121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1694 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_1694  transposase  100 
 
 
361 aa  754    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.744875  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2240  transposase  98.61 
 
 
361 aa  745    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000696981 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1136  transposase  67.44 
 
 
362 aa  500  1e-140  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2631  putative transposase  71.86 
 
 
278 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3110  putative transposase  32.65 
 
 
365 aa  196  7e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5164  putative transposase  33.24 
 
 
374 aa  175  9e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5042  putative transposase  32.69 
 
 
374 aa  174  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1511  IS91 family transposase  33.81 
 
 
372 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2035  transposase, putative  33.81 
 
 
372 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2165  IS91 family transposase  33.81 
 
 
372 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2212  IS91 family transposase  33.81 
 
 
372 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0849  putative transposase  34.78 
 
 
363 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000021207  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2527  IS91 family transposase  34.22 
 
 
342 aa  171  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1190  putative transposase  36.27 
 
 
372 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00196596  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1724  putative transposase  35.62 
 
 
372 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0316105  normal  0.142717 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2014  putative transposase  35.62 
 
 
372 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00165646  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2735  putative transposase  35.62 
 
 
372 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.186239  normal  0.429893 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2862  putative transposase  27.98 
 
 
375 aa  159  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.35041 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1163  putative transposase  35.45 
 
 
372 aa  155  8e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1625  putative transposase  35.76 
 
 
353 aa  154  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3701  putative transposase  28.53 
 
 
399 aa  154  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0067  putative transposase  31.72 
 
 
396 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3469  putative transposase  32.15 
 
 
398 aa  152  7e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0726489  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3203  putative transposase  34.85 
 
 
372 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1195  putative transposase  31.1 
 
 
398 aa  149  6e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1684  putative transposase  35.62 
 
 
372 aa  149  6e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2046  putative transposase  35.47 
 
 
381 aa  146  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8453  putative transposase  30.11 
 
 
401 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.015983  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0263  putative transposase  31.71 
 
 
401 aa  146  5e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3630  putative transposase  30.4 
 
 
400 aa  143  4e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.954722 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3662  putative transposase  30.4 
 
 
400 aa  143  4e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.202625  hitchhiker  0.0000115382 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4501  putative transposase  30.38 
 
 
398 aa  142  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0821  putative transposase  30.06 
 
 
389 aa  142  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.348704 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0885  putative transposase  29.46 
 
 
402 aa  142  9e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.435219  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6606  putative transposase  30.94 
 
 
402 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7461  putative transposase  30.94 
 
 
402 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7618  putative transposase  30.94 
 
 
402 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0655294  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2349  putative transposase  30.87 
 
 
397 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6658  putative transposase  32.19 
 
 
389 aa  139  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.371491 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1078  putative transposase  32.19 
 
 
389 aa  139  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4805  putative transposase  30.14 
 
 
402 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6956  putative transposase  29.38 
 
 
406 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1584  putative transposase  28.65 
 
 
399 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0979  putative transposase  28.38 
 
 
374 aa  130  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1788  putative transposase  30.46 
 
 
380 aa  128  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2958  putative transposase  30.46 
 
 
380 aa  128  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.174651 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4833  putative transposase  27.87 
 
 
401 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1798  putative transposase  27.27 
 
 
429 aa  122  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.247476  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2873  hypothetical protein  31.91 
 
 
189 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00700324  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0560  putative transposase  34.98 
 
 
254 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0557  transposase  26.62 
 
 
381 aa  94  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0148832  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2394  putative transposase  23.38 
 
 
391 aa  92  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2871  putative transposase  23.38 
 
 
391 aa  92  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0058  hypothetical protein  22.06 
 
 
407 aa  82  0.00000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0535  hypothetical protein  22.06 
 
 
407 aa  82.4  0.00000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0523  hypothetical protein  22.06 
 
 
407 aa  82.4  0.00000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0266  hypothetical protein  22.06 
 
 
407 aa  82.4  0.00000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1013  hypothetical protein  21.78 
 
 
407 aa  80.1  0.00000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0810  hypothetical protein  21.78 
 
 
407 aa  80.1  0.00000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1234  hypothetical protein  21.78 
 
 
407 aa  80.1  0.00000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0558  hypothetical protein  21.78 
 
 
407 aa  79.7  0.00000000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0824  hypothetical protein  21.78 
 
 
407 aa  79.7  0.00000000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0859  hypothetical protein  21.78 
 
 
407 aa  79.7  0.00000000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0009  ISPsy3, transposase  25.17 
 
 
409 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0002  ISPsy3, transposase  25.17 
 
 
409 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2876  putative transposase  33.96 
 
 
215 aa  77  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000173472  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4229  IS1294, transposase  24.74 
 
 
399 aa  76.3  0.0000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0105  IS1294, transposase  24.4 
 
 
402 aa  75.1  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0035  transposase  25.28 
 
 
396 aa  74.7  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0131  transposase  25.28 
 
 
396 aa  74.7  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1708  transposase  25.28 
 
 
396 aa  74.7  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.53086  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1720  transposase  25.28 
 
 
358 aa  75.1  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0970  transposase  25.28 
 
 
396 aa  74.7  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0151073  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0286  IS1294, transposase  24.4 
 
 
399 aa  74.7  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.08654e-28  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0295  IS1294, transposase  23.97 
 
 
394 aa  74.3  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000829829  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0022  transposase  25.28 
 
 
397 aa  74.7  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1445  transposase  25.28 
 
 
397 aa  74.7  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2853  transposase  25.28 
 
 
397 aa  74.3  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.652779  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2969  transposase  25.28 
 
 
397 aa  74.7  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.130301  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3035  transposase  25.28 
 
 
397 aa  74.7  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3056  transposase  25.28 
 
 
397 aa  74.7  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0256  transposase  25.28 
 
 
397 aa  74.7  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.268648  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_45  transposase  22.69 
 
 
393 aa  73.6  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0298487  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_26  putative transposase  24.91 
 
 
359 aa  72.4  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181682  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0014  transposase  24.91 
 
 
396 aa  72.4  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0019  transposase  24.91 
 
 
397 aa  72  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0017  transposase  24.91 
 
 
396 aa  72.4  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0106  transposase  24.91 
 
 
396 aa  72.4  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0107  transposase  24.91 
 
 
397 aa  72  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0117  transposase  24.91 
 
 
397 aa  72  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0130  transposase  24.91 
 
 
397 aa  72  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0188  transposase  24.91 
 
 
397 aa  72  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0202  transposase  24.91 
 
 
397 aa  72  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0529796  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0208  transposase  24.91 
 
 
359 aa  72.4  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0359  transposase  24.91 
 
 
397 aa  72  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.36865  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0442  transposase  24.91 
 
 
397 aa  72  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0829  transposase  24.91 
 
 
397 aa  72  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.302329  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0875  transposase  24.91 
 
 
397 aa  72  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0900  transposase  24.91 
 
 
397 aa  72  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0990  transposase  24.91 
 
 
397 aa  72  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>