61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4119 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_4119  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  358  2e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  72.41 
 
 		 961 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1567  transposase  72.41 
 
 		 358 aa  213  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.385647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4307  hypothetical protein  55.63 
 
 		 400 aa  167  6e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3676  transposase Tn3 family protein  55.56 
 
 		 772 aa  148  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.635368 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  30.34 
 
 		 1015 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  23.97 
 
 		 990 aa  55.5  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  23.97 
 
 		 990 aa  55.5  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3465  transposase Tn3 family protein  23.97 
 
 		 526 aa  55.1  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  23.97 
 
 		 990 aa  55.1  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  23.97 
 
 		 990 aa  55.5  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  23.97 
 
 		 990 aa  55.5  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  23.61 
 
 		 990 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  23.61 
 
 		 990 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  26.71 
 
 		 988 aa  51.6  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  23.91 
 
 		 988 aa  51.2  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  24.83 
 
 		 983 aa  50.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3715  transposase Tn3 family protein  26.24 
 
 		 731 aa  50.4  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  25.81 
 
 		 987 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  27.27 
 
 		 992 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  27.27 
 
 		 992 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  23.44 
 
 		 994 aa  47.8  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  25.34 
 
 		 988 aa  47.8  0.00009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  24.71 
 
 		 988 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  26.14 
 
 		 988 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  26.4 
 
 		 988 aa  47.4  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  23.49 
 
 		 988 aa  47.4  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2083  transposase Tn3 family protein  23.44 
 
 		 440 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  23.44 
 
 		 994 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  24.71 
 
 		 988 aa  47.4  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  23.49 
 
 		 988 aa  47.4  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  24.71 
 
 		 988 aa  47.4  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  24.71 
 
 		 988 aa  47.4  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  26.14 
 
 		 964 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  23.44 
 
 		 994 aa  46.6  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  25.34 
 
 		 988 aa  46.2  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  23.44 
 
 		 862 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  29.77 
 
 		 988 aa  45.8  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  24.31 
 
 		 988 aa  46.2  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  23.97 
 
 		 989 aa  46.2  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  24.31 
 
 		 988 aa  46.2  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  29.77 
 
 		 988 aa  45.8  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  29.77 
 
 		 988 aa  45.8  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  23.61 
 
 		 988 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  23.61 
 
 		 988 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0197  transposase  23.68 
 
 		 523 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  22.69 
 
 		 992 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  21.09 
 
 		 985 aa  41.6  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  27.14 
 
 		 991 aa  41.6  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  27.14 
 
 		 991 aa  41.6  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1842  transposase Tn3 family protein  22.38 
 
 		 1012 aa  41.6  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.550818  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  22.92 
 
 		 989 aa  41.6  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  24.17 
 
 		 996 aa  41.6  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0238  transposase  22.76 
 
 		 613 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0203  transposase  24.11 
 
 		 738 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000452446 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  24 
 
 		 996 aa  41.2  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  24.35 
 
 		 983 aa  41.2  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  24 
 
 		 996 aa  41.2  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  24 
 
 		 996 aa  41.2  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2486  transposase Tn3  27.42 
 
 		 1013 aa  41.2  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147103  normal  0.0287681 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  21.59 
 
 		 755 aa  40.8  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>