126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0885 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0885  putative transposase  100 
 
 
402 aa  801    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.435219  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8453  putative transposase  74.26 
 
 
401 aa  586  1e-166  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.015983  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3630  putative transposase  60.6 
 
 
400 aa  482  1e-135  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.954722 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3662  putative transposase  60.6 
 
 
400 aa  482  1e-135  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.202625  hitchhiker  0.0000115382 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0263  putative transposase  62.5 
 
 
401 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3701  putative transposase  58.31 
 
 
399 aa  461  9.999999999999999e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1195  putative transposase  57.58 
 
 
398 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4501  putative transposase  61.46 
 
 
398 aa  451  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0067  putative transposase  60 
 
 
396 aa  451  1e-125  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4805  putative transposase  60.3 
 
 
402 aa  445  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0821  putative transposase  60.71 
 
 
389 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.348704 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6658  putative transposase  60.61 
 
 
389 aa  431  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.371491 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1078  putative transposase  60.61 
 
 
389 aa  431  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3469  putative transposase  57.8 
 
 
398 aa  421  1e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0726489  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2349  putative transposase  57.14 
 
 
397 aa  419  1e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6606  putative transposase  54.41 
 
 
402 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7461  putative transposase  54.41 
 
 
402 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7618  putative transposase  54.41 
 
 
402 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0655294  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6956  putative transposase  60.69 
 
 
406 aa  391  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0979  putative transposase  39.67 
 
 
374 aa  253  4.0000000000000004e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0849  putative transposase  36.53 
 
 
363 aa  240  4e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000021207  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2862  putative transposase  35.61 
 
 
375 aa  233  6e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.35041 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4833  putative transposase  40 
 
 
401 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5164  putative transposase  37.43 
 
 
374 aa  211  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1190  putative transposase  34.49 
 
 
372 aa  209  6e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00196596  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1584  putative transposase  40.46 
 
 
399 aa  209  9e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2394  putative transposase  37.07 
 
 
391 aa  207  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2871  putative transposase  37.07 
 
 
391 aa  207  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1724  putative transposase  34.22 
 
 
372 aa  206  7e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0316105  normal  0.142717 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2014  putative transposase  34.22 
 
 
372 aa  206  7e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00165646  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2735  putative transposase  34.22 
 
 
372 aa  206  7e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.186239  normal  0.429893 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5042  putative transposase  37.74 
 
 
374 aa  204  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1788  putative transposase  34.38 
 
 
380 aa  202  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2958  putative transposase  34.38 
 
 
380 aa  202  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.174651 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1511  IS91 family transposase  33.96 
 
 
372 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2035  transposase, putative  33.96 
 
 
372 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2165  IS91 family transposase  33.96 
 
 
372 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2212  IS91 family transposase  33.96 
 
 
372 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2527  IS91 family transposase  33.96 
 
 
342 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2046  putative transposase  36.53 
 
 
381 aa  192  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3395  putative transposase  55.75 
 
 
209 aa  191  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.175347  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1163  putative transposase  34.5 
 
 
372 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1684  putative transposase  34.22 
 
 
372 aa  190  4e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3203  putative transposase  34.5 
 
 
372 aa  190  5e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3110  putative transposase  33.16 
 
 
365 aa  189  7e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1798  putative transposase  33.71 
 
 
429 aa  172  6.999999999999999e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.247476  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1625  putative transposase  32.26 
 
 
353 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0557  transposase  28.49 
 
 
381 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0148832  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2873  hypothetical protein  40.56 
 
 
189 aa  163  6e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00700324  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2240  transposase  29.97 
 
 
361 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000696981 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1694  transposase  29.7 
 
 
361 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.744875  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1136  transposase  27.47 
 
 
362 aa  142  8e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0560  putative transposase  36.75 
 
 
254 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4470  hypothetical protein  38.1 
 
 
397 aa  129  7.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5422  hypothetical protein  64.56 
 
 
114 aa  110  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.141571  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2876  putative transposase  34.33 
 
 
215 aa  103  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000173472  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1048  transposase  23.48 
 
 
397 aa  98.2  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1097  transposase  23.48 
 
 
397 aa  98.2  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.930586  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0900  transposase  23.48 
 
 
397 aa  98.2  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1086  transposase  23.48 
 
 
397 aa  98.2  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0990  transposase  23.48 
 
 
397 aa  98.2  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0019  transposase  23.1 
 
 
397 aa  98.2  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0022  transposase  23.48 
 
 
397 aa  97.8  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0050  transposase  23.48 
 
 
397 aa  98.2  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.677312  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0056  transposase  23.48 
 
 
397 aa  98.2  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.713246  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1001  transposase  23.48 
 
 
397 aa  98.2  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1166  transposase  23.48 
 
 
397 aa  98.2  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0692349  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1335  transposase  23.48 
 
 
397 aa  98.2  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1430  transposase  23.48 
 
 
397 aa  98.2  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.178095  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1445  transposase  23.48 
 
 
397 aa  97.8  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2853  transposase  23.1 
 
 
397 aa  97.8  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.652779  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2969  transposase  23.48 
 
 
397 aa  97.8  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.130301  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3035  transposase  23.48 
 
 
397 aa  97.8  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3056  transposase  23.48 
 
 
397 aa  97.8  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0084  transposase  23.48 
 
 
397 aa  97.8  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0107  transposase  23.48 
 
 
397 aa  98.2  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0117  transposase  23.48 
 
 
397 aa  98.2  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0130  transposase  23.48 
 
 
397 aa  98.2  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0188  transposase  23.48 
 
 
397 aa  98.2  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0202  transposase  23.48 
 
 
397 aa  98.2  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0529796  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0256  transposase  23.48 
 
 
397 aa  97.8  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.268648  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0359  transposase  23.48 
 
 
397 aa  98.2  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.36865  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0442  transposase  23.48 
 
 
397 aa  98.2  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0829  transposase  23.48 
 
 
397 aa  98.2  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.302329  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0875  transposase  23.48 
 
 
397 aa  98.2  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0040  transposase  23.48 
 
 
397 aa  97.4  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0017  transposase  23.1 
 
 
396 aa  97.4  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0970  transposase  23.48 
 
 
396 aa  97.1  5e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0151073  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_18  putative transposase  23.81 
 
 
359 aa  97.1  5e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.424546  n/a   
 
 
-
 
NC_011316  VSAL_p43_03  transposase, IS91 family  23.81 
 
 
359 aa  97.1  5e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.517825  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_26  putative transposase  23.81 
 
 
359 aa  97.1  5e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181682  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0014  transposase  23.48 
 
 
396 aa  97.1  5e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0035  transposase  23.48 
 
 
396 aa  97.1  5e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0131  transposase  23.48 
 
 
396 aa  97.1  5e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1683  transposase  23.81 
 
 
359 aa  97.1  5e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271496  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1708  transposase  23.48 
 
 
396 aa  97.1  5e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.53086  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3039  transposase  23.48 
 
 
396 aa  97.1  5e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0106  transposase  23.48 
 
 
396 aa  97.1  5e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0208  transposase  23.81 
 
 
359 aa  97.1  5e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1720  transposase  23.81 
 
 
358 aa  96.3  9e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>