198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2347 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2347  transposase Tn3  100 
 
 		 916 aa  1778    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.669911  normal  0.26387 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19600  transposase, TnpA family  51.16 
 
 		 1028 aa  715    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.546457  normal  0.0923144 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4723  transposase, Tn3 family  60.09 
 
 		 1075 aa  885    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  41.42 
 
 		 997 aa  568  1e-160  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  42.03 
 
 		 1006 aa  564  1.0000000000000001e-159  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  42.61 
 
 		 991 aa  546  1e-154  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  42.61 
 
 		 991 aa  546  1e-154  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5398  transposase Tn3 family protein  37.84 
 
 		 1029 aa  434  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0815937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  44.74 
 
 		 771 aa  341  2.9999999999999998e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4775  transposase Tn3 family protein  45.54 
 
 		 838 aa  298  3e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.855357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  29.21 
 
 		 987 aa  282  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  27.44 
 
 		 983 aa  260  1e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  29.69 
 
 		 1015 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  30.58 
 
 		 988 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  30.48 
 
 		 988 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  29.96 
 
 		 988 aa  255  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  29.63 
 
 		 988 aa  255  3e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  29.63 
 
 		 988 aa  255  3e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  30.33 
 
 		 988 aa  253  9.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0079  transposase  47.62 
 
 		 435 aa  252  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.776565  normal  0.783345 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  29.16 
 
 		 990 aa  251  4e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  28.98 
 
 		 990 aa  249  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  28.98 
 
 		 990 aa  249  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  29.03 
 
 		 990 aa  248  3e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  29.03 
 
 		 990 aa  248  3e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  29.03 
 
 		 990 aa  248  3e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  28.52 
 
 		 985 aa  246  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  29.98 
 
 		 988 aa  245  3e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  29.17 
 
 		 990 aa  245  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  29.35 
 
 		 989 aa  244  6e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  29.66 
 
 		 988 aa  242  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  29.66 
 
 		 988 aa  242  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  29.66 
 
 		 988 aa  242  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  29.66 
 
 		 988 aa  242  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  29.84 
 
 		 988 aa  242  2.9999999999999997e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  28.86 
 
 		 988 aa  241  5.999999999999999e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  28.86 
 
 		 988 aa  241  5.999999999999999e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  29.78 
 
 		 988 aa  240  1e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  29 
 
 		 989 aa  239  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  29.79 
 
 		 964 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  24.94 
 
 		 992 aa  221  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  29.12 
 
 		 988 aa  221  5e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  29.12 
 
 		 988 aa  221  5e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  29.12 
 
 		 988 aa  221  5e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  27.29 
 
 		 994 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  28.11 
 
 		 994 aa  210  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  27.29 
 
 		 994 aa  209  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4930  transposase Tn3 family protein  45.48 
 
 		 492 aa  207  6e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142055  normal  0.882247 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3666  transposase Tn3 family protein  31.53 
 
 		 924 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376312  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  30.78 
 
 		 976 aa  201  3.9999999999999996e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  29.43 
 
 		 968 aa  200  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  27.52 
 
 		 991 aa  197  5.000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  27.52 
 
 		 991 aa  197  5.000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  26.62 
 
 		 988 aa  196  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  27.21 
 
 		 862 aa  190  9e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  28.29 
 
 		 961 aa  188  5e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3715  transposase Tn3 family protein  25.35 
 
 		 731 aa  187  7e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3567  transposase Tn3 family protein  28.78 
 
 		 877 aa  187  7e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0660182  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  30.38 
 
 		 755 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0203  transposase  23.21 
 
 		 738 aa  185  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000452446 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  27.31 
 
 		 991 aa  179  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1821  transposase Tn3 family protein  24.17 
 
 		 612 aa  177  8e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  26.57 
 
 		 999 aa  175  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  28.36 
 
 		 992 aa  174  5e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  28.36 
 
 		 992 aa  174  5e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  28.38 
 
 		 996 aa  167  5.9999999999999996e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  27.57 
 
 		 988 aa  167  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  27.71 
 
 		 988 aa  167  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  26.19 
 
 		 983 aa  163  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  32.2 
 
 		 606 aa  160  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  27.8 
 
 		 996 aa  160  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  27.8 
 
 		 996 aa  160  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  27.8 
 
 		 996 aa  160  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0116  transposase Tn3 family protein  23.71 
 
 		 1018 aa  158  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3764  Tn3 family transposase  57.38 
 
 		 154 aa  157  7e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00623  transposase  24.13 
 
 		 986 aa  151  5e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2106  transposase  25.25 
 
 		 1059 aa  149  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.818957  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0238  transposase  22.26 
 
 		 613 aa  148  5e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3470  transposase Tn3 family protein  24.1 
 
 		 1028 aa  147  8.000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35740  putative transposase  23.62 
 
 		 1004 aa  146  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000831562  decreased coverage  4.65352e-19 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3065  transposase  23.62 
 
 		 1004 aa  146  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0192  transposase Tn3 family protein  24.1 
 
 		 1026 aa  146  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1989  transposase Tn3 family protein  24.1 
 
 		 1026 aa  146  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4556  transposase Tn3 family protein  23.98 
 
 		 1028 aa  145  4e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.875652 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2107  transposase Tn3 family protein  23.48 
 
 		 1007 aa  141  4.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2394  transposase Tn3 family protein  23.48 
 
 		 1007 aa  141  4.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5050  transposase Tn3 family protein  25.1 
 
 		 999 aa  140  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1731  transposase Tn3 family protein  25.1 
 
 		 999 aa  140  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.473502  normal  0.357058 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4443  transposase Tn3 family protein  25.1 
 
 		 999 aa  140  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.597289  normal  0.3426 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02944  Tn5044 transposase  23.43 
 
 		 990 aa  140  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0926862  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4333  transposase Tn3 family protein  25.1 
 
 		 999 aa  140  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0519662 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  30.42 
 
 		 550 aa  135  5e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4307  transposase Tn3 family protein  22.14 
 
 		 995 aa  134  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5358  transposase Tn3 family protein  21.41 
 
 		 990 aa  133  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17398 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0197  transposase  21.93 
 
 		 523 aa  128  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4667  transposase  55.36 
 
 		 123 aa  125  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2486  transposase Tn3  22.7 
 
 		 1013 aa  124  6e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147103  normal  0.0287681 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4363  transposase Tn3 family protein  21.7 
 
 		 995 aa  124  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0457124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0215  transposase  20.51 
 
 		 1015 aa  121  7e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  0.20757 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3676  transposase Tn3 family protein  27.04 
 
 		 772 aa  119  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.635368 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>