123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2035 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2035  transposase Tn3 family protein  100 
 
 
659 aa  1320    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200024  normal  0.850327 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3614  transposase Tn3 family protein  39.08 
 
 
1009 aa  430  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3661  transposase Tn3 family protein  40.68 
 
 
950 aa  394  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3695  transposase Tn3 family protein  35.48 
 
 
969 aa  395  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3698  transposase Tn3 family protein  34.96 
 
 
974 aa  386  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0861191  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2112  transposase Tn3 family protein  40.5 
 
 
988 aa  373  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5125  transposase Tn3 family protein  35.04 
 
 
874 aa  344  2.9999999999999997e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5219  transposase Tn3 family protein  36.51 
 
 
570 aa  340  2.9999999999999998e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5067  transposase Tn3 family protein  33.64 
 
 
969 aa  335  2e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0388929  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2367  transposase Tn3  43.92 
 
 
815 aa  327  6e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0198  transposase, putative  31.73 
 
 
499 aa  270  4e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0237  transposase, putative  31.73 
 
 
499 aa  270  4e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1787  hypothetical protein  38.26 
 
 
319 aa  150  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  24.53 
 
 
1006 aa  122  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  24.01 
 
 
987 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  25.08 
 
 
1015 aa  111  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  22.98 
 
 
988 aa  109  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  23.57 
 
 
988 aa  108  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  23.57 
 
 
988 aa  108  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  23.57 
 
 
988 aa  108  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  23.41 
 
 
988 aa  108  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  23.57 
 
 
988 aa  108  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3715  transposase Tn3 family protein  22.07 
 
 
731 aa  107  8e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  23.38 
 
 
994 aa  107  9e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  23.2 
 
 
988 aa  106  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  23.1 
 
 
994 aa  104  5e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  23.1 
 
 
994 aa  104  7e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  23.54 
 
 
990 aa  103  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  23.54 
 
 
990 aa  103  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  23.42 
 
 
988 aa  102  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2394  transposase Tn3 family protein  22.82 
 
 
1007 aa  102  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2107  transposase Tn3 family protein  22.82 
 
 
1007 aa  102  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  22.87 
 
 
989 aa  102  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  22.78 
 
 
990 aa  101  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  22.78 
 
 
990 aa  101  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  22.78 
 
 
990 aa  101  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  22.78 
 
 
990 aa  102  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  22.78 
 
 
990 aa  101  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  25.3 
 
 
991 aa  100  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  25.3 
 
 
991 aa  100  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0203  transposase  22.03 
 
 
738 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000452446 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  21.93 
 
 
992 aa  97.4  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  22.64 
 
 
964 aa  97.1  9e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  22.52 
 
 
989 aa  95.5  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  22.15 
 
 
988 aa  94.4  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  22.15 
 
 
988 aa  94.4  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  23.3 
 
 
862 aa  94  8e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35740  putative transposase  21.4 
 
 
1004 aa  93.2  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000831562  decreased coverage  4.65352e-19 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3065  transposase  21.4 
 
 
1004 aa  93.2  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4443  transposase Tn3 family protein  22.55 
 
 
999 aa  92.4  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.597289  normal  0.3426 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4333  transposase Tn3 family protein  22.55 
 
 
999 aa  92.4  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0519662 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1731  transposase Tn3 family protein  22.55 
 
 
999 aa  92.4  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.473502  normal  0.357058 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5050  transposase Tn3 family protein  22.55 
 
 
999 aa  92.4  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  22.73 
 
 
988 aa  91.3  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3465  transposase Tn3 family protein  23.58 
 
 
526 aa  90.5  9e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0197  transposase  22.39 
 
 
523 aa  88.2  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0238  transposase  22.39 
 
 
613 aa  87.8  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  24.02 
 
 
961 aa  87.4  8e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  22 
 
 
983 aa  87  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  23.29 
 
 
988 aa  86.3  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  23.29 
 
 
988 aa  86.3  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  23.7 
 
 
988 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  21.89 
 
 
985 aa  85.5  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1821  transposase Tn3 family protein  21.09 
 
 
612 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  28.71 
 
 
771 aa  79  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  23.09 
 
 
988 aa  77.8  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2106  transposase  21.37 
 
 
1059 aa  77.4  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.818957  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  24.24 
 
 
992 aa  77  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  24.24 
 
 
992 aa  77  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5358  transposase Tn3 family protein  21.04 
 
 
990 aa  75.1  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17398 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  25.12 
 
 
988 aa  72.8  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  25.12 
 
 
988 aa  72.8  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  25.12 
 
 
988 aa  72.8  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  23.31 
 
 
988 aa  71.6  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  23.26 
 
 
755 aa  70.9  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  25.19 
 
 
996 aa  70.1  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2964  Tn4652, transposase  21.44 
 
 
1004 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0744329 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  25.34 
 
 
996 aa  68.2  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  25.34 
 
 
996 aa  68.2  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  25.34 
 
 
996 aa  68.2  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4723  transposase, Tn3 family  24.31 
 
 
1075 aa  67  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  21.61 
 
 
997 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1094  hypothetical protein  47.14 
 
 
107 aa  64.3  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0095899 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5222  transposase Tn3 family protein  45.95 
 
 
412 aa  64.3  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  26 
 
 
550 aa  62.8  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2470  transposase Tn3  23.53 
 
 
977 aa  61.2  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0197511 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  24.38 
 
 
991 aa  60.1  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  24.38 
 
 
991 aa  60.1  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1323  transposase Tn3 family protein  26.1 
 
 
989 aa  60.1  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.32373 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19600  transposase, TnpA family  24.57 
 
 
1028 aa  60.1  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.546457  normal  0.0923144 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  24.75 
 
 
976 aa  58.2  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1567  transposase  25.08 
 
 
358 aa  57.8  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.385647  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1842  transposase Tn3 family protein  21.46 
 
 
1012 aa  57.8  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.550818  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  26.34 
 
 
968 aa  57  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2347  transposase Tn3  29.88 
 
 
916 aa  55.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.669911  normal  0.26387 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  27.66 
 
 
991 aa  55.5  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00623  transposase  21.82 
 
 
986 aa  54.7  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5398  transposase Tn3 family protein  24.21 
 
 
1029 aa  54.7  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0815937  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3666  transposase Tn3 family protein  23.2 
 
 
924 aa  54.3  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376312  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1962  transposase Tn3 family protein  21.36 
 
 
929 aa  53.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>