54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5422 on replicon NC_010333
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010333  Caul_5422  hypothetical protein  100 
 
 
114 aa  235  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.141571  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6956  putative transposase  75.32 
 
 
406 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7618  putative transposase  68.97 
 
 
402 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0655294  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6606  putative transposase  68.97 
 
 
402 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7461  putative transposase  68.97 
 
 
402 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0821  putative transposase  69.05 
 
 
389 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.348704 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3630  putative transposase  72.15 
 
 
400 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.954722 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3662  putative transposase  72.15 
 
 
400 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.202625  hitchhiker  0.0000115382 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6658  putative transposase  69.41 
 
 
389 aa  124  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.371491 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1078  putative transposase  69.41 
 
 
389 aa  124  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8453  putative transposase  69.62 
 
 
401 aa  117  7e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.015983  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3701  putative transposase  63.22 
 
 
399 aa  116  7.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1195  putative transposase  63.53 
 
 
398 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0263  putative transposase  71.05 
 
 
401 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0885  putative transposase  64.56 
 
 
402 aa  110  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.435219  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4501  putative transposase  70.83 
 
 
398 aa  108  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4805  putative transposase  70.42 
 
 
402 aa  108  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3469  putative transposase  60.26 
 
 
398 aa  102  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0726489  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0067  putative transposase  59.49 
 
 
396 aa  100  6e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2349  putative transposase  58.23 
 
 
397 aa  100  8e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0979  putative transposase  47.83 
 
 
374 aa  68.2  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0557  transposase  44.29 
 
 
381 aa  67.4  0.00000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0148832  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2862  putative transposase  50.94 
 
 
375 aa  65.5  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.35041 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1798  putative transposase  44.29 
 
 
429 aa  65.5  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.247476  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3110  putative transposase  51.67 
 
 
365 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0849  putative transposase  45.31 
 
 
363 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000021207  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2871  putative transposase  35.58 
 
 
391 aa  63.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2394  putative transposase  35.58 
 
 
391 aa  63.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0560  putative transposase  43.55 
 
 
254 aa  60.5  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2958  putative transposase  41.33 
 
 
380 aa  59.3  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.174651 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1788  putative transposase  41.33 
 
 
380 aa  59.3  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4833  putative transposase  43.28 
 
 
401 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1724  putative transposase  40.68 
 
 
372 aa  53.5  0.0000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0316105  normal  0.142717 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2014  putative transposase  40.68 
 
 
372 aa  53.5  0.0000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00165646  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2735  putative transposase  40.68 
 
 
372 aa  53.5  0.0000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.186239  normal  0.429893 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1163  putative transposase  40.68 
 
 
372 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1190  putative transposase  38.98 
 
 
372 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00196596  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1625  putative transposase  42.59 
 
 
353 aa  52  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5164  putative transposase  41.51 
 
 
374 aa  52  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2035  transposase, putative  33.91 
 
 
372 aa  51.2  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1684  putative transposase  33.91 
 
 
372 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2527  IS91 family transposase  33.91 
 
 
342 aa  50.8  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2212  IS91 family transposase  33.91 
 
 
372 aa  51.2  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2165  IS91 family transposase  33.91 
 
 
372 aa  51.2  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1511  IS91 family transposase  33.91 
 
 
372 aa  51.2  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3203  putative transposase  38.98 
 
 
372 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5042  putative transposase  43.4 
 
 
374 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2873  hypothetical protein  48.84 
 
 
189 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00700324  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1584  putative transposase  42.86 
 
 
399 aa  46.2  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2046  putative transposase  46 
 
 
381 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2240  transposase  25 
 
 
361 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000696981 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2631  putative transposase  29.03 
 
 
278 aa  43.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1694  transposase  23.96 
 
 
361 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.744875  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1136  transposase  30.65 
 
 
362 aa  41.2  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>