128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4805 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4805  putative transposase  100 
 
 
402 aa  822    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4501  putative transposase  79.1 
 
 
398 aa  621  1e-177  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1195  putative transposase  74.44 
 
 
398 aa  619  1e-176  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0263  putative transposase  73.74 
 
 
401 aa  585  1e-166  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0821  putative transposase  73.54 
 
 
389 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.348704 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6658  putative transposase  70.03 
 
 
389 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.371491 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1078  putative transposase  70.03 
 
 
389 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3630  putative transposase  63.43 
 
 
400 aa  503  1e-141  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.954722 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3662  putative transposase  63.43 
 
 
400 aa  503  1e-141  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.202625  hitchhiker  0.0000115382 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3701  putative transposase  61.81 
 
 
399 aa  494  9.999999999999999e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8453  putative transposase  63.45 
 
 
401 aa  482  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.015983  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0067  putative transposase  62.34 
 
 
396 aa  478  1e-134  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3469  putative transposase  62.22 
 
 
398 aa  473  1e-132  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0726489  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2349  putative transposase  61.73 
 
 
397 aa  472  1e-132  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0885  putative transposase  59.9 
 
 
402 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.435219  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6606  putative transposase  58.84 
 
 
402 aa  437  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7461  putative transposase  58.84 
 
 
402 aa  437  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7618  putative transposase  58.84 
 
 
402 aa  437  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0655294  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6956  putative transposase  63.64 
 
 
406 aa  409  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0849  putative transposase  38.01 
 
 
363 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000021207  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0979  putative transposase  39.16 
 
 
374 aa  251  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4833  putative transposase  44.47 
 
 
401 aa  247  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1584  putative transposase  41.29 
 
 
399 aa  233  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2862  putative transposase  33.89 
 
 
375 aa  234  3e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.35041 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1724  putative transposase  35.99 
 
 
372 aa  222  7e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0316105  normal  0.142717 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2014  putative transposase  35.99 
 
 
372 aa  222  7e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00165646  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2735  putative transposase  35.99 
 
 
372 aa  222  7e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.186239  normal  0.429893 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3395  putative transposase  62.64 
 
 
209 aa  219  6e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.175347  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1190  putative transposase  35.69 
 
 
372 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00196596  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5164  putative transposase  37.46 
 
 
374 aa  216  5e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1511  IS91 family transposase  35.33 
 
 
372 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2035  transposase, putative  35.33 
 
 
372 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2165  IS91 family transposase  35.33 
 
 
372 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2212  IS91 family transposase  35.33 
 
 
372 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2527  IS91 family transposase  35.33 
 
 
342 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1788  putative transposase  38.44 
 
 
380 aa  213  3.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2958  putative transposase  38.44 
 
 
380 aa  213  3.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.174651 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5042  putative transposase  38.92 
 
 
374 aa  211  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3110  putative transposase  36.65 
 
 
365 aa  209  9e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1163  putative transposase  36.23 
 
 
372 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2394  putative transposase  35.75 
 
 
391 aa  203  5e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2871  putative transposase  35.75 
 
 
391 aa  203  5e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3203  putative transposase  35.93 
 
 
372 aa  202  8e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1684  putative transposase  35.4 
 
 
372 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1798  putative transposase  33.78 
 
 
429 aa  198  2.0000000000000003e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.247476  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0557  transposase  31.79 
 
 
381 aa  197  3e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0148832  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2046  putative transposase  37.61 
 
 
381 aa  189  9e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1625  putative transposase  35.14 
 
 
353 aa  189  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2873  hypothetical protein  41.21 
 
 
189 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00700324  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1136  transposase  29.49 
 
 
362 aa  161  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0560  putative transposase  38.25 
 
 
254 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4470  hypothetical protein  39.27 
 
 
397 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2240  transposase  30.72 
 
 
361 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000696981 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1694  transposase  30.43 
 
 
361 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.744875  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2631  putative transposase  29.69 
 
 
278 aa  114  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5422  hypothetical protein  64.29 
 
 
114 aa  112  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.141571  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2876  putative transposase  35.32 
 
 
215 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000173472  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2853  transposase  27.27 
 
 
397 aa  103  5e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.652779  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0019  transposase  27.27 
 
 
397 aa  103  7e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0022  transposase  28.3 
 
 
397 aa  102  8e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1445  transposase  28.3 
 
 
397 aa  102  8e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2969  transposase  28.3 
 
 
397 aa  102  8e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.130301  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3035  transposase  28.3 
 
 
397 aa  102  8e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3056  transposase  28.3 
 
 
397 aa  102  8e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0256  transposase  28.3 
 
 
397 aa  102  8e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.268648  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0875  transposase  28.3 
 
 
397 aa  102  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011316  VSAL_p43_03  transposase, IS91 family  29.04 
 
 
359 aa  102  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.517825  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0990  transposase  28.3 
 
 
397 aa  102  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0970  transposase  28.3 
 
 
396 aa  102  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0151073  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0829  transposase  28.3 
 
 
397 aa  102  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.302329  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0900  transposase  28.3 
 
 
397 aa  102  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1086  transposase  28.3 
 
 
397 aa  102  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1048  transposase  28.3 
 
 
397 aa  102  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_26  putative transposase  29.04 
 
 
359 aa  102  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181682  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_18  putative transposase  29.04 
 
 
359 aa  102  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.424546  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1097  transposase  28.3 
 
 
397 aa  102  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.930586  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0035  transposase  28.3 
 
 
396 aa  102  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0040  transposase  28.3 
 
 
397 aa  102  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0050  transposase  28.3 
 
 
397 aa  102  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.677312  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0056  transposase  28.3 
 
 
397 aa  102  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.713246  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0131  transposase  28.3 
 
 
396 aa  102  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1001  transposase  28.3 
 
 
397 aa  102  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1166  transposase  28.3 
 
 
397 aa  102  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0692349  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1335  transposase  28.3 
 
 
397 aa  102  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1430  transposase  28.3 
 
 
397 aa  102  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.178095  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1683  transposase  29.04 
 
 
359 aa  102  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271496  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1708  transposase  28.3 
 
 
396 aa  102  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.53086  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1720  transposase  29.04 
 
 
358 aa  102  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0017  transposase  27.27 
 
 
396 aa  102  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0084  transposase  28.3 
 
 
397 aa  102  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0107  transposase  28.3 
 
 
397 aa  102  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0117  transposase  28.3 
 
 
397 aa  102  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0130  transposase  28.3 
 
 
397 aa  102  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0188  transposase  28.3 
 
 
397 aa  102  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0202  transposase  28.3 
 
 
397 aa  102  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0529796  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0208  transposase  29.04 
 
 
359 aa  102  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0359  transposase  28.3 
 
 
397 aa  102  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.36865  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0442  transposase  28.3 
 
 
397 aa  102  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3039  transposase  28.3 
 
 
396 aa  101  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0106  transposase  28.3 
 
 
396 aa  101  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>