12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0765 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0765  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  297  4e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0038  transposase InsA  26.39 
 
 
497 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.83656 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0092  iscr2 transposase  26.39 
 
 
497 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.207156  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0148  transposase InsE  27.08 
 
 
509 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.673261  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3087  hypothetical protein  48.33 
 
 
70 aa  56.6  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4741  putative transposase  64.52 
 
 
327 aa  48.9  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4290  putative transposase  65.52 
 
 
538 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2108  putative transposase  40.98 
 
 
515 aa  47.8  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2121  putative transposase  47.92 
 
 
530 aa  47.4  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4283  putative transposase  58.62 
 
 
526 aa  44.7  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4279  transposase Tn3 family protein  53.12 
 
 
799 aa  44.3  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0330145  normal 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_45  transposase  22.81 
 
 
393 aa  43.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0298487  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>