131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_A0102 on replicon NC_010660
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010660  SbBS512_A0102  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  274  3e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  41.94 
 
 		 991 aa  75.1  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  39.8 
 
 		 991 aa  74.3  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  39.8 
 
 		 991 aa  74.3  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  38.46 
 
 		 988 aa  74.3  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  38.46 
 
 		 988 aa  74.3  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3347  transposase Tn3  41.57 
 
 		 161 aa  73.9  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0077216  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5050  TnpA family transposase  41.57 
 
 		 264 aa  73.9  0.0000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  40 
 
 		 999 aa  73.6  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  39.13 
 
 		 992 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  38.2 
 
 		 988 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  38.2 
 
 		 988 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  39.33 
 
 		 964 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  39.33 
 
 		 990 aa  70.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  39.33 
 
 		 990 aa  70.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  38.2 
 
 		 988 aa  70.5  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  38.2 
 
 		 989 aa  70.5  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  38.2 
 
 		 988 aa  70.5  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  38.2 
 
 		 988 aa  70.5  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3995  Tn3 family transposase  38.71 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1277  Tn3 family transposase  38.71 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3243  Tn3 family transposase  38.71 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.744119  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  38.2 
 
 		 988 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  39.33 
 
 		 988 aa  70.5  0.000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  38.2 
 
 		 988 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2317  transposase Tn3  38.2 
 
 		 339 aa  69.3  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000027108  hitchhiker  0.0000324498 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  38.2 
 
 		 755 aa  70.1  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3718  transposase Tn3 family protein  39.77 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.396342  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  38.2 
 
 		 990 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  38.2 
 
 		 990 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  38.2 
 
 		 990 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  38.2 
 
 		 990 aa  70.1  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  38.2 
 
 		 988 aa  70.1  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  38.2 
 
 		 990 aa  70.1  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  38.2 
 
 		 988 aa  68.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1822  transposase Tn3 family protein  34.31 
 
 		 371 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  38.2 
 
 		 988 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  38.64 
 
 		 988 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  38.64 
 
 		 988 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  38.64 
 
 		 606 aa  67  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0035  transposase  38.64 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.401081  normal  0.351265 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0150  Tn1721 transposase  38.64 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.751061 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1576  transposase  38.64 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0122395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3666  transposase Tn3 family protein  38.16 
 
 		 924 aa  65.1  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376312  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  38.16 
 
 		 976 aa  65.1  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  35.96 
 
 		 989 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  36.36 
 
 		 988 aa  63.5  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  36.36 
 
 		 988 aa  63.5  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  36.36 
 
 		 988 aa  63.5  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  31.87 
 
 		 961 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8035  transposase  35.79 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  35.23 
 
 		 988 aa  63.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  35.23 
 
 		 988 aa  63.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0072  transposase  31.87 
 
 		 546 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.520579  normal  0.363066 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  37.5 
 
 		 994 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  37.5 
 
 		 994 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  37.5 
 
 		 862 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0202  transposase  36.17 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.295684  hitchhiker  6.17068e-17 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  37.5 
 
 		 550 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  38.04 
 
 		 987 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  37.5 
 
 		 1015 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0196  transposase  36.17 
 
 		 338 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0239  transposase  36.17 
 
 		 246 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  37.08 
 
 		 1006 aa  61.2  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  38.2 
 
 		 997 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  38.64 
 
 		 983 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  32.08 
 
 		 996 aa  60.5  0.000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  35.96 
 
 		 771 aa  60.1  0.000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  35.23 
 
 		 994 aa  59.7  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  31.13 
 
 		 996 aa  59.7  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  31.13 
 
 		 996 aa  59.7  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  31.13 
 
 		 996 aa  59.7  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2047  transposase  35.11 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0355  transposase  35.96 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  35.96 
 
 		 988 aa  59.3  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0079  transposase  33.71 
 
 		 435 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.776565  normal  0.783345 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  35.56 
 
 		 992 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  35.56 
 
 		 992 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4366  TnpA family transposase  31.87 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.914851 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  36.67 
 
 		 991 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  36.67 
 
 		 991 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4311  TOBE domain-containing protein  32.97 
 
 		 573 aa  54.3  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  32.58 
 
 		 983 aa  53.9  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4723  transposase, Tn3 family  33.33 
 
 		 1075 aa  52.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  32.95 
 
 		 985 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5280  transposase Tn3 family protein  32.56 
 
 		 977 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4775  transposase Tn3 family protein  30.11 
 
 		 838 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.855357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1639  transposase Tn3 family protein  32.56 
 
 		 977 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0647401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3676  transposase Tn3 family protein  31.87 
 
 		 772 aa  51.6  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.635368 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01406  Transposase Tn3  30.68 
 
 		 267 aa  50.4  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0112  RNA-directed DNA polymerase  95.65 
 
 		 94 aa  50.1  0.000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.690611  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5358  transposase Tn3 family protein  26.67 
 
 		 990 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17398 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  37.33 
 
 		 968 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0215  transposase  36.67 
 
 		 1015 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  0.20757 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0086  IS2, transposase orfB, truncation  37.35 
 
 		 223 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0106176  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4112  transposase Tn3 family protein  31.82 
 
 		 1006 aa  47.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4556  transposase Tn3 family protein  33.33 
 
 		 1028 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.875652 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19600  transposase, TnpA family  32.61 
 
 		 1028 aa  47.4  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.546457  normal  0.0923144 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3470  transposase Tn3 family protein  33.33 
 
 		 1028 aa  47  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0192  transposase Tn3 family protein  33.33 
 
 		 1026 aa  47  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>