171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5076 on replicon NC_009508
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009508  Swit_5076  TnpA family transposase  100 
 
 		 254 aa  517  1e-146  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5075  transposase Tn3 family protein  100 
 
 		 972 aa  504  9.999999999999999e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1323  transposase Tn3 family protein  46.85 
 
 		 989 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.32373 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1639  transposase Tn3 family protein  44.92 
 
 		 977 aa  194  8.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0647401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5280  transposase Tn3 family protein  44.92 
 
 		 977 aa  194  8.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2470  transposase Tn3  42.32 
 
 		 977 aa  192  4e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0197511 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0645  transposase Tn3 family protein  41.95 
 
 		 970 aa  186  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0794164 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6491  transposase Tn3  39.09 
 
 		 971 aa  184  9e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114145  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5146  transposase Tn3 family protein  39.09 
 
 		 971 aa  184  9e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.427024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1179  transposase  39.09 
 
 		 971 aa  184  9e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1202  transposase Tn3  39.09 
 
 		 971 aa  184  9e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.773919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1491  transposase Tn3  39.09 
 
 		 971 aa  184  9e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.200798  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1506  transposase Tn3  39.09 
 
 		 971 aa  184  9e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0432891  hitchhiker  0.006326 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1544  transposase Tn3  39.09 
 
 		 971 aa  184  9e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.121615  normal  0.953447 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4228  transposase Tn3 family protein  39.09 
 
 		 971 aa  184  9e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.260644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4288  transposase Tn3 family protein  39.09 
 
 		 971 aa  184  9e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2241  transposase Tn3 family protein  39.09 
 
 		 971 aa  184  9e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.86312  normal  0.995044 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3007  transposase Tn3 family protein  39.09 
 
 		 971 aa  184  9e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3044  transposase Tn3 family protein  39.09 
 
 		 971 aa  184  9e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5786  transposase Tn3 family protein  39.09 
 
 		 766 aa  184  9e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0069  TnpA family transposase  42.41 
 
 		 946 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.724381  hitchhiker  0.00503767 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0418  TnpA family transposase  42.41 
 
 		 969 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.524573  normal  0.229677 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0454  TnpA family transposase  42.41 
 
 		 969 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0489  TnpA family transposase  42.41 
 
 		 969 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.384834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0570  TnpA family transposase  42.41 
 
 		 946 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0569559 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7306  transposase Tn3 family protein  42.31 
 
 		 980 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045557 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6212  transposase Tn3  40.6 
 
 		 979 aa  177  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5798  transposase Tn3 family protein  40.6 
 
 		 928 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0684485 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6590  transposase Tn3  40.17 
 
 		 978 aa  176  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5683  transposase Tn3 family protein  41.03 
 
 		 979 aa  174  9e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.145306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5545  transposase Tn3  40.73 
 
 		 845 aa  148  8e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.288068 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0035  transposase  32.02 
 
 		 255 aa  111  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.401081  normal  0.351265 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0150  Tn1721 transposase  32.02 
 
 		 310 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.751061 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  32.02 
 
 		 988 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  32.02 
 
 		 606 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  32.02 
 
 		 988 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  32.05 
 
 		 988 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  32.05 
 
 		 988 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  32.05 
 
 		 988 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  30.97 
 
 		 988 aa  107  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  30.97 
 
 		 988 aa  107  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  28.8 
 
 		 985 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  30.09 
 
 		 988 aa  104  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  29.65 
 
 		 988 aa  104  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  28.51 
 
 		 991 aa  103  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  28.51 
 
 		 991 aa  103  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  30.09 
 
 		 988 aa  103  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  31.46 
 
 		 988 aa  103  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1822  transposase Tn3 family protein  28 
 
 		 371 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  30.22 
 
 		 983 aa  103  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  30.09 
 
 		 964 aa  102  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3718  transposase Tn3 family protein  30.09 
 
 		 305 aa  102  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.396342  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  29.65 
 
 		 988 aa  101  9e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  29.65 
 
 		 988 aa  101  9e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  29.65 
 
 		 988 aa  101  9e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  29.65 
 
 		 988 aa  101  9e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  29.52 
 
 		 989 aa  101  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  30.4 
 
 		 988 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  30.4 
 
 		 988 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  29.52 
 
 		 755 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  30.53 
 
 		 988 aa  100  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  29.52 
 
 		 990 aa  100  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  29.52 
 
 		 990 aa  100  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  29.52 
 
 		 990 aa  100  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  29.52 
 
 		 990 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  29.52 
 
 		 990 aa  99.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  29.52 
 
 		 990 aa  99.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  31.34 
 
 		 996 aa  99.8  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  29.52 
 
 		 990 aa  99.4  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  29.87 
 
 		 989 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  29.52 
 
 		 994 aa  98.2  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  29.52 
 
 		 550 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  29.52 
 
 		 994 aa  98.2  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  29.52 
 
 		 862 aa  98.2  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  30.88 
 
 		 996 aa  98.2  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  30.88 
 
 		 996 aa  98.2  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  30.88 
 
 		 996 aa  98.2  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  29.2 
 
 		 988 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  26.2 
 
 		 992 aa  96.7  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0239  transposase  28.32 
 
 		 246 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0202  transposase  27.11 
 
 		 246 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.295684  hitchhiker  6.17068e-17 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  28.64 
 
 		 992 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  28.64 
 
 		 992 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0196  transposase  27.11 
 
 		 338 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  29.11 
 
 		 961 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  26.67 
 
 		 987 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  27.95 
 
 		 994 aa  91.7  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0072  transposase  29.11 
 
 		 546 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.520579  normal  0.363066 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  26.47 
 
 		 991 aa  90.1  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  28.32 
 
 		 1015 aa  89.7  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  26.91 
 
 		 999 aa  89  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  28.51 
 
 		 988 aa  84  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  28.51 
 
 		 988 aa  84  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  27.47 
 
 		 1006 aa  83.6  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  33.51 
 
 		 968 aa  82.8  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  27.03 
 
 		 997 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2047  transposase  27.18 
 
 		 217 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3698  transposase Tn3 family protein  27.5 
 
 		 974 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0861191  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3661  transposase Tn3 family protein  27.51 
 
 		 950 aa  80.5  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0355  transposase  30.23 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>