118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3395 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3395  putative transposase  100 
 
 		 209 aa  432  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.175347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3701  putative transposase  81.5 
 
 		 399 aa  290  1e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3630  putative transposase  68.39 
 
 		 400 aa  245  4e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.954722 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3662  putative transposase  68.39 
 
 		 400 aa  245  4e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.202625  hitchhiker  0.0000115382 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0067  putative transposase  67.25 
 
 		 396 aa  229  2e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2349  putative transposase  66.08 
 
 		 397 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3469  putative transposase  65.5 
 
 		 398 aa  219  3e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0726489  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4805  putative transposase  62.64 
 
 		 402 aa  218  3.9999999999999997e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1195  putative transposase  61.49 
 
 		 398 aa  218  7e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0263  putative transposase  63.79 
 
 		 401 aa  217  1e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4501  putative transposase  61.49 
 
 		 398 aa  213  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0821  putative transposase  63.31 
 
 		 389 aa  206  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.348704 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6658  putative transposase  60.95 
 
 		 389 aa  199  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.371491 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1078  putative transposase  60.95 
 
 		 389 aa  199  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0885  putative transposase  55.75 
 
 		 402 aa  191  6e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.435219  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8453  putative transposase  58.29 
 
 		 401 aa  190  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.015983  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6956  putative transposase  55.49 
 
 		 406 aa  189  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6606  putative transposase  54.34 
 
 		 402 aa  185  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7461  putative transposase  54.34 
 
 		 402 aa  185  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7618  putative transposase  54.34 
 
 		 402 aa  185  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0655294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2873  hypothetical protein  38.32 
 
 		 189 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00700324  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0849  putative transposase  39.86 
 
 		 363 aa  119  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000021207  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2862  putative transposase  34.81 
 
 		 375 aa  118  7.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.35041 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5164  putative transposase  38.1 
 
 		 374 aa  115  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5042  putative transposase  38.69 
 
 		 374 aa  114  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4833  putative transposase  40 
 
 		 401 aa  112  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1584  putative transposase  38.24 
 
 		 399 aa  107  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1798  putative transposase  34.12 
 
 		 429 aa  105  7e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.247476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2046  putative transposase  34.63 
 
 		 381 aa  102  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3110  putative transposase  32.93 
 
 		 365 aa  98.6  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1788  putative transposase  35.81 
 
 		 380 aa  97.8  9e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2958  putative transposase  35.81 
 
 		 380 aa  97.8  9e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.174651 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2394  putative transposase  34.42 
 
 		 391 aa  94.7  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2871  putative transposase  34.42 
 
 		 391 aa  94.7  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0979  putative transposase  35.92 
 
 		 374 aa  94.4  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1724  putative transposase  28.24 
 
 		 372 aa  90.9  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0316105  normal  0.142717 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2014  putative transposase  28.24 
 
 		 372 aa  90.9  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00165646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2735  putative transposase  28.24 
 
 		 372 aa  90.9  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.186239  normal  0.429893 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1190  putative transposase  28.82 
 
 		 372 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00196596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0557  transposase  34.93 
 
 		 381 aa  90.1  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0148832  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1511  IS91 family transposase  27.65 
 
 		 372 aa  86.7  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2035  transposase, putative  27.65 
 
 		 372 aa  86.7  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2165  IS91 family transposase  27.65 
 
 		 372 aa  86.7  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2212  IS91 family transposase  27.65 
 
 		 372 aa  86.7  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2527  IS91 family transposase  27.65 
 
 		 342 aa  86.7  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1684  putative transposase  28.82 
 
 		 372 aa  82  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3203  putative transposase  28.82 
 
 		 372 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4470  hypothetical protein  57.14 
 
 		 397 aa  81.6  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1163  putative transposase  28.82 
 
 		 372 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1625  putative transposase  28.24 
 
 		 353 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1136  transposase  27.98 
 
 		 362 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1694  transposase  28.74 
 
 		 361 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.744875  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2240  transposase  28.74 
 
 		 361 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000696981 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_45  transposase  26.71 
 
 		 393 aa  58.2  0.00000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0298487  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0009  ISPsy3, transposase  27.03 
 
 		 409 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0002  ISPsy3, transposase  27.03 
 
 		 409 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4229  IS1294, transposase  26.35 
 
 		 399 aa  56.2  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0105  IS1294, transposase  26.35 
 
 		 402 aa  56.2  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0286  IS1294, transposase  26.35 
 
 		 399 aa  56.2  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.08654e-28  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0295  IS1294, transposase  27.1 
 
 		 394 aa  54.3  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000829829  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1013  hypothetical protein  22.96 
 
 		 407 aa  50.8  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0558  hypothetical protein  22.96 
 
 		 407 aa  50.4  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0824  hypothetical protein  22.96 
 
 		 407 aa  50.4  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0523  hypothetical protein  22.96 
 
 		 407 aa  50.4  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0266  hypothetical protein  22.96 
 
 		 407 aa  50.4  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0859  hypothetical protein  22.96 
 
 		 407 aa  50.4  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0535  hypothetical protein  22.96 
 
 		 407 aa  50.4  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0058  hypothetical protein  22.96 
 
 		 407 aa  50.4  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1234  hypothetical protein  22.96 
 
 		 407 aa  50.8  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0810  hypothetical protein  22.96 
 
 		 407 aa  50.8  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0019  transposase  23.75 
 
 		 397 aa  48.1  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2853  transposase  23.75 
 
 		 397 aa  48.1  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.652779  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0022  transposase  24.18 
 
 		 397 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0040  transposase  24.18 
 
 		 397 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0050  transposase  24.18 
 
 		 397 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.677312  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0056  transposase  24.18 
 
 		 397 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.713246  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1001  transposase  24.18 
 
 		 397 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1166  transposase  24.18 
 
 		 397 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0692349  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1335  transposase  24.18 
 
 		 397 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1430  transposase  24.18 
 
 		 397 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.178095  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1445  transposase  24.18 
 
 		 397 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2969  transposase  24.18 
 
 		 397 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.130301  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3035  transposase  24.18 
 
 		 397 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3056  transposase  24.18 
 
 		 397 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0084  transposase  24.18 
 
 		 397 aa  47.8  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0107  transposase  24.18 
 
 		 397 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0117  transposase  24.18 
 
 		 397 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0130  transposase  24.18 
 
 		 397 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0188  transposase  24.18 
 
 		 397 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0202  transposase  24.18 
 
 		 397 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0529796  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0256  transposase  24.18 
 
 		 397 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.268648  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0359  transposase  24.18 
 
 		 397 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.36865  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0442  transposase  24.18 
 
 		 397 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0829  transposase  24.18 
 
 		 397 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.302329  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0875  transposase  24.18 
 
 		 397 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0900  transposase  24.18 
 
 		 397 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0990  transposase  24.18 
 
 		 397 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1048  transposase  24.18 
 
 		 397 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1086  transposase  24.18 
 
 		 397 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1097  transposase  24.18 
 
 		 397 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.930586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>