193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0489 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0645  transposase Tn3 family protein  71.86 
 
 		 970 aa  1392    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0794164 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6491  transposase Tn3  71.27 
 
 		 971 aa  1391    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114145  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5786  transposase Tn3 family protein  74.22 
 
 		 766 aa  1093    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6590  transposase Tn3  48.09 
 
 		 978 aa  857    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5280  transposase Tn3 family protein  38.7 
 
 		 977 aa  640    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7306  transposase Tn3 family protein  47.9 
 
 		 980 aa  853    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045557 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2470  transposase Tn3  38.83 
 
 		 977 aa  651    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0197511 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1639  transposase Tn3 family protein  38.7 
 
 		 977 aa  640    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0647401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5545  transposase Tn3  43.93 
 
 		 845 aa  652    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.288068 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1179  transposase  71.16 
 
 		 971 aa  1390    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1202  transposase Tn3  71.16 
 
 		 971 aa  1390    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.773919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6212  transposase Tn3  48.05 
 
 		 979 aa  843    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1491  transposase Tn3  71.27 
 
 		 971 aa  1391    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.200798  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1506  transposase Tn3  71.27 
 
 		 971 aa  1391    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0432891  hitchhiker  0.006326 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1544  transposase Tn3  71.27 
 
 		 971 aa  1391    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.121615  normal  0.953447 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5146  transposase Tn3 family protein  71.27 
 
 		 971 aa  1391    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.427024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5683  transposase Tn3 family protein  48.45 
 
 		 979 aa  863    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.145306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6617  transposase Tn3 family protein  64.24 
 
 		 633 aa  778    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4228  transposase Tn3 family protein  71.16 
 
 		 971 aa  1390    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.260644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4279  transposase Tn3 family protein  64.9 
 
 		 799 aa  791    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0330145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4288  transposase Tn3 family protein  71.27 
 
 		 971 aa  1391    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2241  transposase Tn3 family protein  71.27 
 
 		 971 aa  1391    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.86312  normal  0.995044 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3007  transposase Tn3 family protein  71.16 
 
 		 971 aa  1390    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3044  transposase Tn3 family protein  71.16 
 
 		 971 aa  1390    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0069  TnpA family transposase  99.89 
 
 		 946 aa  1860    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.724381  hitchhiker  0.00503767 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0418  TnpA family transposase  100 
 
 		 969 aa  1932    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.524573  normal  0.229677 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0454  TnpA family transposase  100 
 
 		 969 aa  1932    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0489  TnpA family transposase  100 
 
 		 969 aa  1932    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.384834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0570  TnpA family transposase  99.89 
 
 		 946 aa  1860    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0569559 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5798  transposase Tn3 family protein  47.34 
 
 		 928 aa  805    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0684485 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5075  transposase Tn3 family protein  38.56 
 
 		 972 aa  607  9.999999999999999e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1323  transposase Tn3 family protein  38.47 
 
 		 989 aa  593  1e-168  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.32373 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1853  transposase Tn3 family protein  35.07 
 
 		 762 aa  379  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.713988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5784  IS1071, transposase  61.83 
 
 		 247 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.978933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  24.12 
 
 		 987 aa  251  5e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  23.52 
 
 		 983 aa  229  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  24.57 
 
 		 988 aa  224  7e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  24.57 
 
 		 988 aa  224  7e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  24.4 
 
 		 1015 aa  213  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  21.58 
 
 		 992 aa  212  3e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  24.72 
 
 		 988 aa  210  8e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  23.33 
 
 		 988 aa  206  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  23.12 
 
 		 988 aa  204  6e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  26.53 
 
 		 991 aa  203  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  26.53 
 
 		 991 aa  203  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  25.23 
 
 		 988 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  22.82 
 
 		 988 aa  201  5e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  22.82 
 
 		 988 aa  201  5e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  23.75 
 
 		 988 aa  200  9e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  23.75 
 
 		 988 aa  200  9e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  23.75 
 
 		 988 aa  200  9e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  23.75 
 
 		 988 aa  200  9e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  25.3 
 
 		 988 aa  199  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  25.3 
 
 		 988 aa  199  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  25.3 
 
 		 988 aa  199  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  23.64 
 
 		 990 aa  198  5.000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  23.64 
 
 		 990 aa  198  5.000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  23.64 
 
 		 990 aa  198  5.000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  23.74 
 
 		 990 aa  197  7e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  23.74 
 
 		 990 aa  196  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  24.97 
 
 		 989 aa  196  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  25.51 
 
 		 999 aa  196  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  24.58 
 
 		 988 aa  195  3e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  23.33 
 
 		 990 aa  193  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  23.33 
 
 		 990 aa  193  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  24.95 
 
 		 992 aa  192  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  24.95 
 
 		 992 aa  192  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  23.99 
 
 		 989 aa  192  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6455  hypothetical protein  78.63 
 
 		 117 aa  191  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  25.36 
 
 		 964 aa  188  4e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  24.3 
 
 		 988 aa  188  4e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  24.41 
 
 		 991 aa  188  4e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  22.77 
 
 		 994 aa  186  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  24.96 
 
 		 606 aa  184  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  25.04 
 
 		 988 aa  183  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5076  TnpA family transposase  42.41 
 
 		 254 aa  183  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  22.89 
 
 		 988 aa  181  4e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  24.38 
 
 		 755 aa  179  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  22.6 
 
 		 985 aa  177  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  22.87 
 
 		 994 aa  175  5e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  23.98 
 
 		 862 aa  174  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  22.76 
 
 		 994 aa  174  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  24.85 
 
 		 996 aa  173  1e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  24.58 
 
 		 996 aa  172  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  24.58 
 
 		 996 aa  172  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  24.58 
 
 		 996 aa  172  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  25.23 
 
 		 550 aa  167  8e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3695  transposase Tn3 family protein  23.49 
 
 		 969 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  24.62 
 
 		 1006 aa  165  3e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  24.05 
 
 		 991 aa  160  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  24.05 
 
 		 991 aa  160  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1822  transposase Tn3 family protein  27.97 
 
 		 371 aa  160  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3666  transposase Tn3 family protein  26.51 
 
 		 924 aa  157  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376312  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  25.25 
 
 		 976 aa  157  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3676  transposase Tn3 family protein  25.33 
 
 		 772 aa  157  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.635368 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4311  TOBE domain-containing protein  26.55 
 
 		 573 aa  156  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  26.35 
 
 		 988 aa  155  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  26.35 
 
 		 988 aa  154  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0196  transposase  29.15 
 
 		 338 aa  153  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5067  transposase Tn3 family protein  25.44 
 
 		 969 aa  151  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0388929  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>