122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2862 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2862  putative transposase  100 
 
 
375 aa  783    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.35041 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0849  putative transposase  42.98 
 
 
363 aa  312  4.999999999999999e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000021207  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0067  putative transposase  36.18 
 
 
396 aa  268  2e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3469  putative transposase  35.93 
 
 
398 aa  266  5.999999999999999e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0726489  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8453  putative transposase  36.27 
 
 
401 aa  265  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.015983  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5042  putative transposase  38.19 
 
 
374 aa  264  2e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6606  putative transposase  36.69 
 
 
402 aa  264  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7461  putative transposase  36.69 
 
 
402 aa  264  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7618  putative transposase  36.69 
 
 
402 aa  264  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0655294  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5164  putative transposase  37.57 
 
 
374 aa  262  8e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4501  putative transposase  36.27 
 
 
398 aa  261  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2349  putative transposase  36.18 
 
 
397 aa  259  6e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3630  putative transposase  34.75 
 
 
400 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.954722 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3662  putative transposase  34.75 
 
 
400 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.202625  hitchhiker  0.0000115382 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6956  putative transposase  37.28 
 
 
406 aa  251  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0821  putative transposase  37.19 
 
 
389 aa  250  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.348704 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3701  putative transposase  35.35 
 
 
399 aa  249  8e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0263  putative transposase  35.51 
 
 
401 aa  247  3e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6658  putative transposase  37.27 
 
 
389 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.371491 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1078  putative transposase  37.27 
 
 
389 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1195  putative transposase  35.11 
 
 
398 aa  243  3e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3110  putative transposase  38.76 
 
 
365 aa  244  3e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0885  putative transposase  37.32 
 
 
402 aa  242  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.435219  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4805  putative transposase  35.47 
 
 
402 aa  237  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2046  putative transposase  40.94 
 
 
381 aa  232  8.000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0979  putative transposase  33.8 
 
 
374 aa  222  7e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4833  putative transposase  35.35 
 
 
401 aa  208  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2873  hypothetical protein  50.82 
 
 
189 aa  203  4e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00700324  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1584  putative transposase  32.83 
 
 
399 aa  194  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1788  putative transposase  32.92 
 
 
380 aa  186  7e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2958  putative transposase  32.92 
 
 
380 aa  186  7e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.174651 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0560  putative transposase  38.46 
 
 
254 aa  185  9e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1190  putative transposase  29 
 
 
372 aa  184  3e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00196596  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1511  IS91 family transposase  29.52 
 
 
372 aa  181  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2035  transposase, putative  29.52 
 
 
372 aa  181  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2165  IS91 family transposase  29.52 
 
 
372 aa  181  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2212  IS91 family transposase  29.52 
 
 
372 aa  181  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1724  putative transposase  28.18 
 
 
372 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0316105  normal  0.142717 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2014  putative transposase  28.18 
 
 
372 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00165646  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2735  putative transposase  28.18 
 
 
372 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.186239  normal  0.429893 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1798  putative transposase  32.05 
 
 
429 aa  179  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.247476  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2527  IS91 family transposase  29.91 
 
 
342 aa  176  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2394  putative transposase  32.28 
 
 
391 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2871  putative transposase  32.28 
 
 
391 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0557  transposase  31.27 
 
 
381 aa  175  9.999999999999999e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0148832  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3203  putative transposase  29.92 
 
 
372 aa  169  6e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1163  putative transposase  29.57 
 
 
372 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2240  transposase  27.95 
 
 
361 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000696981 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1694  transposase  27.98 
 
 
361 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.744875  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1684  putative transposase  28.89 
 
 
372 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1136  transposase  27.02 
 
 
362 aa  162  7e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1625  putative transposase  28.76 
 
 
353 aa  158  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2876  putative transposase  36.6 
 
 
215 aa  145  9e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000173472  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3395  putative transposase  34.81 
 
 
209 aa  126  5e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.175347  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2631  putative transposase  27.84 
 
 
278 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0035  transposase  26.76 
 
 
396 aa  100  5e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1708  transposase  26.76 
 
 
396 aa  100  5e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.53086  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0970  transposase  26.76 
 
 
396 aa  100  5e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0151073  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0014  transposase  26.76 
 
 
396 aa  99.8  7e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3039  transposase  26.76 
 
 
396 aa  99.8  7e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0017  transposase  26.76 
 
 
396 aa  99.8  7e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0106  transposase  26.76 
 
 
396 aa  99.8  7e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0365  putative transposase  25.17 
 
 
388 aa  99.4  8e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.057361  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0022  transposase  26.76 
 
 
397 aa  99.4  9e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1445  transposase  26.76 
 
 
397 aa  99.4  9e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2853  transposase  26.76 
 
 
397 aa  99.4  9e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.652779  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2969  transposase  26.76 
 
 
397 aa  99.4  9e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.130301  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3035  transposase  26.76 
 
 
397 aa  99.4  9e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3056  transposase  26.76 
 
 
397 aa  99.4  9e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0256  transposase  26.76 
 
 
397 aa  99.4  9e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.268648  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0019  transposase  26.76 
 
 
397 aa  99  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0084  transposase  26.76 
 
 
397 aa  98.6  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1048  transposase  26.76 
 
 
397 aa  98.6  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1097  transposase  26.76 
 
 
397 aa  98.6  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.930586  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1086  transposase  26.76 
 
 
397 aa  98.6  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_26  putative transposase  27.12 
 
 
359 aa  98.2  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181682  n/a   
 
 
-
 
NC_011316  VSAL_p43_03  transposase, IS91 family  27.12 
 
 
359 aa  98.2  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.517825  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0040  transposase  26.76 
 
 
397 aa  98.2  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0050  transposase  26.76 
 
 
397 aa  98.6  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.677312  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0056  transposase  26.76 
 
 
397 aa  98.6  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.713246  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0131  transposase  26.42 
 
 
396 aa  97.8  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1001  transposase  26.76 
 
 
397 aa  98.6  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1166  transposase  26.76 
 
 
397 aa  98.6  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0692349  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1335  transposase  26.76 
 
 
397 aa  98.6  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1430  transposase  26.76 
 
 
397 aa  98.6  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.178095  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1683  transposase  27.12 
 
 
359 aa  98.2  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271496  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0107  transposase  26.76 
 
 
397 aa  98.6  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0117  transposase  26.76 
 
 
397 aa  98.6  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0130  transposase  26.76 
 
 
397 aa  98.6  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0188  transposase  26.76 
 
 
397 aa  98.6  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0202  transposase  26.76 
 
 
397 aa  98.6  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0529796  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0208  transposase  27.12 
 
 
359 aa  98.2  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0359  transposase  26.76 
 
 
397 aa  98.6  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.36865  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0442  transposase  26.76 
 
 
397 aa  98.6  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0829  transposase  26.76 
 
 
397 aa  98.6  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.302329  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0875  transposase  26.76 
 
 
397 aa  98.6  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0900  transposase  26.76 
 
 
397 aa  98.6  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0990  transposase  26.76 
 
 
397 aa  98.6  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1720  transposase  26.78 
 
 
358 aa  97.4  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_18  putative transposase  27.12 
 
 
359 aa  96.7  6e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.424546  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>