49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1877 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1877  transposase Tn3  100 
 
 		 409 aa  839    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2470  transposase Tn3  33.84 
 
 		 977 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0197511 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5280  transposase Tn3 family protein  32.23 
 
 		 977 aa  218  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1639  transposase Tn3 family protein  32.23 
 
 		 977 aa  218  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0647401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1323  transposase Tn3 family protein  31.83 
 
 		 989 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.32373 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1853  transposase Tn3 family protein  30.55 
 
 		 762 aa  160  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.713988  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0645  transposase Tn3 family protein  29.34 
 
 		 970 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0794164 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4279  transposase Tn3 family protein  28.11 
 
 		 799 aa  133  5e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0330145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4228  transposase Tn3 family protein  28.11 
 
 		 971 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.260644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3044  transposase Tn3 family protein  28.11 
 
 		 971 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3007  transposase Tn3 family protein  28.11 
 
 		 971 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2241  transposase Tn3 family protein  28.11 
 
 		 971 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.86312  normal  0.995044 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4288  transposase Tn3 family protein  28.11 
 
 		 971 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6617  transposase Tn3 family protein  28.11 
 
 		 633 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1544  transposase Tn3  28.11 
 
 		 971 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.121615  normal  0.953447 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1506  transposase Tn3  28.11 
 
 		 971 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0432891  hitchhiker  0.006326 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1491  transposase Tn3  28.11 
 
 		 971 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.200798  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1202  transposase Tn3  28.11 
 
 		 971 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.773919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1179  transposase  28.11 
 
 		 971 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5146  transposase Tn3 family protein  28.11 
 
 		 971 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.427024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6491  transposase Tn3  28.11 
 
 		 971 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114145  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5075  transposase Tn3 family protein  30.48 
 
 		 972 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0489  TnpA family transposase  27.59 
 
 		 969 aa  108  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.384834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0418  TnpA family transposase  27.59 
 
 		 969 aa  108  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.524573  normal  0.229677 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0454  TnpA family transposase  27.59 
 
 		 969 aa  108  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0570  TnpA family transposase  29 
 
 		 946 aa  102  8e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0569559 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0069  TnpA family transposase  29 
 
 		 946 aa  102  8e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.724381  hitchhiker  0.00503767 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5683  transposase Tn3 family protein  24.3 
 
 		 979 aa  97.1  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.145306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7306  transposase Tn3 family protein  21.7 
 
 		 980 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045557 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6590  transposase Tn3  21.82 
 
 		 978 aa  94.7  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5798  transposase Tn3 family protein  21.14 
 
 		 928 aa  90.9  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0684485 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6212  transposase Tn3  23.26 
 
 		 979 aa  86.3  9e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5784  IS1071, transposase  27.57 
 
 		 247 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.978933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  25.36 
 
 		 987 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  22.48 
 
 		 983 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1821  transposase Tn3 family protein  22.46 
 
 		 612 aa  63.2  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5786  transposase Tn3 family protein  29.27 
 
 		 766 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  22.41 
 
 		 992 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5543  hypothetical protein  30 
 
 		 186 aa  54.3  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.661737 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1787  hypothetical protein  25.7 
 
 		 319 aa  53.9  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0203  transposase  20.47 
 
 		 738 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000452446 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4307  hypothetical protein  24.15 
 
 		 400 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5545  transposase Tn3  22.13 
 
 		 845 aa  48.9  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.288068 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6366  transposase  26.44 
 
 		 260 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.714765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2347  transposase Tn3  25 
 
 		 916 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.669911  normal  0.26387 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  23.08 
 
 		 961 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1567  transposase  22.36 
 
 		 358 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.385647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  25.84 
 
 		 968 aa  43.9  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  23.51 
 
 		 983 aa  43.5  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>