aa  189  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  30.76 
 
 
988 aa  189  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  24.34 
 
 
988 aa  189  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  24.34 
 
 
988 aa  189  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  22.52 
 
 
1006 aa  187  7e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  24.24 
 
 
988 aa  187  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  24.24 
 
 
988 aa  187  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  24.24 
 
 
988 aa  187  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  30.07 
 
 
988 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  30.07 
 
 
988 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  24.24 
 
 
988 aa  187  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  24.75 
 
 
983 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  29.09 
 
 
961 aa  185  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  30.69 
 
 
606 aa  185  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  26.64 
 
 
988 aa  186  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  23.29 
 
 
997 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  30.22 
 
 
989 aa  183  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0072  transposase  31.28 
 
 
546 aa  179  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.520579  normal  0.363066 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  27.03 
 
 
999 aa  174  5e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  26.21 
 
 
991 aa  174  7.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  26.21 
 
 
991 aa  174  7.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5398  transposase Tn3 family protein  26.08 
 
 
1029 aa  172  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0815937  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4311  TOBE domain-containing protein  27.86 
 
 
573 aa  171  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3567  transposase Tn3 family protein  30.46 
 
 
877 aa  171  5e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0660182  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  26.88 
 
 
991 aa  170  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3676  transposase Tn3 family protein  27.73 
 
 
772 aa  162  3e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.635368 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  21.83 
 
 
991 aa  161  5e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  21.83 
 
 
991 aa  161  5e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5358  transposase Tn3 family protein  22.98 
 
 
990 aa  158  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17398 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  24.57 
 
 
771 aa  154  8e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1822  transposase Tn3 family protein  29.27 
 
 
371 aa  153  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0079  transposase  26.29 
 
 
435 aa  153  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.776565  normal  0.783345 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0196  transposase  30.74 
 
 
338 aa  149  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  26 
 
 
992 aa  149  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4770  Tn5044 transposase  40.98 
 
 
188 aa  149  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.653954 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  26 
 
 
992 aa  149  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3479  Tn5044 transposase  46.1 
 
 
156 aa  147  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3698  transposase Tn3 family protein  21 
 
 
974 aa  145  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0861191  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02954  transposase  44.81 
 
 
156 aa  141  4.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0191401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>