80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6366 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6366  transposase  100 
 
 		 260 aa  521  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.714765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  51.32 
 
 		 968 aa  195  5.000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4142  putative transposase  52.76 
 
 		 423 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  41.28 
 
 		 976 aa  104  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  34.62 
 
 		 1006 aa  100  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1821  transposase Tn3 family protein  30.37 
 
 		 612 aa  97.1  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7878  hypothetical protein  66.67 
 
 		 67 aa  87  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  31.28 
 
 		 988 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  30.04 
 
 		 994 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  30.04 
 
 		 994 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2083  transposase Tn3 family protein  30.04 
 
 		 440 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  32.18 
 
 		 988 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  30.33 
 
 		 988 aa  77.8  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  30.33 
 
 		 988 aa  77.8  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0203  transposase  26.48 
 
 		 738 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000452446 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  31.67 
 
 		 994 aa  73.6  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  31.32 
 
 		 771 aa  73.6  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19600  transposase, TnpA family  30.77 
 
 		 1028 aa  72  0.000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.546457  normal  0.0923144 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  29.27 
 
 		 985 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3666  transposase Tn3 family protein  43.82 
 
 		 924 aa  70.5  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376312  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  27.03 
 
 		 1015 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1051  transposase Tn3  29.59 
 
 		 171 aa  68.9  0.00000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3663  hypothetical protein  39.42 
 
 		 150 aa  67.4  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.192823  normal  0.116734 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  24.88 
 
 		 983 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4930  transposase Tn3 family protein  32.46 
 
 		 492 aa  65.5  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142055  normal  0.882247 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  31.87 
 
 		 988 aa  65.1  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  31.87 
 
 		 988 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  31.87 
 
 		 988 aa  65.1  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  31.87 
 
 		 988 aa  65.1  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  28.96 
 
 		 988 aa  63.9  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  28.44 
 
 		 988 aa  63.9  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  31.4 
 
 		 988 aa  63.2  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  31.4 
 
 		 988 aa  63.2  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  31.4 
 
 		 988 aa  63.2  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2347  transposase Tn3  30.45 
 
 		 916 aa  63.2  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.669911  normal  0.26387 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4723  transposase, Tn3 family  32.37 
 
 		 1075 aa  62.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  25.98 
 
 		 988 aa  62.4  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  25.98 
 
 		 988 aa  62.4  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  31.25 
 
 		 989 aa  62.4  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  23 
 
 		 987 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  31.25 
 
 		 988 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  37.38 
 
 		 964 aa  60.1  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  28.38 
 
 		 990 aa  59.3  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  28.38 
 
 		 990 aa  59.3  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  28.38 
 
 		 990 aa  59.3  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3465  transposase Tn3 family protein  28.38 
 
 		 526 aa  58.9  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  31.3 
 
 		 991 aa  58.9  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  28.38 
 
 		 990 aa  58.5  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  25.97 
 
 		 991 aa  58.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  25.97 
 
 		 991 aa  58.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  28 
 
 		 990 aa  57.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  28.64 
 
 		 996 aa  56.6  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  28.64 
 
 		 996 aa  56.6  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  28.64 
 
 		 996 aa  56.6  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  28.43 
 
 		 999 aa  56.2  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  27.45 
 
 		 988 aa  56.2  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  30.65 
 
 		 996 aa  56.2  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  27.93 
 
 		 990 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  27.93 
 
 		 990 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3715  transposase Tn3 family protein  23.56 
 
 		 731 aa  55.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  37.86 
 
 		 988 aa  54.3  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  25.38 
 
 		 992 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  27.68 
 
 		 991 aa  53.5  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5398  transposase Tn3 family protein  28.87 
 
 		 1029 aa  53.5  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0815937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  26.29 
 
 		 992 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  26.29 
 
 		 992 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  27.68 
 
 		 991 aa  53.5  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3567  transposase Tn3 family protein  25.93 
 
 		 877 aa  53.1  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0660182  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  33.33 
 
 		 989 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00623  transposase  29.32 
 
 		 986 aa  50.4  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1877  transposase Tn3  26.44 
 
 		 409 aa  49.3  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  27.14 
 
 		 997 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2512  transposase Tn3  26.21 
 
 		 989 aa  48.5  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227381  normal  0.0913005 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5219  transposase Tn3 family protein  26.37 
 
 		 570 aa  47  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4363  transposase Tn3 family protein  27.78 
 
 		 995 aa  46.6  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0457124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6852  transposase Tn3 family protein  24.75 
 
 		 994 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3975  hypothetical protein  21.58 
 
 		 236 aa  45.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  26.39 
 
 		 983 aa  44.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4307  hypothetical protein  24.74 
 
 		 400 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1787  hypothetical protein  25.3 
 
 		 319 aa  43.5  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>