34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_B0092 on replicon NC_011092
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011092  SeSA_B0092  iscr2 transposase  100 
 
 
497 aa  1025    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.207156  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0038  transposase InsA  100 
 
 
497 aa  1025    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.83656 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0148  transposase InsE  60.82 
 
 
509 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.673261  normal 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4283  putative transposase  32.95 
 
 
526 aa  231  3e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2108  putative transposase  32.82 
 
 
515 aa  224  4e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4290  putative transposase  32.06 
 
 
538 aa  215  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2121  putative transposase  32.99 
 
 
530 aa  208  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4741  putative transposase  31.72 
 
 
327 aa  79  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1234  hypothetical protein  24.36 
 
 
407 aa  61.6  0.00000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0765  hypothetical protein  26.39 
 
 
141 aa  62  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0558  hypothetical protein  24.36 
 
 
407 aa  61.6  0.00000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0810  hypothetical protein  24.36 
 
 
407 aa  61.6  0.00000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0824  hypothetical protein  24.36 
 
 
407 aa  61.6  0.00000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0859  hypothetical protein  24.36 
 
 
407 aa  61.6  0.00000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1013  hypothetical protein  24.36 
 
 
407 aa  61.6  0.00000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0535  hypothetical protein  24.36 
 
 
407 aa  61.2  0.00000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0523  hypothetical protein  24.36 
 
 
407 aa  61.2  0.00000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0266  hypothetical protein  24.36 
 
 
407 aa  61.2  0.00000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0058  hypothetical protein  24.36 
 
 
407 aa  61.2  0.00000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4279  transposase Tn3 family protein  33.33 
 
 
799 aa  60.1  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0330145  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1584  putative transposase  21.22 
 
 
399 aa  58.2  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_45  transposase  27.07 
 
 
393 aa  50.8  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0298487  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4833  putative transposase  21.09 
 
 
401 aa  50.1  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2035  transposase, putative  26.24 
 
 
372 aa  46.6  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2527  IS91 family transposase  26.24 
 
 
342 aa  46.6  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2212  IS91 family transposase  26.24 
 
 
372 aa  46.6  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2165  IS91 family transposase  26.24 
 
 
372 aa  46.6  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1511  IS91 family transposase  26.24 
 
 
372 aa  46.6  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0979  putative transposase  25.52 
 
 
374 aa  45.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2735  putative transposase  26.28 
 
 
372 aa  44.3  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.186239  normal  0.429893 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2014  putative transposase  26.28 
 
 
372 aa  44.3  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00165646  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1724  putative transposase  26.28 
 
 
372 aa  44.3  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0316105  normal  0.142717 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1625  putative transposase  27.01 
 
 
353 aa  43.9  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0365  putative transposase  23.53 
 
 
388 aa  43.9  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.057361  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>