193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4228 on replicon NC_008765
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007337  Reut_D6491  transposase Tn3  99.9 
 
 
971 aa  1965    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114145  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5683  transposase Tn3 family protein  46.94 
 
 
979 aa  864    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.145306  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6590  transposase Tn3  45.49 
 
 
978 aa  843    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138466  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5786  transposase Tn3 family protein  99.73 
 
 
766 aa  1481    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7306  transposase Tn3 family protein  47.25 
 
 
980 aa  862    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0045557 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2470  transposase Tn3  37.95 
 
 
977 aa  650    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0197511 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1179  transposase  100 
 
 
971 aa  1966    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1202  transposase Tn3  100 
 
 
971 aa  1966    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.773919  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6212  transposase Tn3  46.14 
 
 
979 aa  837    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1491  transposase Tn3  99.9 
 
 
971 aa  1965    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.200798  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1506  transposase Tn3  99.9 
 
 
971 aa  1965    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0432891  hitchhiker  0.006326 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1544  transposase Tn3  99.9 
 
 
971 aa  1965    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.121615  normal  0.953447 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6617  transposase Tn3 family protein  99.68 
 
 
633 aa  1238    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5798  transposase Tn3 family protein  44.81 
 
 
928 aa  787    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0684485 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0645  transposase Tn3 family protein  78.78 
 
 
970 aa  1556    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0794164 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5146  transposase Tn3 family protein  99.9 
 
 
971 aa  1965    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.427024  normal 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4228  transposase Tn3 family protein  100 
 
 
971 aa  1966    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.260644  normal 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4279  transposase Tn3 family protein  100 
 
 
799 aa  1250    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0330145  normal 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4288  transposase Tn3 family protein  99.9 
 
 
971 aa  1965    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2241  transposase Tn3 family protein  99.9 
 
 
971 aa  1965    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.86312  normal  0.995044 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3007  transposase Tn3 family protein  100 
 
 
971 aa  1966    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3044  transposase Tn3 family protein  100 
 
 
971 aa  1966    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0069  TnpA family transposase  71.76 
 
 
946 aa  1350    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.724381  hitchhiker  0.00503767 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0418  TnpA family transposase  71.16 
 
 
969 aa  1397    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.524573  normal  0.229677 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0454  TnpA family transposase  71.16 
 
 
969 aa  1397    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0489  TnpA family transposase  71.16 
 
 
969 aa  1397    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.384834  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0570  TnpA family transposase  71.76 
 
 
946 aa  1350    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0569559 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5545  transposase Tn3  43.66 
 
 
845 aa  635  1e-180  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.288068 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5280  transposase Tn3 family protein  37.18 
 
 
977 aa  624  1e-177  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1639  transposase Tn3 family protein  37.18 
 
 
977 aa  624  1e-177  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0647401  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1323  transposase Tn3 family protein  37 
 
 
989 aa  593  1e-168  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.32373 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5075  transposase Tn3 family protein  35.72 
 
 
972 aa  582  1e-164  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5784  IS1071, transposase  100 
 
 
247 aa  495  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.978933  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1853  transposase Tn3 family protein  34.66 
 
 
762 aa  386  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.713988  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6455  hypothetical protein  99.15 
 
 
117 aa  238  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  22.71 
 
 
987 aa  220  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  22.54 
 
 
983 aa  219  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  23.98 
 
 
988 aa  206  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  23.81 
 
 
988 aa  205  4e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  23.61 
 
 
988 aa  204  7e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  23.88 
 
 
988 aa  203  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  23.57 
 
 
988 aa  202  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  23.57 
 
 
988 aa  202  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  23.49 
 
 
990 aa  202  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  23.98 
 
 
989 aa  201  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  23.49 
 
 
990 aa  201  5e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  23.49 
 
 
990 aa  201  5e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  23.49 
 
 
990 aa  201  5e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  23.49 
 
 
990 aa  201  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  23.49 
 
 
990 aa  201  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  23.49 
 
 
990 aa  200  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  22.6 
 
 
988 aa  197  6e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  22.6 
 
 
988 aa  197  6e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  23.77 
 
 
988 aa  196  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  22.97 
 
 
988 aa  196  2e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  23.45 
 
 
988 aa  195  4e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  23.45 
 
 
988 aa  195  4e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  23.45 
 
 
988 aa  195  4e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  23.07 
 
 
988 aa  194  7e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  23.07 
 
 
988 aa  194  7e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  23.07 
 
 
988 aa  194  7e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  23.07 
 
 
988 aa  194  7e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  23.05 
 
 
989 aa  194  9e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  23.17 
 
 
964 aa  194  9e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  22.71 
 
 
988 aa  190  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  24.84 
 
 
991 aa  189  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  24.84 
 
 
991 aa  189  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  22.78 
 
 
1015 aa  189  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  22.45 
 
 
985 aa  187  7e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5076  TnpA family transposase  39.09 
 
 
254 aa  184  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  24.31 
 
 
992 aa  181  4.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  24.31 
 
 
992 aa  181  4.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  22.65 
 
 
994 aa  180  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  24 
 
 
991 aa  179  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  20.92 
 
 
992 aa  174  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  23.73 
 
 
606 aa  169  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  21.61 
 
 
994 aa  167  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  21.61 
 
 
994 aa  167  9e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  25.9 
 
 
999 aa  164  6e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  22.72 
 
 
755 aa  162  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  21.66 
 
 
862 aa  160  9e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  25.38 
 
 
961 aa  160  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  24.11 
 
 
988 aa  159  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  24.17 
 
 
991 aa  159  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  24.17 
 
 
991 aa  159  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  23.21 
 
 
550 aa  157  8e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  23.26 
 
 
997 aa  155  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1822  transposase Tn3 family protein  24.65 
 
 
371 aa  152  4e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  25.13 
 
 
988 aa  150  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  24.68 
 
 
968 aa  149  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0072  transposase  24.71 
 
 
546 aa  148  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.520579  normal  0.363066 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  22.27 
 
 
1006 aa  148  6e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  24.96 
 
 
988 aa  147  9e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3698  transposase Tn3 family protein  21.32 
 
 
974 aa  145  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0861191  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3676  transposase Tn3 family protein  24.44 
 
 
772 aa  144  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.635368 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4311  TOBE domain-containing protein  25.1 
 
 
573 aa  144  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0196  transposase  25.99 
 
 
338 aa  143  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5543  hypothetical protein  50.74 
 
 
186 aa  142  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.661737 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3695  transposase Tn3 family protein  22.04 
 
 
969 aa  142  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3718  transposase Tn3 family protein  28.21 
 
 
305 aa  142  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.396342  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>