49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4290 on replicon NC_008766
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008766  Ajs_4283  putative transposase  76.55 
 
 		 526 aa  831    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4290  putative transposase  100 
 
 		 538 aa  1101    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2108  putative transposase  72.93 
 
 		 515 aa  783    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2121  putative transposase  71.09 
 
 		 530 aa  720    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4741  putative transposase  63.2 
 
 		 327 aa  299  8e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4279  transposase Tn3 family protein  67.4 
 
 		 799 aa  246  8e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0330145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0148  transposase InsE  32.29 
 
 		 509 aa  216  9e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.673261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0038  transposase InsA  32.06 
 
 		 497 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.83656 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0092  iscr2 transposase  32.06 
 
 		 497 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.207156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2958  putative transposase  22.67 
 
 		 380 aa  62.4  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.174651 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1788  putative transposase  22.67 
 
 		 380 aa  62.4  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1234  hypothetical protein  25 
 
 		 407 aa  58.2  0.0000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0810  hypothetical protein  25 
 
 		 407 aa  58.2  0.0000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1013  hypothetical protein  25 
 
 		 407 aa  58.2  0.0000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0535  hypothetical protein  23.3 
 
 		 407 aa  57.8  0.0000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0558  hypothetical protein  23.3 
 
 		 407 aa  57.8  0.0000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0859  hypothetical protein  23.3 
 
 		 407 aa  57.8  0.0000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0523  hypothetical protein  23.3 
 
 		 407 aa  57.8  0.0000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0266  hypothetical protein  23.3 
 
 		 407 aa  57.8  0.0000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0824  hypothetical protein  23.3 
 
 		 407 aa  57.8  0.0000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0058  hypothetical protein  25 
 
 		 407 aa  57.4  0.0000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0979  putative transposase  22.77 
 
 		 374 aa  52.8  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2873  hypothetical protein  25.86 
 
 		 189 aa  51.6  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00700324  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4229  IS1294, transposase  25.81 
 
 		 399 aa  49.7  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0105  IS1294, transposase  25.51 
 
 		 402 aa  50.1  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0286  IS1294, transposase  25.51 
 
 		 399 aa  48.9  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.08654e-28  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0365  putative transposase  24.31 
 
 		 388 aa  48.5  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.057361  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6606  putative transposase  25.16 
 
 		 402 aa  48.5  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7461  putative transposase  25.16 
 
 		 402 aa  48.5  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7618  putative transposase  25.16 
 
 		 402 aa  48.5  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0655294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0100  IS91 ORF  20.51 
 
 		 410 aa  48.5  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3701  putative transposase  23.82 
 
 		 399 aa  47.8  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8453  putative transposase  24.45 
 
 		 401 aa  47.8  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.015983  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0765  hypothetical protein  65.52 
 
 		 141 aa  47.8  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0849  putative transposase  28.35 
 
 		 363 aa  47.4  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000021207  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0295  IS1294, transposase  25.29 
 
 		 394 aa  47.4  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000829829  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3662  putative transposase  24.62 
 
 		 400 aa  47  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.202625  hitchhiker  0.0000115382 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6956  putative transposase  28.28 
 
 		 406 aa  46.2  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3630  putative transposase  24.62 
 
 		 400 aa  47  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.954722 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2014  putative transposase  24.12 
 
 		 372 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00165646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2735  putative transposase  24.12 
 
 		 372 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.186239  normal  0.429893 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1195  putative transposase  24.14 
 
 		 398 aa  45.8  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1724  putative transposase  24.12 
 
 		 372 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0316105  normal  0.142717 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1163  putative transposase  24.84 
 
 		 372 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1190  putative transposase  24.84 
 
 		 372 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00196596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3469  putative transposase  25.56 
 
 		 398 aa  45.4  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0726489  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3110  putative transposase  21.85 
 
 		 365 aa  43.9  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4501  putative transposase  24.86 
 
 		 398 aa  43.5  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4805  putative transposase  29.17 
 
 		 402 aa  43.5  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>