101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6617 on replicon NC_008385
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007337  Reut_D6491  transposase Tn3  99.68 
 
 		 971 aa  1238    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114145  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1179  transposase  99.68 
 
 		 971 aa  1238    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1202  transposase Tn3  99.68 
 
 		 971 aa  1238    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.773919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1491  transposase Tn3  99.68 
 
 		 971 aa  1238    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.200798  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1506  transposase Tn3  99.68 
 
 		 971 aa  1238    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0432891  hitchhiker  0.006326 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1544  transposase Tn3  99.68 
 
 		 971 aa  1238    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.121615  normal  0.953447 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6617  transposase Tn3 family protein  100 
 
 		 633 aa  1278    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4228  transposase Tn3 family protein  99.68 
 
 		 971 aa  1238    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.260644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4279  transposase Tn3 family protein  99.68 
 
 		 799 aa  1233    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0330145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4288  transposase Tn3 family protein  99.68 
 
 		 971 aa  1238    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2241  transposase Tn3 family protein  99.68 
 
 		 971 aa  1238    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.86312  normal  0.995044 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3007  transposase Tn3 family protein  99.68 
 
 		 971 aa  1238    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3044  transposase Tn3 family protein  99.68 
 
 		 971 aa  1238    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0069  TnpA family transposase  64.78 
 
 		 946 aa  738    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.724381  hitchhiker  0.00503767 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0418  TnpA family transposase  64.24 
 
 		 969 aa  784    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.524573  normal  0.229677 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0454  TnpA family transposase  64.24 
 
 		 969 aa  784    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0489  TnpA family transposase  64.24 
 
 		 969 aa  784    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.384834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0570  TnpA family transposase  64.78 
 
 		 946 aa  738    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0569559 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5786  transposase Tn3 family protein  99.21 
 
 		 766 aa  750    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5146  transposase Tn3 family protein  99.68 
 
 		 971 aa  1238    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.427024  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0645  transposase Tn3 family protein  73.46 
 
 		 970 aa  911    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0794164 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5784  IS1071, transposase  100 
 
 		 247 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.978933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7306  transposase Tn3 family protein  41 
 
 		 980 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045557 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5683  transposase Tn3 family protein  40.29 
 
 		 979 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.145306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6590  transposase Tn3  39 
 
 		 978 aa  449  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6212  transposase Tn3  39.1 
 
 		 979 aa  433  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5798  transposase Tn3 family protein  37.32 
 
 		 928 aa  389  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0684485 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2470  transposase Tn3  32.58 
 
 		 977 aa  317  6e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0197511 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1639  transposase Tn3 family protein  32.58 
 
 		 977 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0647401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5280  transposase Tn3 family protein  32.58 
 
 		 977 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5075  transposase Tn3 family protein  32.95 
 
 		 972 aa  304  4.0000000000000003e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5545  transposase Tn3  38.59 
 
 		 845 aa  300  7e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.288068 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1853  transposase Tn3 family protein  31.46 
 
 		 762 aa  259  2e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.713988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1323  transposase Tn3 family protein  30.67 
 
 		 989 aa  253  8.000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.32373 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5543  hypothetical protein  50.74 
 
 		 186 aa  142  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.661737 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1877  transposase Tn3  28.11 
 
 		 409 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  20.58 
 
 		 987 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  23.4 
 
 		 988 aa  75.1  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  23.31 
 
 		 988 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  23.87 
 
 		 968 aa  73.9  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  23.11 
 
 		 988 aa  73.2  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  23.11 
 
 		 988 aa  73.2  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  22.36 
 
 		 990 aa  73.6  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  22.2 
 
 		 990 aa  71.6  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  22.2 
 
 		 990 aa  71.2  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  22.2 
 
 		 990 aa  71.2  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  22.2 
 
 		 990 aa  71.2  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3465  transposase Tn3 family protein  23.35 
 
 		 526 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  23.72 
 
 		 991 aa  69.7  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  23.72 
 
 		 991 aa  69.7  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  22.36 
 
 		 990 aa  70.1  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1821  transposase Tn3 family protein  19.83 
 
 		 612 aa  70.5  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  22.36 
 
 		 990 aa  70.1  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0203  transposase  19.62 
 
 		 738 aa  68.6  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000452446 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  23.09 
 
 		 988 aa  67  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  19.65 
 
 		 983 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  24.07 
 
 		 988 aa  66.6  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  20.47 
 
 		 992 aa  64.7  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  21.37 
 
 		 1015 aa  63.9  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  23.9 
 
 		 989 aa  63.5  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  22.8 
 
 		 991 aa  62.8  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  22.8 
 
 		 991 aa  62.8  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  22.98 
 
 		 988 aa  60.1  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  22.98 
 
 		 988 aa  60.1  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  22.98 
 
 		 988 aa  60.1  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  22.98 
 
 		 988 aa  60.1  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  22.1 
 
 		 991 aa  59.7  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  23.62 
 
 		 988 aa  58.9  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  21.8 
 
 		 989 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  22.39 
 
 		 988 aa  58.5  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  20 
 
 		 985 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  21.2 
 
 		 988 aa  56.2  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  21.2 
 
 		 988 aa  56.2  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4307  hypothetical protein  25.85 
 
 		 400 aa  56.2  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3698  transposase Tn3 family protein  18.65 
 
 		 974 aa  56.2  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0861191  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5398  transposase Tn3 family protein  25.33 
 
 		 1029 aa  55.5  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0815937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  22 
 
 		 964 aa  54.7  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3661  transposase Tn3 family protein  22.01 
 
 		 950 aa  53.9  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  20.57 
 
 		 994 aa  53.9  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  22.06 
 
 		 988 aa  52.8  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  22.52 
 
 		 997 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19600  transposase, TnpA family  34.07 
 
 		 1028 aa  52.8  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.546457  normal  0.0923144 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3695  transposase Tn3 family protein  20.35 
 
 		 969 aa  52  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3567  transposase Tn3 family protein  24.88 
 
 		 877 aa  50.4  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0660182  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  23.48 
 
 		 961 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4930  transposase Tn3 family protein  29.2 
 
 		 492 aa  50.1  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142055  normal  0.882247 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  24.16 
 
 		 983 aa  50.4  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  21.57 
 
 		 988 aa  49.7  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  21.57 
 
 		 988 aa  49.7  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  21.57 
 
 		 988 aa  49.7  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3715  transposase Tn3 family protein  20.61 
 
 		 731 aa  49.7  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1567  transposase  23.48 
 
 		 358 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.385647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  26.34 
 
 		 976 aa  49.3  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3666  transposase Tn3 family protein  26.34 
 
 		 924 aa  49.3  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376312  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2035  transposase Tn3 family protein  24.21 
 
 		 659 aa  49.7  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200024  normal  0.850327 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  23.42 
 
 		 988 aa  47.4  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  22.13 
 
 		 992 aa  47.4  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  22.13 
 
 		 992 aa  47.4  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2347  transposase Tn3  28 
 
 		 916 aa  46.2  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.669911  normal  0.26387 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  21.4 
 
 		 1006 aa  44.7  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>