190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5075 on replicon NC_009508
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009508  Swit_5075  transposase Tn3 family protein  100 
 
 		 972 aa  1953    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0418  TnpA family transposase  38.56 
 
 		 969 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.524573  normal  0.229677 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0454  TnpA family transposase  38.56 
 
 		 969 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0489  TnpA family transposase  38.56 
 
 		 969 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.384834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6491  transposase Tn3  35.83 
 
 		 971 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114145  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1179  transposase  35.72 
 
 		 971 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1202  transposase Tn3  35.72 
 
 		 971 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.773919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1491  transposase Tn3  35.83 
 
 		 971 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.200798  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1506  transposase Tn3  35.83 
 
 		 971 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0432891  hitchhiker  0.006326 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1544  transposase Tn3  35.83 
 
 		 971 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.121615  normal  0.953447 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5146  transposase Tn3 family protein  35.83 
 
 		 971 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.427024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4228  transposase Tn3 family protein  35.72 
 
 		 971 aa  582  1.0000000000000001e-165  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.260644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4288  transposase Tn3 family protein  35.83 
 
 		 971 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2241  transposase Tn3 family protein  35.83 
 
 		 971 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.86312  normal  0.995044 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3007  transposase Tn3 family protein  35.72 
 
 		 971 aa  582  1.0000000000000001e-165  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3044  transposase Tn3 family protein  35.72 
 
 		 971 aa  582  1.0000000000000001e-165  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0069  TnpA family transposase  38.58 
 
 		 946 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.724381  hitchhiker  0.00503767 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0570  TnpA family transposase  38.58 
 
 		 946 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0569559 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0645  transposase Tn3 family protein  37.2 
 
 		 970 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0794164 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7306  transposase Tn3 family protein  36.15 
 
 		 980 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045557 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2470  transposase Tn3  35.59 
 
 		 977 aa  564  1.0000000000000001e-159  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0197511 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5280  transposase Tn3 family protein  36.19 
 
 		 977 aa  556  1e-157  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1639  transposase Tn3 family protein  36.19 
 
 		 977 aa  556  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0647401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6590  transposase Tn3  34.79 
 
 		 978 aa  551  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5683  transposase Tn3 family protein  36.2 
 
 		 979 aa  550  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.145306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6212  transposase Tn3  34.72 
 
 		 979 aa  526  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1323  transposase Tn3 family protein  35.72 
 
 		 989 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.32373 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5798  transposase Tn3 family protein  33.76 
 
 		 928 aa  511  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0684485 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5076  TnpA family transposase  100 
 
 		 254 aa  504  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5786  transposase Tn3 family protein  36.65 
 
 		 766 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5545  transposase Tn3  34.13 
 
 		 845 aa  425  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.288068 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1853  transposase Tn3 family protein  32.36 
 
 		 762 aa  316  9.999999999999999e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.713988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4279  transposase Tn3 family protein  32.63 
 
 		 799 aa  306  2.0000000000000002e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0330145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6617  transposase Tn3 family protein  32.95 
 
 		 633 aa  304  5.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  24.27 
 
 		 983 aa  244  6e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  23.23 
 
 		 992 aa  201  7e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  22.71 
 
 		 987 aa  200  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  26.9 
 
 		 968 aa  184  7e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  24.44 
 
 		 988 aa  171  5e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  24.44 
 
 		 988 aa  171  5e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  24.44 
 
 		 988 aa  171  5e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  25.08 
 
 		 991 aa  169  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  25.08 
 
 		 991 aa  169  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  24.32 
 
 		 964 aa  163  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  25.03 
 
 		 988 aa  162  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  24.72 
 
 		 991 aa  163  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  24.72 
 
 		 991 aa  163  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  24.02 
 
 		 988 aa  161  6e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  24.13 
 
 		 988 aa  160  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  24.69 
 
 		 996 aa  159  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  22.82 
 
 		 988 aa  158  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  22.82 
 
 		 988 aa  158  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  22.82 
 
 		 988 aa  158  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  22.82 
 
 		 988 aa  158  6e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  23.74 
 
 		 1006 aa  157  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  24.09 
 
 		 988 aa  157  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  23.34 
 
 		 989 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  22.76 
 
 		 989 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  23.6 
 
 		 988 aa  155  4e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  23.66 
 
 		 988 aa  154  7e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  22.8 
 
 		 988 aa  154  8e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  22.8 
 
 		 988 aa  154  8e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  28.9 
 
 		 992 aa  153  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  28.9 
 
 		 992 aa  153  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  22.88 
 
 		 994 aa  152  4e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  22.88 
 
 		 994 aa  151  5e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  25.75 
 
 		 606 aa  148  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  25.75 
 
 		 988 aa  148  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  25.75 
 
 		 988 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  24.21 
 
 		 991 aa  147  7.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  24.31 
 
 		 976 aa  146  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  23.66 
 
 		 997 aa  145  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  25.03 
 
 		 996 aa  145  3e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  25.03 
 
 		 996 aa  145  3e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  25.03 
 
 		 996 aa  145  3e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3666  transposase Tn3 family protein  24.74 
 
 		 924 aa  144  5e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376312  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  24.62 
 
 		 999 aa  144  7e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  25.39 
 
 		 988 aa  143  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  25.39 
 
 		 988 aa  143  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  23.09 
 
 		 994 aa  139  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  21.66 
 
 		 985 aa  138  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5784  IS1071, transposase  35.47 
 
 		 247 aa  137  9e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.978933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  22.64 
 
 		 990 aa  137  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  22.64 
 
 		 990 aa  137  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  22.64 
 
 		 990 aa  137  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  22.87 
 
 		 862 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  28.24 
 
 		 961 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  22.74 
 
 		 990 aa  136  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  22.34 
 
 		 990 aa  134  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  22.34 
 
 		 990 aa  134  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  22.7 
 
 		 990 aa  132  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0072  transposase  28.63 
 
 		 546 aa  131  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.520579  normal  0.363066 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4311  TOBE domain-containing protein  27.05 
 
 		 573 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  23.77 
 
 		 1015 aa  128  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  24.38 
 
 		 550 aa  126  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  24.16 
 
 		 988 aa  125  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0150  Tn1721 transposase  31.78 
 
 		 310 aa  125  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.751061 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  24.16 
 
 		 988 aa  124  6e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  24.47 
 
 		 755 aa  125  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1970  TnpA family transposase  22.87 
 
 		 1020 aa  124  8e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>