106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2108 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008766  Ajs_4283  putative transposase  74.81 
 
 
526 aa  789    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4290  putative transposase  72.93 
 
 
538 aa  783    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2108  putative transposase  100 
 
 
515 aa  1059    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2121  putative transposase  98.98 
 
 
530 aa  989    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4741  putative transposase  70.71 
 
 
327 aa  313  3.9999999999999997e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4279  transposase Tn3 family protein  66.67 
 
 
799 aa  230  4e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0330145  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0038  transposase InsA  32.82 
 
 
497 aa  224  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.83656 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0092  iscr2 transposase  32.82 
 
 
497 aa  224  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.207156  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0148  transposase InsE  33.47 
 
 
509 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.673261  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2853  transposase  24.27 
 
 
397 aa  65.5  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.652779  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0019  transposase  24.27 
 
 
397 aa  65.1  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0022  transposase  24.5 
 
 
397 aa  65.1  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1445  transposase  24.5 
 
 
397 aa  65.1  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2969  transposase  24.5 
 
 
397 aa  65.1  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.130301  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3035  transposase  24.5 
 
 
397 aa  65.1  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3056  transposase  24.5 
 
 
397 aa  65.1  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0084  transposase  24.23 
 
 
397 aa  65.1  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0256  transposase  24.5 
 
 
397 aa  65.1  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.268648  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0040  transposase  24.5 
 
 
397 aa  64.7  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0050  transposase  24.5 
 
 
397 aa  64.7  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.677312  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0056  transposase  24.5 
 
 
397 aa  64.7  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.713246  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1001  transposase  24.5 
 
 
397 aa  64.7  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1166  transposase  24.5 
 
 
397 aa  64.7  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0692349  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1335  transposase  24.5 
 
 
397 aa  64.7  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1430  transposase  24.5 
 
 
397 aa  64.7  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.178095  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0107  transposase  24.5 
 
 
397 aa  64.7  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0117  transposase  24.5 
 
 
397 aa  64.7  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0130  transposase  24.5 
 
 
397 aa  64.7  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0188  transposase  24.5 
 
 
397 aa  64.7  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0202  transposase  24.5 
 
 
397 aa  64.7  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0529796  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0359  transposase  24.5 
 
 
397 aa  64.7  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.36865  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0442  transposase  24.5 
 
 
397 aa  64.7  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0829  transposase  24.5 
 
 
397 aa  64.7  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.302329  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0875  transposase  24.5 
 
 
397 aa  64.7  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0900  transposase  24.5 
 
 
397 aa  64.7  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0990  transposase  24.5 
 
 
397 aa  64.7  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1048  transposase  24.5 
 
 
397 aa  64.7  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1086  transposase  24.5 
 
 
397 aa  64.7  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1097  transposase  24.5 
 
 
397 aa  64.7  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.930586  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_18  putative transposase  24.43 
 
 
359 aa  63.5  0.000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.424546  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0035  transposase  24.79 
 
 
396 aa  63.2  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0131  transposase  24.72 
 
 
396 aa  62.8  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1683  transposase  24.43 
 
 
359 aa  63.5  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271496  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1708  transposase  24.79 
 
 
396 aa  63.2  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.53086  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0017  transposase  24.53 
 
 
396 aa  63.2  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0208  transposase  24.43 
 
 
359 aa  63.5  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0970  transposase  24.79 
 
 
396 aa  63.2  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0151073  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_26  putative transposase  24.43 
 
 
359 aa  63.5  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181682  n/a   
 
 
-
 
NC_011316  VSAL_p43_03  transposase, IS91 family  24.43 
 
 
359 aa  63.5  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.517825  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1788  putative transposase  22.92 
 
 
380 aa  62.4  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2958  putative transposase  22.92 
 
 
380 aa  62.4  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.174651 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0014  transposase  24.79 
 
 
396 aa  62.8  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3039  transposase  24.79 
 
 
396 aa  62.8  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0106  transposase  24.79 
 
 
396 aa  62.8  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1584  putative transposase  25.57 
 
 
399 aa  61.2  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1720  transposase  24.71 
 
 
358 aa  61.2  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1234  hypothetical protein  25 
 
 
407 aa  60.1  0.00000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0810  hypothetical protein  25 
 
 
407 aa  60.1  0.00000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1013  hypothetical protein  25 
 
 
407 aa  60.1  0.00000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0979  putative transposase  21.93 
 
 
374 aa  59.7  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0859  hypothetical protein  25 
 
 
407 aa  59.7  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0824  hypothetical protein  25 
 
 
407 aa  59.7  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0266  hypothetical protein  25 
 
 
407 aa  59.7  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0523  hypothetical protein  25 
 
 
407 aa  59.7  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0535  hypothetical protein  25 
 
 
407 aa  59.7  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0558  hypothetical protein  25 
 
 
407 aa  59.7  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0058  hypothetical protein  25 
 
 
407 aa  59.3  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0009  ISPsy3, transposase  22.26 
 
 
409 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0002  ISPsy3, transposase  22.26 
 
 
409 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3701  putative transposase  24.88 
 
 
399 aa  53.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8453  putative transposase  24.62 
 
 
401 aa  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.015983  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4833  putative transposase  24.44 
 
 
401 aa  52  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0849  putative transposase  24.77 
 
 
363 aa  51.6  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000021207  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1190  putative transposase  25 
 
 
372 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00196596  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1724  putative transposase  24.32 
 
 
372 aa  51.6  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0316105  normal  0.142717 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2014  putative transposase  24.32 
 
 
372 aa  51.6  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00165646  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2735  putative transposase  24.32 
 
 
372 aa  51.6  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.186239  normal  0.429893 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6606  putative transposase  25.14 
 
 
402 aa  51.6  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7461  putative transposase  25.14 
 
 
402 aa  51.6  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7618  putative transposase  25.14 
 
 
402 aa  51.6  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0655294  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2873  hypothetical protein  28.66 
 
 
189 aa  49.3  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00700324  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4805  putative transposase  29.66 
 
 
402 aa  49.3  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2349  putative transposase  24.51 
 
 
397 aa  48.9  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1195  putative transposase  24.36 
 
 
398 aa  47.8  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6956  putative transposase  27.27 
 
 
406 aa  48.1  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0765  hypothetical protein  40.98 
 
 
141 aa  47.8  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4229  IS1294, transposase  23.77 
 
 
399 aa  47.4  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1163  putative transposase  24.92 
 
 
372 aa  47  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1511  IS91 family transposase  23.3 
 
 
372 aa  46.2  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2035  transposase, putative  23.3 
 
 
372 aa  46.2  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2165  IS91 family transposase  23.3 
 
 
372 aa  46.2  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2212  IS91 family transposase  23.3 
 
 
372 aa  46.2  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2527  IS91 family transposase  23.3 
 
 
342 aa  46.2  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0410  hypothetical protein  46.67 
 
 
82 aa  46.2  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0105  IS1294, transposase  24.14 
 
 
402 aa  46.2  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3469  putative transposase  24.23 
 
 
398 aa  45.8  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0726489  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0286  IS1294, transposase  24.46 
 
 
399 aa  45.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.08654e-28  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1684  putative transposase  24.7 
 
 
372 aa  45.1  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3630  putative transposase  27.7 
 
 
400 aa  44.7  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.954722 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3662  putative transposase  27.7 
 
 
400 aa  44.7  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.202625  hitchhiker  0.0000115382 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>