65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5543 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007950  Bpro_5543  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  382  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.661737 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7306  transposase Tn3 family protein  61.48 
 
 		 980 aa  177  8e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045557 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5683  transposase Tn3 family protein  54.48 
 
 		 979 aa  175  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.145306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6212  transposase Tn3  53.73 
 
 		 979 aa  161  7e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6590  transposase Tn3  49.63 
 
 		 978 aa  152  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1179  transposase  50.74 
 
 		 971 aa  142  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3044  transposase Tn3 family protein  50.74 
 
 		 971 aa  142  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1544  transposase Tn3  50.74 
 
 		 971 aa  142  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.121615  normal  0.953447 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1506  transposase Tn3  50.74 
 
 		 971 aa  142  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0432891  hitchhiker  0.006326 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1491  transposase Tn3  50.74 
 
 		 971 aa  142  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.200798  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4288  transposase Tn3 family protein  50.74 
 
 		 971 aa  142  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4228  transposase Tn3 family protein  50.74 
 
 		 971 aa  142  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.260644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1202  transposase Tn3  50.74 
 
 		 971 aa  142  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.773919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3007  transposase Tn3 family protein  50.74 
 
 		 971 aa  142  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6491  transposase Tn3  50.74 
 
 		 971 aa  142  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114145  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5146  transposase Tn3 family protein  50.74 
 
 		 971 aa  142  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.427024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2241  transposase Tn3 family protein  50.74 
 
 		 971 aa  142  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.86312  normal  0.995044 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6617  transposase Tn3 family protein  50.74 
 
 		 633 aa  142  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5784  IS1071, transposase  50.74 
 
 		 247 aa  142  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.978933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4279  transposase Tn3 family protein  50.74 
 
 		 799 aa  141  6e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0330145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0645  transposase Tn3 family protein  48.53 
 
 		 970 aa  138  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0794164 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0454  TnpA family transposase  49.26 
 
 		 969 aa  135  4e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0489  TnpA family transposase  49.26 
 
 		 969 aa  135  4e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.384834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0418  TnpA family transposase  49.26 
 
 		 969 aa  135  4e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.524573  normal  0.229677 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5798  transposase Tn3 family protein  52.94 
 
 		 928 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0684485 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0570  TnpA family transposase  53.85 
 
 		 946 aa  102  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0569559 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0069  TnpA family transposase  53.85 
 
 		 946 aa  102  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.724381  hitchhiker  0.00503767 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5075  transposase Tn3 family protein  40.32 
 
 		 972 aa  100  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1639  transposase Tn3 family protein  32.8 
 
 		 977 aa  81.6  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0647401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5280  transposase Tn3 family protein  32.8 
 
 		 977 aa  81.6  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2470  transposase Tn3  33.33 
 
 		 977 aa  75.1  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0197511 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1323  transposase Tn3 family protein  33.33 
 
 		 989 aa  70.9  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.32373 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1853  transposase Tn3 family protein  29.84 
 
 		 762 aa  62.8  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.713988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  28.66 
 
 		 992 aa  61.6  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1877  transposase Tn3  30 
 
 		 409 aa  54.7  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  26.67 
 
 		 987 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1821  transposase Tn3 family protein  20.93 
 
 		 612 aa  48.5  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4307  hypothetical protein  27.64 
 
 		 400 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3677  hypothetical protein  26.83 
 
 		 174 aa  47.4  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.472291 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  36.49 
 
 		 996 aa  46.2  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  31.94 
 
 		 1015 aa  45.8  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  30 
 
 		 989 aa  45.1  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0203  transposase  26.32 
 
 		 738 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000452446 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  26.61 
 
 		 1006 aa  44.3  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  27.74 
 
 		 983 aa  44.3  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  23.21 
 
 		 983 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  30.77 
 
 		 988 aa  43.1  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  31.58 
 
 		 991 aa  42.7  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3975  hypothetical protein  25 
 
 		 236 aa  42.7  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  33.78 
 
 		 996 aa  43.1  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  33.78 
 
 		 996 aa  43.1  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  33.78 
 
 		 996 aa  43.1  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  32.5 
 
 		 989 aa  42.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5219  transposase Tn3 family protein  25.89 
 
 		 570 aa  42.4  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  30.09 
 
 		 988 aa  42.4  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  29.46 
 
 		 988 aa  42  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  29.46 
 
 		 988 aa  42  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  29.46 
 
 		 988 aa  42  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  29.46 
 
 		 988 aa  42  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  27.5 
 
 		 988 aa  42  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  27.13 
 
 		 992 aa  41.6  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  27.13 
 
 		 992 aa  41.6  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  26.61 
 
 		 961 aa  41.2  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  30.36 
 
 		 988 aa  41.2  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  32.63 
 
 		 968 aa  41.2  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>