84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3677 on replicon NC_009955
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009955  Dshi_3677  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  352  2e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.472291 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4307  hypothetical protein  72.99 
 
 		 400 aa  266  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  63.79 
 
 		 961 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1567  transposase  63.22 
 
 		 358 aa  231  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.385647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  48.28 
 
 		 992 aa  161  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  48.28 
 
 		 992 aa  161  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  38.1 
 
 		 992 aa  123  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  41.57 
 
 		 996 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  41.57 
 
 		 996 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  41.57 
 
 		 996 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  39.66 
 
 		 989 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  41.57 
 
 		 996 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  38.64 
 
 		 988 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  38.98 
 
 		 988 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  38.98 
 
 		 988 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  36.21 
 
 		 988 aa  114  8.999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  36.78 
 
 		 988 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  36.78 
 
 		 983 aa  112  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  36.21 
 
 		 988 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  36.21 
 
 		 988 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  36.78 
 
 		 989 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  36.21 
 
 		 988 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  36.21 
 
 		 988 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  37.93 
 
 		 990 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  37.93 
 
 		 990 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  36.21 
 
 		 988 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  38.42 
 
 		 988 aa  111  5e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  38.2 
 
 		 988 aa  111  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  38.2 
 
 		 988 aa  111  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  38.2 
 
 		 988 aa  111  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  37.36 
 
 		 990 aa  110  7.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3465  transposase Tn3 family protein  37.93 
 
 		 526 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  38.79 
 
 		 983 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  37.93 
 
 		 990 aa  110  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  37.36 
 
 		 990 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  37.36 
 
 		 990 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3715  transposase Tn3 family protein  34.66 
 
 		 731 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  37.36 
 
 		 990 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  37.06 
 
 		 1015 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  38.18 
 
 		 999 aa  108  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  35.06 
 
 		 985 aa  107  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  38.18 
 
 		 991 aa  107  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  35.59 
 
 		 988 aa  105  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  35.03 
 
 		 988 aa  104  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  35.03 
 
 		 988 aa  104  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  35.03 
 
 		 988 aa  103  9e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  36.36 
 
 		 991 aa  102  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  36.36 
 
 		 991 aa  102  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0203  transposase  35.67 
 
 		 738 aa  100  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000452446 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  34.71 
 
 		 988 aa  100  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1821  transposase Tn3 family protein  35.88 
 
 		 612 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1051  transposase Tn3  34.1 
 
 		 171 aa  97.8  6e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  33.53 
 
 		 987 aa  97.8  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  34.48 
 
 		 964 aa  97.4  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  32.66 
 
 		 994 aa  82  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2083  transposase Tn3 family protein  30.46 
 
 		 440 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  30.46 
 
 		 994 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  30.46 
 
 		 994 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19600  transposase, TnpA family  34.51 
 
 		 1028 aa  74.7  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.546457  normal  0.0923144 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3567  transposase Tn3 family protein  29.59 
 
 		 877 aa  73.6  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0660182  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4124  transposase Tn3  50 
 
 		 102 aa  70.9  0.000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0632177 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2347  transposase Tn3  32.17 
 
 		 916 aa  70.5  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.669911  normal  0.26387 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4723  transposase, Tn3 family  33.57 
 
 		 1075 aa  69.3  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  32.1 
 
 		 771 aa  67  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  30.95 
 
 		 991 aa  66.6  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  30.95 
 
 		 991 aa  66.6  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3975  hypothetical protein  30.86 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  30.99 
 
 		 988 aa  62.8  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  30.99 
 
 		 988 aa  62.8  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  30.67 
 
 		 1006 aa  61.6  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  27.5 
 
 		 968 aa  59.7  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  30.18 
 
 		 997 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4930  transposase Tn3 family protein  30.87 
 
 		 492 aa  57  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142055  normal  0.882247 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0237  transposase, putative  22.37 
 
 		 499 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0198  transposase, putative  22.37 
 
 		 499 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5219  transposase Tn3 family protein  30.69 
 
 		 570 aa  49.3  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5398  transposase Tn3 family protein  29.76 
 
 		 1029 aa  48.9  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0815937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5543  hypothetical protein  26.83 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.661737 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5075  transposase Tn3 family protein  33.64 
 
 		 972 aa  46.6  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4667  transposase  30.93 
 
 		 123 aa  44.3  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4775  transposase Tn3 family protein  33.33 
 
 		 838 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.855357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1877  transposase Tn3  26.92 
 
 		 409 aa  41.6  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0645  transposase Tn3 family protein  33.33 
 
 		 970 aa  42  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0794164 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1787  hypothetical protein  24.68 
 
 		 319 aa  41.2  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>