130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C1567 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  99.43 
 
 
961 aa  704    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1567  transposase  100 
 
 
358 aa  714    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.385647  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4307  hypothetical protein  59.66 
 
 
400 aa  423  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3677  hypothetical protein  63.22 
 
 
174 aa  231  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.472291 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4119  hypothetical protein  72.41 
 
 
179 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  40.58 
 
 
992 aa  210  3e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  40.58 
 
 
992 aa  210  3e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  32.85 
 
 
988 aa  197  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  34.58 
 
 
1015 aa  196  6e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3465  transposase Tn3 family protein  32.39 
 
 
526 aa  194  3e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  32.28 
 
 
990 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  32.28 
 
 
990 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  32.3 
 
 
990 aa  192  5e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  32.56 
 
 
988 aa  191  1e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  31.74 
 
 
990 aa  189  7e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  31.74 
 
 
990 aa  189  7e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  31.74 
 
 
990 aa  189  7e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  31.74 
 
 
990 aa  188  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  32.85 
 
 
988 aa  186  7e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  31.4 
 
 
985 aa  186  8e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  32.85 
 
 
988 aa  185  9e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  32.85 
 
 
988 aa  185  9e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3715  transposase Tn3 family protein  32 
 
 
731 aa  185  9e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  31.41 
 
 
989 aa  184  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  33.43 
 
 
988 aa  183  4.0000000000000006e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  33.43 
 
 
988 aa  183  4.0000000000000006e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  33.72 
 
 
988 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  32.47 
 
 
988 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  31.41 
 
 
988 aa  182  7e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  31.41 
 
 
988 aa  182  7e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  31.41 
 
 
988 aa  182  7e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  31.41 
 
 
988 aa  182  7e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  31.7 
 
 
988 aa  182  9.000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  32.27 
 
 
989 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  33.43 
 
 
988 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  31.69 
 
 
964 aa  176  5e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  31.12 
 
 
992 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3676  transposase Tn3 family protein  53.75 
 
 
772 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.635368 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  32.77 
 
 
983 aa  170  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  32.95 
 
 
988 aa  166  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  32.95 
 
 
988 aa  166  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  32.95 
 
 
988 aa  166  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  30.88 
 
 
983 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  28.74 
 
 
988 aa  152  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  29.12 
 
 
987 aa  149  5e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0203  transposase  29.56 
 
 
738 aa  149  6e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000452446 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  30.2 
 
 
996 aa  149  7e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  29.63 
 
 
996 aa  145  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  29.63 
 
 
996 aa  145  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  29.63 
 
 
996 aa  145  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  31.05 
 
 
991 aa  141  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1821  transposase Tn3 family protein  26.32 
 
 
612 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  28.65 
 
 
994 aa  137  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  31.52 
 
 
999 aa  137  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2083  transposase Tn3 family protein  26.38 
 
 
440 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  26.38 
 
 
994 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  32.1 
 
 
991 aa  133  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  32.1 
 
 
991 aa  133  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  26.38 
 
 
994 aa  133  5e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1051  transposase Tn3  32.76 
 
 
171 aa  106  8e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3567  transposase Tn3 family protein  26.28 
 
 
877 aa  102  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0660182  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2347  transposase Tn3  29.15 
 
 
916 aa  98.6  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.669911  normal  0.26387 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  29.3 
 
 
1006 aa  95.5  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4723  transposase, Tn3 family  29.54 
 
 
1075 aa  92.8  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  27.12 
 
 
988 aa  91.3  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  27.12 
 
 
988 aa  91.3  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  23.41 
 
 
862 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19600  transposase, TnpA family  31.21 
 
 
1028 aa  82  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.546457  normal  0.0923144 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2394  transposase Tn3 family protein  27.81 
 
 
1007 aa  80.5  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2107  transposase Tn3 family protein  27.81 
 
 
1007 aa  80.5  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  27.93 
 
 
991 aa  80.1  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  27.93 
 
 
991 aa  80.1  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0238  transposase  25.22 
 
 
613 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0197  transposase  25.22 
 
 
523 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  24.35 
 
 
997 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  29.43 
 
 
968 aa  79.3  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2486  transposase Tn3  25.16 
 
 
1013 aa  77  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147103  normal  0.0287681 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4124  transposase Tn3  53.23 
 
 
102 aa  75.9  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0632177 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3614  transposase Tn3 family protein  25.57 
 
 
1009 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3698  transposase Tn3 family protein  22.08 
 
 
974 aa  72  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0861191  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3975  hypothetical protein  25.24 
 
 
236 aa  70.5  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0198  transposase, putative  20.66 
 
 
499 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0237  transposase, putative  20.66 
 
 
499 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1842  transposase Tn3 family protein  24.48 
 
 
1012 aa  68.2  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.550818  normal 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  29.17 
 
 
771 aa  66.6  0.0000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5398  transposase Tn3 family protein  28.12 
 
 
1029 aa  66.2  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0815937  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5219  transposase Tn3 family protein  28.49 
 
 
570 aa  64.3  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1787  hypothetical protein  28.5 
 
 
319 aa  63.9  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5125  transposase Tn3 family protein  24.62 
 
 
874 aa  63.9  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4930  transposase Tn3 family protein  26.35 
 
 
492 aa  61.6  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142055  normal  0.882247 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5067  transposase Tn3 family protein  24.56 
 
 
969 aa  59.7  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0388929  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3661  transposase Tn3 family protein  23.53 
 
 
950 aa  59.3  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3695  transposase Tn3 family protein  21.88 
 
 
969 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2035  transposase Tn3 family protein  25.08 
 
 
659 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200024  normal  0.850327 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  25.42 
 
 
755 aa  53.9  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5280  transposase Tn3 family protein  23.42 
 
 
977 aa  54.3  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1639  transposase Tn3 family protein  23.42 
 
 
977 aa  54.3  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0647401  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  25.4 
 
 
976 aa  52.8  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0025  transposase Tn3 family protein  22.9 
 
 
1006 aa  52.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0079  transposase Tn3 family protein  22.9 
 
 
1006 aa  52.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>