126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2349 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009468  Acry_3469  putative transposase  85.64 
 
 
398 aa  698    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0726489  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2349  putative transposase  100 
 
 
397 aa  807    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0067  putative transposase  76.52 
 
 
396 aa  618  1e-176  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3630  putative transposase  65.38 
 
 
400 aa  512  1e-144  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.954722 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3662  putative transposase  65.38 
 
 
400 aa  512  1e-144  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.202625  hitchhiker  0.0000115382 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3701  putative transposase  62.82 
 
 
399 aa  495  1e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0263  putative transposase  63.17 
 
 
401 aa  488  1e-136  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1195  putative transposase  60.51 
 
 
398 aa  479  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8453  putative transposase  62.5 
 
 
401 aa  474  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.015983  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0821  putative transposase  61.54 
 
 
389 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.348704 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4501  putative transposase  62.24 
 
 
398 aa  460  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4805  putative transposase  61.58 
 
 
402 aa  457  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6658  putative transposase  61.46 
 
 
389 aa  448  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.371491 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1078  putative transposase  61.46 
 
 
389 aa  448  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6606  putative transposase  57.5 
 
 
402 aa  431  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7461  putative transposase  57.5 
 
 
402 aa  431  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7618  putative transposase  57.5 
 
 
402 aa  431  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0655294  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6956  putative transposase  57.88 
 
 
406 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0885  putative transposase  56.89 
 
 
402 aa  404  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.435219  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0849  putative transposase  42.54 
 
 
363 aa  286  4e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000021207  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0979  putative transposase  39.54 
 
 
374 aa  255  8e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2862  putative transposase  36.18 
 
 
375 aa  249  7e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.35041 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4833  putative transposase  40.86 
 
 
401 aa  243  3e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1788  putative transposase  38.78 
 
 
380 aa  243  6e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2958  putative transposase  38.78 
 
 
380 aa  243  6e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.174651 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1584  putative transposase  40.32 
 
 
399 aa  235  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1190  putative transposase  34.76 
 
 
372 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00196596  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1724  putative transposase  34.49 
 
 
372 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0316105  normal  0.142717 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2014  putative transposase  34.49 
 
 
372 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00165646  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2735  putative transposase  34.49 
 
 
372 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.186239  normal  0.429893 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5042  putative transposase  38.59 
 
 
374 aa  227  3e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2394  putative transposase  37.29 
 
 
391 aa  220  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2871  putative transposase  37.29 
 
 
391 aa  220  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1511  IS91 family transposase  33.96 
 
 
372 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2035  transposase, putative  33.96 
 
 
372 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2165  IS91 family transposase  33.96 
 
 
372 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2212  IS91 family transposase  33.96 
 
 
372 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3395  putative transposase  66.08 
 
 
209 aa  220  3.9999999999999997e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.175347  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2527  IS91 family transposase  34.15 
 
 
342 aa  219  7e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5164  putative transposase  36.63 
 
 
374 aa  218  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3203  putative transposase  35.03 
 
 
372 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1163  putative transposase  34.76 
 
 
372 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1798  putative transposase  36.9 
 
 
429 aa  210  3e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.247476  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1684  putative transposase  34.76 
 
 
372 aa  210  3e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2046  putative transposase  38.63 
 
 
381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3110  putative transposase  36.56 
 
 
365 aa  199  9e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1625  putative transposase  32.89 
 
 
353 aa  189  7e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0557  transposase  31.51 
 
 
381 aa  187  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0148832  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2873  hypothetical protein  46.67 
 
 
189 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00700324  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4470  hypothetical protein  47.64 
 
 
397 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0560  putative transposase  41.46 
 
 
254 aa  167  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1136  transposase  28.97 
 
 
362 aa  162  9e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2240  transposase  30.87 
 
 
361 aa  142  9e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000696981 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1694  transposase  30.87 
 
 
361 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.744875  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2853  transposase  27.07 
 
 
397 aa  119  7.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.652779  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0970  transposase  27.07 
 
 
396 aa  119  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0151073  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2876  putative transposase  37.91 
 
 
215 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000173472  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0022  transposase  27.07 
 
 
397 aa  119  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0035  transposase  27.07 
 
 
396 aa  119  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0131  transposase  27.07 
 
 
396 aa  119  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1445  transposase  27.07 
 
 
397 aa  119  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1708  transposase  27.07 
 
 
396 aa  119  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.53086  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1720  transposase  28.88 
 
 
358 aa  119  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2969  transposase  27.07 
 
 
397 aa  119  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.130301  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3035  transposase  27.07 
 
 
397 aa  119  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3056  transposase  27.07 
 
 
397 aa  119  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0256  transposase  27.07 
 
 
397 aa  119  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.268648  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0084  transposase  26.65 
 
 
397 aa  117  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0019  transposase  26.65 
 
 
397 aa  117  3.9999999999999997e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0017  transposase  26.65 
 
 
396 aa  117  3.9999999999999997e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0014  transposase  26.65 
 
 
396 aa  116  5e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3039  transposase  26.65 
 
 
396 aa  116  5e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0106  transposase  26.65 
 
 
396 aa  116  5e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0990  transposase  26.65 
 
 
397 aa  116  6e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1097  transposase  26.65 
 
 
397 aa  116  6e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.930586  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0900  transposase  26.65 
 
 
397 aa  116  6e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1086  transposase  26.65 
 
 
397 aa  116  6e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1048  transposase  26.65 
 
 
397 aa  116  6e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0050  transposase  26.65 
 
 
397 aa  116  6e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.677312  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0056  transposase  26.65 
 
 
397 aa  116  6e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.713246  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1001  transposase  26.65 
 
 
397 aa  116  6e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1166  transposase  26.65 
 
 
397 aa  116  6e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0692349  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1335  transposase  26.65 
 
 
397 aa  116  6e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1430  transposase  26.65 
 
 
397 aa  116  6e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.178095  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0107  transposase  26.65 
 
 
397 aa  116  6e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0117  transposase  26.65 
 
 
397 aa  116  6e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0130  transposase  26.65 
 
 
397 aa  116  6e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0188  transposase  26.65 
 
 
397 aa  116  6e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0202  transposase  26.65 
 
 
397 aa  116  6e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0529796  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0359  transposase  26.65 
 
 
397 aa  116  6e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.36865  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0442  transposase  26.65 
 
 
397 aa  116  6e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0829  transposase  26.65 
 
 
397 aa  116  6e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.302329  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0875  transposase  26.65 
 
 
397 aa  116  6e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_26  putative transposase  28.4 
 
 
359 aa  116  6.9999999999999995e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181682  n/a   
 
 
-
 
NC_011316  VSAL_p43_03  transposase, IS91 family  28.4 
 
 
359 aa  116  6.9999999999999995e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.517825  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_18  putative transposase  28.4 
 
 
359 aa  116  6.9999999999999995e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.424546  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1683  transposase  28.4 
 
 
359 aa  116  6.9999999999999995e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271496  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0208  transposase  28.4 
 
 
359 aa  116  6.9999999999999995e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0040  transposase  26.65 
 
 
397 aa  116  7.999999999999999e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2631  putative transposase  29.31 
 
 
278 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>