129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8453 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011892  Mnod_8453  putative transposase  100 
 
 
401 aa  811    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.015983  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0885  putative transposase  73.76 
 
 
402 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.435219  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0263  putative transposase  66.92 
 
 
401 aa  507  9.999999999999999e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1195  putative transposase  62.31 
 
 
398 aa  499  1e-140  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3630  putative transposase  62.81 
 
 
400 aa  494  9.999999999999999e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.954722 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3662  putative transposase  62.81 
 
 
400 aa  494  9.999999999999999e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.202625  hitchhiker  0.0000115382 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0821  putative transposase  66.58 
 
 
389 aa  491  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.348704 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4501  putative transposase  65.75 
 
 
398 aa  489  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0067  putative transposase  63.87 
 
 
396 aa  484  1e-135  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3701  putative transposase  60.35 
 
 
399 aa  481  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3469  putative transposase  62.18 
 
 
398 aa  474  1e-132  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0726489  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2349  putative transposase  62.5 
 
 
397 aa  474  1e-132  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6658  putative transposase  65.27 
 
 
389 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.371491 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1078  putative transposase  65.27 
 
 
389 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4805  putative transposase  63.45 
 
 
402 aa  462  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6606  putative transposase  57.04 
 
 
402 aa  422  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7461  putative transposase  57.04 
 
 
402 aa  422  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7618  putative transposase  57.04 
 
 
402 aa  422  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0655294  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6956  putative transposase  56.82 
 
 
406 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0849  putative transposase  39.27 
 
 
363 aa  264  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000021207  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4833  putative transposase  43.08 
 
 
401 aa  259  5.0000000000000005e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2862  putative transposase  36.27 
 
 
375 aa  255  1.0000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.35041 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0979  putative transposase  37.53 
 
 
374 aa  250  4e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1584  putative transposase  41.82 
 
 
399 aa  242  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1788  putative transposase  36.18 
 
 
380 aa  233  3e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2958  putative transposase  36.18 
 
 
380 aa  233  3e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.174651 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1190  putative transposase  35.95 
 
 
372 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00196596  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1724  putative transposase  35.08 
 
 
372 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0316105  normal  0.142717 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2014  putative transposase  35.08 
 
 
372 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00165646  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2735  putative transposase  35.08 
 
 
372 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.186239  normal  0.429893 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5042  putative transposase  38.44 
 
 
374 aa  223  4e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1511  IS91 family transposase  34.09 
 
 
372 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2035  transposase, putative  34.09 
 
 
372 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2165  IS91 family transposase  34.09 
 
 
372 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2212  IS91 family transposase  34.09 
 
 
372 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2527  IS91 family transposase  34.32 
 
 
342 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2394  putative transposase  38.75 
 
 
391 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2871  putative transposase  38.75 
 
 
391 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1163  putative transposase  36.22 
 
 
372 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5164  putative transposase  35.99 
 
 
374 aa  216  8e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3203  putative transposase  35.41 
 
 
372 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1684  putative transposase  34.82 
 
 
372 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1798  putative transposase  33.86 
 
 
429 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.247476  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2046  putative transposase  35.88 
 
 
381 aa  197  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3110  putative transposase  34.97 
 
 
365 aa  193  4e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3395  putative transposase  58.29 
 
 
209 aa  190  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.175347  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1625  putative transposase  33.92 
 
 
353 aa  190  4e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0557  transposase  27.53 
 
 
381 aa  181  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0148832  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2873  hypothetical protein  45.05 
 
 
189 aa  171  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00700324  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1136  transposase  29.65 
 
 
362 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0560  putative transposase  38.56 
 
 
254 aa  159  9e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4470  hypothetical protein  43.25 
 
 
397 aa  153  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2240  transposase  30.11 
 
 
361 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000696981 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1694  transposase  30.11 
 
 
361 aa  146  5e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.744875  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0019  transposase  25.82 
 
 
397 aa  118  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0022  transposase  25.82 
 
 
397 aa  119  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1445  transposase  25.82 
 
 
397 aa  119  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2853  transposase  25.82 
 
 
397 aa  119  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.652779  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2969  transposase  25.82 
 
 
397 aa  119  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.130301  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3035  transposase  25.82 
 
 
397 aa  119  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3056  transposase  25.82 
 
 
397 aa  119  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0256  transposase  25.82 
 
 
397 aa  119  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.268648  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0990  transposase  25.82 
 
 
397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011316  VSAL_p43_03  transposase, IS91 family  26.39 
 
 
359 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.517825  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_26  putative transposase  26.39 
 
 
359 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181682  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1097  transposase  25.82 
 
 
397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.930586  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0829  transposase  25.82 
 
 
397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.302329  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0900  transposase  25.82 
 
 
397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0970  transposase  25.82 
 
 
396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0151073  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1086  transposase  25.82 
 
 
397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0875  transposase  25.82 
 
 
397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1048  transposase  25.82 
 
 
397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_18  putative transposase  26.39 
 
 
359 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.424546  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0035  transposase  25.82 
 
 
396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0040  transposase  25.82 
 
 
397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0050  transposase  25.82 
 
 
397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.677312  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0056  transposase  25.82 
 
 
397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.713246  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0131  transposase  25.82 
 
 
396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1001  transposase  25.82 
 
 
397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1166  transposase  25.82 
 
 
397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0692349  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1335  transposase  25.82 
 
 
397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1430  transposase  25.82 
 
 
397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.178095  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1683  transposase  26.39 
 
 
359 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271496  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1708  transposase  25.82 
 
 
396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.53086  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0084  transposase  25.82 
 
 
397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0107  transposase  25.82 
 
 
397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0117  transposase  25.82 
 
 
397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0130  transposase  25.82 
 
 
397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0188  transposase  25.82 
 
 
397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0202  transposase  25.82 
 
 
397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0529796  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0208  transposase  26.39 
 
 
359 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0359  transposase  25.82 
 
 
397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.36865  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0442  transposase  25.82 
 
 
397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0014  transposase  25.82 
 
 
396 aa  117  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1720  transposase  26.39 
 
 
358 aa  117  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3039  transposase  25.82 
 
 
396 aa  117  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0017  transposase  25.82 
 
 
396 aa  117  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0106  transposase  25.82 
 
 
396 aa  117  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5422  hypothetical protein  69.62 
 
 
114 aa  117  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.141571  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2876  putative transposase  35.96 
 
 
215 aa  117  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000173472  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>