191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1970 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1970  TnpA family transposase  100 
 
 		 1020 aa  2107    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_24  transposase  31.92 
 
 		 1019 aa  514  1e-144  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.207727  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6928  transposase Tn3 family protein  28.46 
 
 		 1027 aa  444  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02020  transposase  26.75 
 
 		 1019 aa  374  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0116  transposase Tn3 family protein  26.49 
 
 		 1018 aa  311  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4556  transposase Tn3 family protein  26.43 
 
 		 1028 aa  296  1e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.875652 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3470  transposase Tn3 family protein  26.07 
 
 		 1028 aa  296  2e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0192  transposase Tn3 family protein  26.07 
 
 		 1026 aa  295  4e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1989  transposase Tn3 family protein  26.07 
 
 		 1026 aa  295  4e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0215  transposase  24.98 
 
 		 1015 aa  289  2e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  0.20757 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1962  transposase Tn3 family protein  25.54 
 
 		 929 aa  270  1e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  28.85 
 
 		 983 aa  211  4e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  26.69 
 
 		 994 aa  211  7e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  26.69 
 
 		 994 aa  210  9e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  23.56 
 
 		 992 aa  205  4e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  26.4 
 
 		 862 aa  201  7e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  23.48 
 
 		 996 aa  200  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  23.7 
 
 		 996 aa  200  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  23.48 
 
 		 996 aa  200  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  23.48 
 
 		 996 aa  200  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  28.83 
 
 		 987 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4112  transposase Tn3 family protein  22.47 
 
 		 1006 aa  197  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  26.59 
 
 		 994 aa  196  3e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  25.42 
 
 		 968 aa  191  4e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1476  transposase Tn3 family protein  23.21 
 
 		 1009 aa  190  9e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000034033 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1851  transposase Tn3 family protein  23.21 
 
 		 1009 aa  190  9e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000277691 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4478  transposase Tn3 family protein  23.21 
 
 		 1009 aa  190  9e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000650614 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5340  transposase  23.21 
 
 		 1009 aa  190  9e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  25.1 
 
 		 1015 aa  187  6e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6457  transposase Tn3  23.3 
 
 		 1008 aa  187  9e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3466  transposase Tn3 family protein  22.06 
 
 		 992 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  30.36 
 
 		 550 aa  185  3e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  24.9 
 
 		 990 aa  182  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  24.9 
 
 		 990 aa  182  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4353  transposase Tn3 family protein  22.96 
 
 		 1010 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4490  transposase Tn3 family protein  22.96 
 
 		 1010 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.666147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  24.64 
 
 		 990 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  24.64 
 
 		 990 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  24.64 
 
 		 990 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  26.94 
 
 		 988 aa  176  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  26.94 
 
 		 988 aa  176  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  26.94 
 
 		 988 aa  176  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  24.85 
 
 		 990 aa  175  3.9999999999999995e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  24.64 
 
 		 990 aa  175  3.9999999999999995e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1822  transposase Tn3 family protein  33.33 
 
 		 371 aa  175  5e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  25.37 
 
 		 985 aa  174  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  25.63 
 
 		 989 aa  171  6e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0196  transposase  34.97 
 
 		 338 aa  170  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  29.34 
 
 		 983 aa  168  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  25.44 
 
 		 988 aa  168  5e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  25.44 
 
 		 988 aa  167  8e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  24.27 
 
 		 989 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  25.43 
 
 		 755 aa  164  7e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  28.41 
 
 		 988 aa  164  9e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  28.41 
 
 		 988 aa  163  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  29.37 
 
 		 606 aa  162  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  27.92 
 
 		 988 aa  160  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  27.92 
 
 		 988 aa  160  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  23.8 
 
 		 988 aa  159  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  23.8 
 
 		 988 aa  159  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  23.8 
 
 		 988 aa  159  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  23.8 
 
 		 988 aa  159  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  22.92 
 
 		 988 aa  160  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  24.19 
 
 		 988 aa  159  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  24.19 
 
 		 988 aa  159  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  24.13 
 
 		 988 aa  158  4e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6852  transposase Tn3 family protein  22.23 
 
 		 994 aa  157  8e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  26.83 
 
 		 961 aa  156  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  23.57 
 
 		 1006 aa  156  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  23.95 
 
 		 988 aa  156  2e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  27.65 
 
 		 964 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  24.7 
 
 		 988 aa  154  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  26.34 
 
 		 992 aa  152  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  26.34 
 
 		 992 aa  152  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  23.43 
 
 		 976 aa  152  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  27.48 
 
 		 988 aa  152  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  24.87 
 
 		 771 aa  152  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0072  transposase  29.78 
 
 		 546 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.520579  normal  0.363066 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  23.82 
 
 		 988 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4311  TOBE domain-containing protein  30.02 
 
 		 573 aa  147  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0239  transposase  38.6 
 
 		 246 aa  146  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0202  transposase  39.29 
 
 		 246 aa  146  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.295684  hitchhiker  6.17068e-17 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3666  transposase Tn3 family protein  23.54 
 
 		 924 aa  145  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376312  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2512  transposase Tn3  22.65 
 
 		 989 aa  143  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227381  normal  0.0913005 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  25.29 
 
 		 991 aa  143  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  25.29 
 
 		 991 aa  143  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3676  transposase Tn3 family protein  30.54 
 
 		 772 aa  143  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.635368 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  22.76 
 
 		 997 aa  142  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  26.28 
 
 		 991 aa  142  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  24.79 
 
 		 999 aa  142  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0150  Tn1721 transposase  35.34 
 
 		 310 aa  139  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.751061 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0079  transposase  26.73 
 
 		 435 aa  138  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.776565  normal  0.783345 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2470  transposase Tn3  21.24 
 
 		 977 aa  135  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0197511 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0035  transposase  36.8 
 
 		 255 aa  135  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.401081  normal  0.351265 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00623  transposase  21.59 
 
 		 986 aa  135  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1639  transposase Tn3 family protein  21.62 
 
 		 977 aa  132  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0647401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3718  transposase Tn3 family protein  34.67 
 
 		 305 aa  131  5.0000000000000004e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.396342  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5280  transposase Tn3 family protein  21.62 
 
 		 977 aa  132  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1226  transposase Tn3  22.19 
 
 		 993 aa  127  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6606  transposase Tn3 family protein  22.19 
 
 		 993 aa  127  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0187013 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>