57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3663 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3663  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  301  2.0000000000000002e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.192823  normal  0.116734 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  96 
 
 		 976 aa  177  5.999999999999999e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  43.08 
 
 		 968 aa  89.7  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6366  transposase  39.42 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.714765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3606  hypothetical protein  93.75 
 
 		 32 aa  63.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0208163  normal  0.0381923 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  33.33 
 
 		 1006 aa  63.2  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  30.89 
 
 		 991 aa  60.5  0.000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  30.89 
 
 		 991 aa  60.5  0.000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4930  transposase Tn3 family protein  32.52 
 
 		 492 aa  55.1  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142055  normal  0.882247 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4142  putative transposase  40.79 
 
 		 423 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  30.36 
 
 		 961 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5219  transposase Tn3 family protein  31 
 
 		 570 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  34.43 
 
 		 1015 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  37.38 
 
 		 992 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  37.38 
 
 		 992 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1567  transposase  30.93 
 
 		 358 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.385647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  28.8 
 
 		 991 aa  47  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  35.77 
 
 		 988 aa  47  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3677  hypothetical protein  33.33 
 
 		 174 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.472291 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  26.05 
 
 		 771 aa  45.4  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4307  hypothetical protein  30.33 
 
 		 400 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  30 
 
 		 997 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  28.4 
 
 		 987 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  31.82 
 
 		 989 aa  44.7  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  30.4 
 
 		 999 aa  44.3  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7878  hypothetical protein  43.75 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  29.85 
 
 		 988 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  30.3 
 
 		 990 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  30.3 
 
 		 990 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  30.21 
 
 		 983 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  32.22 
 
 		 994 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2083  transposase Tn3 family protein  32.22 
 
 		 440 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  32.22 
 
 		 994 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  30.3 
 
 		 990 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  30.3 
 
 		 990 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  31.34 
 
 		 988 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  31.34 
 
 		 988 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  40 
 
 		 994 aa  42.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0769  transposase Tn3 family protein  32.58 
 
 		 94 aa  41.6  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  33.62 
 
 		 989 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3465  transposase Tn3 family protein  29.23 
 
 		 526 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  31.11 
 
 		 988 aa  41.6  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  31.11 
 
 		 988 aa  41.6  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  31.11 
 
 		 988 aa  41.6  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  31.11 
 
 		 988 aa  41.6  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  31.75 
 
 		 988 aa  41.6  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  29.23 
 
 		 990 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0203  transposase  32.79 
 
 		 738 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000452446 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  31.3 
 
 		 988 aa  41.2  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  29.23 
 
 		 990 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  29.23 
 
 		 990 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5398  transposase Tn3 family protein  27.27 
 
 		 1029 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0815937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  28.46 
 
 		 985 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  30.37 
 
 		 988 aa  40.4  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  32.73 
 
 		 988 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1051  transposase Tn3  34.43 
 
 		 171 aa  40  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  35.45 
 
 		 988 aa  40  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>