192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0570 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007337  Reut_D6491  transposase Tn3  71.87 
 
 
971 aa  1345    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114145  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5798  transposase Tn3 family protein  47.34 
 
 
928 aa  805    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0684485 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6590  transposase Tn3  47.81 
 
 
978 aa  816    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138466  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5146  transposase Tn3 family protein  71.87 
 
 
971 aa  1345    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.427024  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5545  transposase Tn3  43.93 
 
 
845 aa  654    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.288068 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1179  transposase  71.76 
 
 
971 aa  1345    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1202  transposase Tn3  71.76 
 
 
971 aa  1345    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.773919  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6212  transposase Tn3  47.49 
 
 
979 aa  795    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1491  transposase Tn3  71.87 
 
 
971 aa  1345    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.200798  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1506  transposase Tn3  71.87 
 
 
971 aa  1345    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0432891  hitchhiker  0.006326 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1544  transposase Tn3  71.87 
 
 
971 aa  1345    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.121615  normal  0.953447 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0645  transposase Tn3 family protein  71.69 
 
 
970 aa  1340    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0794164 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6617  transposase Tn3 family protein  64.78 
 
 
633 aa  731    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7306  transposase Tn3 family protein  47.66 
 
 
980 aa  811    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0045557 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4228  transposase Tn3 family protein  71.76 
 
 
971 aa  1345    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.260644  normal 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4279  transposase Tn3 family protein  65.48 
 
 
799 aa  745    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0330145  normal 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4288  transposase Tn3 family protein  71.87 
 
 
971 aa  1345    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5786  transposase Tn3 family protein  74.22 
 
 
766 aa  1094    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2241  transposase Tn3 family protein  71.87 
 
 
971 aa  1345    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.86312  normal  0.995044 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3007  transposase Tn3 family protein  71.76 
 
 
971 aa  1345    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3044  transposase Tn3 family protein  71.76 
 
 
971 aa  1345    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0069  TnpA family transposase  100 
 
 
946 aa  1885    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.724381  hitchhiker  0.00503767 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0418  TnpA family transposase  99.89 
 
 
969 aa  1860    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.524573  normal  0.229677 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0454  TnpA family transposase  99.89 
 
 
969 aa  1860    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0489  TnpA family transposase  99.89 
 
 
969 aa  1860    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.384834  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0570  TnpA family transposase  100 
 
 
946 aa  1885    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0569559 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5683  transposase Tn3 family protein  48.34 
 
 
979 aa  823    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.145306  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2470  transposase Tn3  39.19 
 
 
977 aa  626  1e-178  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0197511 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1639  transposase Tn3 family protein  39.5 
 
 
977 aa  621  1e-176  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0647401  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5280  transposase Tn3 family protein  39.5 
 
 
977 aa  621  1e-176  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5075  transposase Tn3 family protein  38.63 
 
 
972 aa  594  1e-168  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1323  transposase Tn3 family protein  38.86 
 
 
989 aa  575  1.0000000000000001e-162  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.32373 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1853  transposase Tn3 family protein  35.59 
 
 
762 aa  363  1e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.713988  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5784  IS1071, transposase  62.93 
 
 
247 aa  262  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.978933  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  23.92 
 
 
987 aa  241  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  23.36 
 
 
983 aa  220  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  24.33 
 
 
988 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  24.33 
 
 
988 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  24.59 
 
 
988 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  21.51 
 
 
992 aa  202  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  23.28 
 
 
988 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  24.37 
 
 
1015 aa  197  6e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  23.06 
 
 
988 aa  196  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  23.63 
 
 
988 aa  194  7e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  23.63 
 
 
988 aa  194  7e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  23.63 
 
 
988 aa  194  7e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  25.13 
 
 
988 aa  194  7e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  26.29 
 
 
991 aa  194  7e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  26.29 
 
 
991 aa  194  7e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  23.63 
 
 
988 aa  194  7e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  25.05 
 
 
992 aa  193  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  25.05 
 
 
992 aa  193  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  23.73 
 
 
990 aa  192  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  23.73 
 
 
990 aa  192  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  23.73 
 
 
990 aa  192  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  22.82 
 
 
988 aa  192  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  22.82 
 
 
988 aa  192  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  23.73 
 
 
990 aa  192  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6455  hypothetical protein  78.63 
 
 
117 aa  192  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  25.2 
 
 
988 aa  192  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  25.2 
 
 
988 aa  192  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  25.2 
 
 
988 aa  192  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  23.73 
 
 
990 aa  191  5.999999999999999e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  24.55 
 
 
988 aa  189  1e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  24.77 
 
 
989 aa  189  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  25.36 
 
 
964 aa  188  3e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  23.62 
 
 
990 aa  189  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  23.62 
 
 
990 aa  189  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  25.28 
 
 
999 aa  187  9e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  22.77 
 
 
994 aa  185  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  23.98 
 
 
989 aa  184  6e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  24.1 
 
 
991 aa  184  6e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  24.96 
 
 
606 aa  184  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  24.37 
 
 
988 aa  183  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5076  TnpA family transposase  42.41 
 
 
254 aa  183  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  25.04 
 
 
988 aa  182  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  24.38 
 
 
755 aa  179  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  22.82 
 
 
994 aa  176  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  22.72 
 
 
994 aa  175  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  23.98 
 
 
862 aa  174  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  24.15 
 
 
985 aa  173  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  25.58 
 
 
988 aa  172  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  24.65 
 
 
996 aa  171  5e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  24.65 
 
 
996 aa  171  5e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  24.65 
 
 
996 aa  171  5e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  24.83 
 
 
996 aa  169  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  25.23 
 
 
550 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3695  transposase Tn3 family protein  23.5 
 
 
969 aa  163  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1822  transposase Tn3 family protein  27.97 
 
 
371 aa  160  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  24.56 
 
 
1006 aa  157  8e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  25.25 
 
 
976 aa  157  8e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3666  transposase Tn3 family protein  26.51 
 
 
924 aa  156  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376312  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3676  transposase Tn3 family protein  25.33 
 
 
772 aa  157  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.635368 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4311  TOBE domain-containing protein  26.55 
 
 
573 aa  156  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  26.35 
 
 
988 aa  155  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  26.35 
 
 
988 aa  154  5.9999999999999996e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0196  transposase  29.15 
 
 
338 aa  153  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5067  transposase Tn3 family protein  25.44 
 
 
969 aa  151  7e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0388929  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  24.67 
 
 
961 aa  149  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  23.77 
 
 
991 aa  146  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>