126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4501 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4501  putative transposase  100 
 
 		 398 aa  814    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1195  putative transposase  76.13 
 
 		 398 aa  626  1e-178  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4805  putative transposase  78.86 
 
 		 402 aa  614  9.999999999999999e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0821  putative transposase  77 
 
 		 389 aa  597  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.348704 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0263  putative transposase  75.38 
 
 		 401 aa  588  1e-167  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6658  putative transposase  74.81 
 
 		 389 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.371491 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1078  putative transposase  74.81 
 
 		 389 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8453  putative transposase  65.75 
 
 		 401 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.015983  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3630  putative transposase  65.9 
 
 		 400 aa  505  9.999999999999999e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.954722 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3662  putative transposase  65.9 
 
 		 400 aa  505  9.999999999999999e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.202625  hitchhiker  0.0000115382 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3701  putative transposase  61.31 
 
 		 399 aa  495  1e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0067  putative transposase  63.85 
 
 		 396 aa  485  1e-136  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3469  putative transposase  63.4 
 
 		 398 aa  472  1e-132  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0726489  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2349  putative transposase  62.24 
 
 		 397 aa  471  1e-132  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0885  putative transposase  66.19 
 
 		 402 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.435219  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6606  putative transposase  64.16 
 
 		 402 aa  432  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7461  putative transposase  64.16 
 
 		 402 aa  432  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7618  putative transposase  64.16 
 
 		 402 aa  432  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0655294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6956  putative transposase  64.12 
 
 		 406 aa  410  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4833  putative transposase  41.05 
 
 		 401 aa  253  3e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2862  putative transposase  36.27 
 
 		 375 aa  253  3e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.35041 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0979  putative transposase  39.94 
 
 		 374 aa  250  3e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0849  putative transposase  38.54 
 
 		 363 aa  249  6e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000021207  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1584  putative transposase  40.54 
 
 		 399 aa  240  4e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1724  putative transposase  37.17 
 
 		 372 aa  229  5e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0316105  normal  0.142717 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2014  putative transposase  37.17 
 
 		 372 aa  229  5e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00165646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2735  putative transposase  37.17 
 
 		 372 aa  229  5e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.186239  normal  0.429893 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1190  putative transposase  36.58 
 
 		 372 aa  222  8e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00196596  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2527  IS91 family transposase  36.42 
 
 		 342 aa  220  3e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5164  putative transposase  39.35 
 
 		 374 aa  220  3e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1511  IS91 family transposase  36.42 
 
 		 372 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2035  transposase, putative  36.42 
 
 		 372 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2165  IS91 family transposase  36.42 
 
 		 372 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2212  IS91 family transposase  36.42 
 
 		 372 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5042  putative transposase  37.06 
 
 		 374 aa  214  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3395  putative transposase  61.49 
 
 		 209 aa  213  3.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.175347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2394  putative transposase  39.75 
 
 		 391 aa  211  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2871  putative transposase  39.75 
 
 		 391 aa  211  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1798  putative transposase  35.71 
 
 		 429 aa  211  2e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.247476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1788  putative transposase  37.19 
 
 		 380 aa  211  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2958  putative transposase  37.19 
 
 		 380 aa  211  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.174651 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3110  putative transposase  34.67 
 
 		 365 aa  209  6e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3203  putative transposase  35.08 
 
 		 372 aa  209  8e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2046  putative transposase  39.41 
 
 		 381 aa  209  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1163  putative transposase  37.01 
 
 		 372 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1684  putative transposase  36.58 
 
 		 372 aa  207  3e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1625  putative transposase  33.25 
 
 		 353 aa  195  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0557  transposase  32.96 
 
 		 381 aa  192  9e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0148832  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1136  transposase  28.95 
 
 		 362 aa  159  9e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2873  hypothetical protein  40.56 
 
 		 189 aa  157  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00700324  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4470  hypothetical protein  42.57 
 
 		 397 aa  150  4e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0560  putative transposase  36.86 
 
 		 254 aa  145  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2240  transposase  30.38 
 
 		 361 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000696981 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1694  transposase  30.38 
 
 		 361 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.744875  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2631  putative transposase  30.45 
 
 		 278 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0017  transposase  26.7 
 
 		 396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0970  transposase  28.04 
 
 		 396 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0151073  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5422  hypothetical protein  65.48 
 
 		 114 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.141571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_18  putative transposase  28.75 
 
 		 359 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.424546  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0014  transposase  28.04 
 
 		 396 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0019  transposase  26.7 
 
 		 397 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0035  transposase  28.04 
 
 		 396 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0040  transposase  27.76 
 
 		 397 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0131  transposase  28.04 
 
 		 396 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1708  transposase  28.04 
 
 		 396 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.53086  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2853  transposase  26.7 
 
 		 397 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.652779  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3039  transposase  28.04 
 
 		 396 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0084  transposase  28.04 
 
 		 397 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0106  transposase  28.04 
 
 		 396 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0990  transposase  28.04 
 
 		 397 aa  114  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1086  transposase  28.04 
 
 		 397 aa  114  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0875  transposase  28.04 
 
 		 397 aa  114  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0900  transposase  28.04 
 
 		 397 aa  114  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1097  transposase  28.04 
 
 		 397 aa  114  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.930586  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1048  transposase  28.04 
 
 		 397 aa  114  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011316  VSAL_p43_03  transposase, IS91 family  28.75 
 
 		 359 aa  114  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.517825  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_26  putative transposase  28.75 
 
 		 359 aa  114  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181682  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0022  transposase  28.04 
 
 		 397 aa  114  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0050  transposase  28.04 
 
 		 397 aa  114  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.677312  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0056  transposase  28.04 
 
 		 397 aa  114  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.713246  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1001  transposase  28.04 
 
 		 397 aa  114  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1166  transposase  28.04 
 
 		 397 aa  114  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0692349  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1335  transposase  28.04 
 
 		 397 aa  114  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1430  transposase  28.04 
 
 		 397 aa  114  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.178095  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1445  transposase  28.04 
 
 		 397 aa  114  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1683  transposase  28.75 
 
 		 359 aa  114  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271496  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1720  transposase  28.75 
 
 		 358 aa  114  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2969  transposase  28.04 
 
 		 397 aa  114  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.130301  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3035  transposase  28.04 
 
 		 397 aa  114  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3056  transposase  28.04 
 
 		 397 aa  114  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0107  transposase  28.04 
 
 		 397 aa  114  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0117  transposase  28.04 
 
 		 397 aa  114  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0130  transposase  28.04 
 
 		 397 aa  114  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0188  transposase  28.04 
 
 		 397 aa  114  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0202  transposase  28.04 
 
 		 397 aa  114  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0529796  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0208  transposase  28.75 
 
 		 359 aa  114  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0256  transposase  28.04 
 
 		 397 aa  114  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.268648  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0359  transposase  28.04 
 
 		 397 aa  114  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.36865  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0442  transposase  28.04 
 
 		 397 aa  114  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0829  transposase  28.04 
 
 		 397 aa  114  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.302329  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>