122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1136 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1136  transposase  100 
 
 		 362 aa  759    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2240  transposase  67.44 
 
 		 361 aa  501  1e-141  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000696981 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1694  transposase  67.44 
 
 		 361 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.744875  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2631  putative transposase  75.47 
 
 		 278 aa  434  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0849  putative transposase  35.42 
 
 		 363 aa  191  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000021207  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3110  putative transposase  32.06 
 
 		 365 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5042  putative transposase  35.47 
 
 		 374 aa  183  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5164  putative transposase  36.72 
 
 		 374 aa  183  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1511  IS91 family transposase  33.98 
 
 		 372 aa  180  4e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2035  transposase, putative  33.98 
 
 		 372 aa  180  4e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2165  IS91 family transposase  33.98 
 
 		 372 aa  180  4e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2212  IS91 family transposase  33.98 
 
 		 372 aa  180  4e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1724  putative transposase  35.18 
 
 		 372 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0316105  normal  0.142717 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2014  putative transposase  35.18 
 
 		 372 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00165646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2735  putative transposase  35.18 
 
 		 372 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.186239  normal  0.429893 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2527  IS91 family transposase  35.13 
 
 		 342 aa  177  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1190  putative transposase  35.71 
 
 		 372 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00196596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1195  putative transposase  29.53 
 
 		 398 aa  169  7e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0067  putative transposase  28.99 
 
 		 396 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3469  putative transposase  28.61 
 
 		 398 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0726489  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8453  putative transposase  29.65 
 
 		 401 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.015983  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2046  putative transposase  37.08 
 
 		 381 aa  164  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3701  putative transposase  27.92 
 
 		 399 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1163  putative transposase  34.53 
 
 		 372 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2349  putative transposase  28.97 
 
 		 397 aa  162  8.000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3203  putative transposase  34.37 
 
 		 372 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0263  putative transposase  29.56 
 
 		 401 aa  161  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6658  putative transposase  29.5 
 
 		 389 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.371491 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1078  putative transposase  29.5 
 
 		 389 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1684  putative transposase  35.71 
 
 		 372 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1625  putative transposase  33.91 
 
 		 353 aa  159  7e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0821  putative transposase  29.02 
 
 		 389 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.348704 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4805  putative transposase  28.72 
 
 		 402 aa  156  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3630  putative transposase  28.35 
 
 		 400 aa  157  4e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.954722 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3662  putative transposase  28.35 
 
 		 400 aa  157  4e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.202625  hitchhiker  0.0000115382 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4501  putative transposase  28.95 
 
 		 398 aa  157  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4833  putative transposase  28.87 
 
 		 401 aa  153  5e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2862  putative transposase  27.02 
 
 		 375 aa  152  5.9999999999999996e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.35041 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6606  putative transposase  29.36 
 
 		 402 aa  152  7e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7461  putative transposase  29.36 
 
 		 402 aa  152  7e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7618  putative transposase  29.36 
 
 		 402 aa  152  7e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0655294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1788  putative transposase  31.89 
 
 		 380 aa  145  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2958  putative transposase  31.89 
 
 		 380 aa  145  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.174651 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6956  putative transposase  27.52 
 
 		 406 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1584  putative transposase  28.69 
 
 		 399 aa  143  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0885  putative transposase  27.4 
 
 		 402 aa  139  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.435219  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0979  putative transposase  26.95 
 
 		 374 aa  133  5e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2873  hypothetical protein  35.52 
 
 		 189 aa  132  6e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00700324  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1798  putative transposase  27.7 
 
 		 429 aa  132  9e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.247476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0557  transposase  26.01 
 
 		 381 aa  120  4.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0148832  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0560  putative transposase  33.93 
 
 		 254 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2394  putative transposase  29.32 
 
 		 391 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2871  putative transposase  29.32 
 
 		 391 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0009  ISPsy3, transposase  27 
 
 		 409 aa  94  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0002  ISPsy3, transposase  27 
 
 		 409 aa  94  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0022  transposase  25.08 
 
 		 397 aa  85.9  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1445  transposase  25.08 
 
 		 397 aa  85.9  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2853  transposase  25.08 
 
 		 397 aa  85.5  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.652779  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2969  transposase  25.08 
 
 		 397 aa  85.9  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.130301  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3035  transposase  25.08 
 
 		 397 aa  85.9  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3056  transposase  25.08 
 
 		 397 aa  85.9  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0256  transposase  25.08 
 
 		 397 aa  85.9  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.268648  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1086  transposase  24.75 
 
 		 397 aa  84.7  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1097  transposase  24.75 
 
 		 397 aa  84.7  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.930586  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_45  transposase  23.51 
 
 		 393 aa  84.7  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0298487  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0019  transposase  24.75 
 
 		 397 aa  84.7  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0035  transposase  25.08 
 
 		 396 aa  85.1  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0050  transposase  24.75 
 
 		 397 aa  84.7  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.677312  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0056  transposase  24.75 
 
 		 397 aa  84.7  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.713246  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0131  transposase  24.75 
 
 		 396 aa  85.1  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1001  transposase  24.75 
 
 		 397 aa  84.7  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1166  transposase  24.75 
 
 		 397 aa  84.7  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0692349  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1335  transposase  24.75 
 
 		 397 aa  84.7  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1430  transposase  24.75 
 
 		 397 aa  84.7  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.178095  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1708  transposase  25.08 
 
 		 396 aa  85.1  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.53086  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1720  transposase  25.17 
 
 		 358 aa  84.7  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0107  transposase  24.75 
 
 		 397 aa  84.7  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0117  transposase  24.75 
 
 		 397 aa  84.7  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0130  transposase  24.75 
 
 		 397 aa  84.7  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0188  transposase  24.75 
 
 		 397 aa  84.7  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0202  transposase  24.75 
 
 		 397 aa  84.7  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0529796  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0359  transposase  24.75 
 
 		 397 aa  84.7  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.36865  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0442  transposase  24.75 
 
 		 397 aa  84.7  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0829  transposase  24.75 
 
 		 397 aa  84.7  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.302329  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0875  transposase  24.75 
 
 		 397 aa  84.7  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0900  transposase  24.75 
 
 		 397 aa  84.7  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0970  transposase  25.08 
 
 		 396 aa  85.1  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0151073  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0990  transposase  24.75 
 
 		 397 aa  84.7  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1048  transposase  24.75 
 
 		 397 aa  84.7  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_18  putative transposase  25.17 
 
 		 359 aa  84.3  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.424546  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_26  putative transposase  25.17 
 
 		 359 aa  84.3  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181682  n/a   
 
 
-
 
NC_011316  VSAL_p43_03  transposase, IS91 family  25.17 
 
 		 359 aa  84.3  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.517825  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0014  transposase  24.75 
 
 		 396 aa  84.3  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0040  transposase  24.75 
 
 		 397 aa  84.3  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1683  transposase  25.17 
 
 		 359 aa  84.3  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271496  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3039  transposase  24.75 
 
 		 396 aa  84.3  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0017  transposase  24.75 
 
 		 396 aa  84.3  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0084  transposase  24.75 
 
 		 397 aa  84.3  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0106  transposase  24.75 
 
 		 396 aa  84.3  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0208  transposase  25.17 
 
 		 359 aa  84.3  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>