186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5125 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010815  Glov_3698  transposase Tn3 family protein  48.91 
 
 
974 aa  865    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0861191  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3661  transposase Tn3 family protein  44.43 
 
 
950 aa  692    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3695  transposase Tn3 family protein  42.92 
 
 
969 aa  720    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5125  transposase Tn3 family protein  100 
 
 
874 aa  1788    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5067  transposase Tn3 family protein  84.39 
 
 
969 aa  1502    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0388929  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2112  transposase Tn3 family protein  45.08 
 
 
988 aa  724    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3614  transposase Tn3 family protein  36.87 
 
 
1009 aa  563  1.0000000000000001e-159  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2367  transposase Tn3  43.79 
 
 
815 aa  558  1e-157  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5222  transposase Tn3 family protein  55.13 
 
 
412 aa  365  3e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2035  transposase Tn3 family protein  35.41 
 
 
659 aa  344  5e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200024  normal  0.850327 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1095  putative transposase  61.54 
 
 
332 aa  305  3.0000000000000004e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0110923 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5219  transposase Tn3 family protein  33.27 
 
 
570 aa  292  2e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  25.49 
 
 
983 aa  232  3e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4148  TnpA family transposase  52.86 
 
 
365 aa  228  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.160216  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  25.37 
 
 
988 aa  226  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  24.66 
 
 
992 aa  223  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  25.62 
 
 
1015 aa  217  8e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  24.06 
 
 
1006 aa  213  2e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  24.35 
 
 
987 aa  212  3e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  25.36 
 
 
988 aa  204  5e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  25.36 
 
 
988 aa  204  5e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  25.36 
 
 
988 aa  204  5e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  25.12 
 
 
988 aa  199  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6852  transposase Tn3 family protein  23.48 
 
 
994 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  23.81 
 
 
988 aa  198  3e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  23.81 
 
 
988 aa  198  3e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  25.12 
 
 
988 aa  198  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1226  transposase Tn3  23.93 
 
 
993 aa  193  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6606  transposase Tn3 family protein  23.93 
 
 
993 aa  193  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0187013 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3567  transposase Tn3 family protein  25.74 
 
 
877 aa  192  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0660182  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0237  transposase, putative  29.31 
 
 
499 aa  191  7e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0198  transposase, putative  29.31 
 
 
499 aa  191  7e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  25.03 
 
 
990 aa  189  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  25.03 
 
 
990 aa  189  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  24.74 
 
 
988 aa  187  5e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  24.43 
 
 
985 aa  185  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  24.28 
 
 
994 aa  184  5.0000000000000004e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  24.22 
 
 
988 aa  182  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  24.66 
 
 
988 aa  182  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  24.14 
 
 
988 aa  181  4e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  23.61 
 
 
988 aa  181  4e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  24.52 
 
 
989 aa  181  7e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  23.61 
 
 
988 aa  180  8e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  24.38 
 
 
994 aa  180  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  24.15 
 
 
988 aa  179  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  24.15 
 
 
988 aa  179  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  24.15 
 
 
988 aa  179  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  23.95 
 
 
964 aa  179  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  24.38 
 
 
994 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  24.15 
 
 
988 aa  179  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  24.55 
 
 
990 aa  179  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  24.89 
 
 
988 aa  178  3e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  24.46 
 
 
990 aa  177  6e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  24.46 
 
 
990 aa  177  6e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  24.46 
 
 
990 aa  177  6e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  24.46 
 
 
990 aa  177  8e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  23.16 
 
 
988 aa  177  9e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  23.16 
 
 
988 aa  177  9e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  23.69 
 
 
991 aa  176  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  23.69 
 
 
991 aa  176  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4307  transposase Tn3 family protein  22.61 
 
 
995 aa  174  7.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2107  transposase Tn3 family protein  23.44 
 
 
1007 aa  174  9e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2394  transposase Tn3 family protein  23.44 
 
 
1007 aa  174  9e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  24.42 
 
 
862 aa  173  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0025  transposase Tn3 family protein  24.18 
 
 
1006 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0079  transposase Tn3 family protein  24.18 
 
 
1006 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  24.36 
 
 
961 aa  172  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  25.76 
 
 
991 aa  171  4e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  25.76 
 
 
991 aa  171  4e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1731  transposase Tn3 family protein  23.83 
 
 
999 aa  169  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.473502  normal  0.357058 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5050  transposase Tn3 family protein  23.83 
 
 
999 aa  169  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4443  transposase Tn3 family protein  23.83 
 
 
999 aa  169  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.597289  normal  0.3426 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4333  transposase Tn3 family protein  23.83 
 
 
999 aa  169  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0519662 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  24.92 
 
 
999 aa  168  5e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2512  transposase Tn3  22.38 
 
 
989 aa  165  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227381  normal  0.0913005 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5358  transposase Tn3 family protein  21.4 
 
 
990 aa  164  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17398 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  26.1 
 
 
755 aa  163  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4363  transposase Tn3 family protein  21.57 
 
 
995 aa  163  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0457124  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02944  Tn5044 transposase  25.36 
 
 
990 aa  163  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0926862  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00623  transposase  21.49 
 
 
986 aa  160  8e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  23.95 
 
 
989 aa  160  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1639  transposase Tn3 family protein  24.69 
 
 
977 aa  160  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0647401  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5280  transposase Tn3 family protein  24.69 
 
 
977 aa  160  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2964  Tn4652, transposase  23.61 
 
 
1004 aa  157  6e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0744329 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  24.97 
 
 
996 aa  155  4e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2486  transposase Tn3  22.15 
 
 
1013 aa  154  7e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147103  normal  0.0287681 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  24.16 
 
 
991 aa  154  8.999999999999999e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  26.2 
 
 
606 aa  153  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0203  transposase  24.06 
 
 
738 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000452446 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  27.27 
 
 
550 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2106  transposase  24.77 
 
 
1059 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.818957  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  24.78 
 
 
996 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  24.78 
 
 
996 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  24.78 
 
 
996 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  24.43 
 
 
976 aa  148  5e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35740  putative transposase  21.81 
 
 
1004 aa  145  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000831562  decreased coverage  4.65352e-19 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3065  transposase  21.81 
 
 
1004 aa  145  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4134  transposase Tn3 family protein  23.61 
 
 
1028 aa  143  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.160281  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2470  transposase Tn3  24.04 
 
 
977 aa  141  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0197511 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1323  transposase Tn3 family protein  29.05 
 
 
989 aa  139  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.32373 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>