22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_pSN254_0148 on replicon NC_009140
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009140  SNSL254_pSN254_0148  transposase InsE  100 
 
 
509 aa  1035    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.673261  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0038  transposase InsA  59.21 
 
 
497 aa  555  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.83656 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0092  iscr2 transposase  59.21 
 
 
497 aa  555  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.207156  normal 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4283  putative transposase  32.9 
 
 
526 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2108  putative transposase  33.59 
 
 
515 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4290  putative transposase  32 
 
 
538 aa  218  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2121  putative transposase  33.47 
 
 
530 aa  207  4e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4741  putative transposase  32.67 
 
 
327 aa  73.6  0.000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0765  hypothetical protein  27.08 
 
 
141 aa  60.5  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4279  transposase Tn3 family protein  34.51 
 
 
799 aa  57.8  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0330145  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1234  hypothetical protein  22.5 
 
 
407 aa  50.8  0.00006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1013  hypothetical protein  22.5 
 
 
407 aa  50.8  0.00006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0810  hypothetical protein  22.5 
 
 
407 aa  50.8  0.00006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0266  hypothetical protein  22.22 
 
 
407 aa  50.4  0.00007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0523  hypothetical protein  22.22 
 
 
407 aa  50.4  0.00007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0535  hypothetical protein  22.22 
 
 
407 aa  50.4  0.00007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0558  hypothetical protein  22.5 
 
 
407 aa  50.4  0.00007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0058  hypothetical protein  22.22 
 
 
407 aa  50.4  0.00007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0824  hypothetical protein  22.5 
 
 
407 aa  50.4  0.00007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0859  hypothetical protein  22.5 
 
 
407 aa  50.4  0.00007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_45  transposase  19.27 
 
 
393 aa  44.7  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0298487  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0365  putative transposase  21.26 
 
 
388 aa  43.5  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.057361  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>