108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4279 on replicon NC_008766
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007337  Reut_D6491  transposase Tn3  100 
 
 		 971 aa  1250    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114145  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0645  transposase Tn3 family protein  74.04 
 
 		 970 aa  925    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0794164 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1179  transposase  100 
 
 		 971 aa  1250    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1202  transposase Tn3  100 
 
 		 971 aa  1250    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.773919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1491  transposase Tn3  100 
 
 		 971 aa  1250    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.200798  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1506  transposase Tn3  100 
 
 		 971 aa  1250    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0432891  hitchhiker  0.006326 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1544  transposase Tn3  100 
 
 		 971 aa  1250    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.121615  normal  0.953447 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6617  transposase Tn3 family protein  99.68 
 
 		 633 aa  1233    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4228  transposase Tn3 family protein  100 
 
 		 971 aa  1250    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.260644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4279  transposase Tn3 family protein  100 
 
 		 799 aa  1607    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0330145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4288  transposase Tn3 family protein  100 
 
 		 971 aa  1250    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2241  transposase Tn3 family protein  100 
 
 		 971 aa  1250    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.86312  normal  0.995044 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3007  transposase Tn3 family protein  100 
 
 		 971 aa  1250    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3044  transposase Tn3 family protein  100 
 
 		 971 aa  1250    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0069  TnpA family transposase  65.48 
 
 		 946 aa  752    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.724381  hitchhiker  0.00503767 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0418  TnpA family transposase  64.9 
 
 		 969 aa  798    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.524573  normal  0.229677 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0454  TnpA family transposase  64.9 
 
 		 969 aa  798    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0489  TnpA family transposase  64.9 
 
 		 969 aa  798    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.384834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0570  TnpA family transposase  65.48 
 
 		 946 aa  752    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0569559 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5786  transposase Tn3 family protein  99.74 
 
 		 766 aa  761    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5146  transposase Tn3 family protein  100 
 
 		 971 aa  1250    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.427024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5784  IS1071, transposase  100 
 
 		 247 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.978933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7306  transposase Tn3 family protein  41.53 
 
 		 980 aa  480  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045557 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5683  transposase Tn3 family protein  40.58 
 
 		 979 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.145306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6590  transposase Tn3  39.14 
 
 		 978 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6212  transposase Tn3  39.18 
 
 		 979 aa  442  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5798  transposase Tn3 family protein  37.5 
 
 		 928 aa  395  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0684485 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4283  putative transposase  99.44 
 
 		 526 aa  371  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2470  transposase Tn3  32.69 
 
 		 977 aa  316  9.999999999999999e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0197511 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5280  transposase Tn3 family protein  32.43 
 
 		 977 aa  306  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1639  transposase Tn3 family protein  32.43 
 
 		 977 aa  306  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0647401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5075  transposase Tn3 family protein  32.63 
 
 		 972 aa  305  2.0000000000000002e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5545  transposase Tn3  38.57 
 
 		 845 aa  304  4.0000000000000003e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.288068 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1853  transposase Tn3 family protein  31.11 
 
 		 762 aa  258  3e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.713988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1323  transposase Tn3 family protein  30.83 
 
 		 989 aa  254  3e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.32373 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4290  putative transposase  67.4 
 
 		 538 aa  246  9.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4741  putative transposase  68.09 
 
 		 327 aa  240  5.999999999999999e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2108  putative transposase  66.67 
 
 		 515 aa  230  7e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2121  putative transposase  66.67 
 
 		 530 aa  230  9e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5543  hypothetical protein  50.74 
 
 		 186 aa  141  6e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.661737 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1877  transposase Tn3  28.11 
 
 		 409 aa  133  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  23.3 
 
 		 988 aa  75.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  23.21 
 
 		 988 aa  75.9  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  20.35 
 
 		 987 aa  74.7  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  23.16 
 
 		 988 aa  73.2  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  23.16 
 
 		 988 aa  73.2  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  23.87 
 
 		 968 aa  71.6  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  22.24 
 
 		 990 aa  70.9  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  21.91 
 
 		 990 aa  70.9  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  21.91 
 
 		 990 aa  70.9  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  21.91 
 
 		 990 aa  70.9  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1821  transposase Tn3 family protein  19.83 
 
 		 612 aa  70.9  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  22.24 
 
 		 990 aa  70.1  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3465  transposase Tn3 family protein  23.35 
 
 		 526 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  22.4 
 
 		 990 aa  68.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  22.4 
 
 		 990 aa  68.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  23.72 
 
 		 991 aa  68.2  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  23.72 
 
 		 991 aa  68.2  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  20.55 
 
 		 992 aa  67.4  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0203  transposase  19.78 
 
 		 738 aa  67.4  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000452446 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  19.34 
 
 		 983 aa  65.5  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  24.07 
 
 		 988 aa  65.1  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  23.14 
 
 		 988 aa  64.7  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  21.34 
 
 		 1015 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  23.13 
 
 		 989 aa  62.4  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  22.82 
 
 		 991 aa  62.4  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  22.82 
 
 		 991 aa  62.4  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0038  transposase InsA  33.33 
 
 		 497 aa  59.7  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.83656 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  22.29 
 
 		 991 aa  59.7  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0092  iscr2 transposase  33.33 
 
 		 497 aa  59.7  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.207156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  22.8 
 
 		 988 aa  58.9  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  22.8 
 
 		 988 aa  58.9  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  22.8 
 
 		 988 aa  58.9  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  22.8 
 
 		 988 aa  58.9  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  19.81 
 
 		 985 aa  58.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  23.62 
 
 		 988 aa  57.8  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  21.84 
 
 		 988 aa  57  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  21.06 
 
 		 989 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0148  transposase InsE  34.15 
 
 		 509 aa  56.6  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.673261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4307  hypothetical protein  25.85 
 
 		 400 aa  56.6  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5398  transposase Tn3 family protein  25.37 
 
 		 1029 aa  55.1  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0815937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  20.5 
 
 		 994 aa  54.7  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  21.2 
 
 		 988 aa  54.3  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  21.2 
 
 		 988 aa  54.3  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  22.03 
 
 		 964 aa  52.8  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19600  transposase, TnpA family  34.07 
 
 		 1028 aa  53.1  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.546457  normal  0.0923144 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3698  transposase Tn3 family protein  19.35 
 
 		 974 aa  53.1  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0861191  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3661  transposase Tn3 family protein  21.58 
 
 		 950 aa  52.8  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  22.31 
 
 		 997 aa  52.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  22.06 
 
 		 988 aa  52.4  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  23.48 
 
 		 961 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  21.65 
 
 		 988 aa  50.8  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  21.65 
 
 		 988 aa  50.8  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  21.65 
 
 		 988 aa  50.8  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4930  transposase Tn3 family protein  29.2 
 
 		 492 aa  50.4  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142055  normal  0.882247 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3715  transposase Tn3 family protein  20.61 
 
 		 731 aa  49.7  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  24.16 
 
 		 983 aa  50.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2035  transposase Tn3 family protein  24.21 
 
 		 659 aa  49.3  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200024  normal  0.850327 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3695  transposase Tn3 family protein  20.38 
 
 		 969 aa  48.9  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3567  transposase Tn3 family protein  24.88 
 
 		 877 aa  48.9  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0660182  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>