130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6956 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6606  putative transposase  87.19 
 
 		 402 aa  722    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6956  putative transposase  100 
 
 		 406 aa  830    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7461  putative transposase  87.19 
 
 		 402 aa  722    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7618  putative transposase  87.19 
 
 		 402 aa  722    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0655294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3630  putative transposase  60.1 
 
 		 400 aa  460  9.999999999999999e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.954722 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3662  putative transposase  60.1 
 
 		 400 aa  460  9.999999999999999e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.202625  hitchhiker  0.0000115382 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3469  putative transposase  59.01 
 
 		 398 aa  442  1e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0726489  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0263  putative transposase  65.13 
 
 		 401 aa  443  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0067  putative transposase  58.52 
 
 		 396 aa  439  9.999999999999999e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2349  putative transposase  58.13 
 
 		 397 aa  436  1e-121  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3701  putative transposase  58.2 
 
 		 399 aa  436  1e-121  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1195  putative transposase  61.85 
 
 		 398 aa  433  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0821  putative transposase  62.71 
 
 		 389 aa  423  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.348704 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8453  putative transposase  56.82 
 
 		 401 aa  421  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.015983  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6658  putative transposase  63.32 
 
 		 389 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.371491 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1078  putative transposase  63.32 
 
 		 389 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4501  putative transposase  63.85 
 
 		 398 aa  417  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4805  putative transposase  63.64 
 
 		 402 aa  413  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0885  putative transposase  59.44 
 
 		 402 aa  409  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.435219  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0979  putative transposase  43.9 
 
 		 374 aa  275  1.0000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2862  putative transposase  36.73 
 
 		 375 aa  255  9e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.35041 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4833  putative transposase  41.22 
 
 		 401 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0849  putative transposase  39.73 
 
 		 363 aa  254  3e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000021207  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1584  putative transposase  40.62 
 
 		 399 aa  238  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1190  putative transposase  35.53 
 
 		 372 aa  236  7e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00196596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1724  putative transposase  35.26 
 
 		 372 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0316105  normal  0.142717 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2014  putative transposase  35.26 
 
 		 372 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00165646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2735  putative transposase  35.26 
 
 		 372 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.186239  normal  0.429893 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1511  IS91 family transposase  34 
 
 		 372 aa  231  2e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2035  transposase, putative  34 
 
 		 372 aa  231  2e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2165  IS91 family transposase  34 
 
 		 372 aa  231  2e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2212  IS91 family transposase  34 
 
 		 372 aa  231  2e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2527  IS91 family transposase  34.67 
 
 		 342 aa  224  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1163  putative transposase  34.5 
 
 		 372 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1684  putative transposase  34.25 
 
 		 372 aa  223  4e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2394  putative transposase  38.84 
 
 		 391 aa  223  6e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2871  putative transposase  38.84 
 
 		 391 aa  223  6e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1788  putative transposase  38.33 
 
 		 380 aa  222  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2958  putative transposase  38.33 
 
 		 380 aa  222  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.174651 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3203  putative transposase  35 
 
 		 372 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3110  putative transposase  39.88 
 
 		 365 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5042  putative transposase  38.89 
 
 		 374 aa  221  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5164  putative transposase  38.4 
 
 		 374 aa  213  4.9999999999999996e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1798  putative transposase  35.58 
 
 		 429 aa  210  4e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.247476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1625  putative transposase  33.16 
 
 		 353 aa  200  5e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2046  putative transposase  41.95 
 
 		 381 aa  193  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3395  putative transposase  55.49 
 
 		 209 aa  189  5.999999999999999e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.175347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0557  transposase  28.77 
 
 		 381 aa  172  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0148832  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2873  hypothetical protein  41.53 
 
 		 189 aa  160  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00700324  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0560  putative transposase  38.61 
 
 		 254 aa  150  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1136  transposase  27.52 
 
 		 362 aa  146  6e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1694  transposase  29.38 
 
 		 361 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.744875  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2240  transposase  28.44 
 
 		 361 aa  137  5e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000696981 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5422  hypothetical protein  68.6 
 
 		 114 aa  132  7.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.141571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0105  IS1294, transposase  28.73 
 
 		 402 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4229  IS1294, transposase  28.73 
 
 		 399 aa  120  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0286  IS1294, transposase  28.73 
 
 		 399 aa  120  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.08654e-28  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2853  transposase  26.69 
 
 		 397 aa  121  3e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.652779  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_18  putative transposase  28.19 
 
 		 359 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.424546  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0295  IS1294, transposase  29.28 
 
 		 394 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000829829  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0022  transposase  26.79 
 
 		 397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1445  transposase  26.79 
 
 		 397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2969  transposase  26.79 
 
 		 397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.130301  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3035  transposase  26.79 
 
 		 397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3056  transposase  26.79 
 
 		 397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0256  transposase  26.79 
 
 		 397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.268648  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0019  transposase  26.38 
 
 		 397 aa  117  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0970  transposase  27.1 
 
 		 396 aa  116  6.9999999999999995e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0151073  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0035  transposase  27.1 
 
 		 396 aa  116  6.9999999999999995e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1708  transposase  27.1 
 
 		 396 aa  116  6.9999999999999995e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.53086  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0017  transposase  26.69 
 
 		 396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0442  transposase  26.48 
 
 		 397 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_011316  VSAL_p43_03  transposase, IS91 family  27.85 
 
 		 359 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.517825  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_26  putative transposase  27.85 
 
 		 359 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181682  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0900  transposase  26.48 
 
 		 397 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1097  transposase  26.48 
 
 		 397 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.930586  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1086  transposase  26.48 
 
 		 397 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0829  transposase  26.48 
 
 		 397 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.302329  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0875  transposase  26.48 
 
 		 397 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0990  transposase  26.48 
 
 		 397 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1048  transposase  26.48 
 
 		 397 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0050  transposase  26.48 
 
 		 397 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.677312  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0056  transposase  26.48 
 
 		 397 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.713246  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1001  transposase  26.48 
 
 		 397 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1166  transposase  26.48 
 
 		 397 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0692349  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1335  transposase  26.48 
 
 		 397 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1430  transposase  26.48 
 
 		 397 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.178095  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1683  transposase  27.85 
 
 		 359 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271496  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0084  transposase  26.48 
 
 		 397 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0107  transposase  26.48 
 
 		 397 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0117  transposase  26.48 
 
 		 397 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0130  transposase  26.48 
 
 		 397 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0188  transposase  26.48 
 
 		 397 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0202  transposase  26.48 
 
 		 397 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0529796  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0208  transposase  27.85 
 
 		 359 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0359  transposase  26.48 
 
 		 397 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.36865  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0040  transposase  26.48 
 
 		 397 aa  114  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1720  transposase  28.19 
 
 		 358 aa  114  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0131  transposase  26.48 
 
 		 396 aa  114  4.0000000000000004e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0106  transposase  26.79 
 
 		 396 aa  113  7.000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>