186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01406 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01406  Transposase Tn3  100 
 
 		 267 aa  554  1e-157  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4112  transposase Tn3 family protein  49.63 
 
 		 1006 aa  278  7e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3466  transposase Tn3 family protein  52.11 
 
 		 992 aa  276  3e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0116  transposase Tn3 family protein  49.44 
 
 		 1018 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0215  transposase  47.43 
 
 		 1015 aa  259  4e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  0.20757 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4556  transposase Tn3 family protein  45.11 
 
 		 1028 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.875652 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0192  transposase Tn3 family protein  44.74 
 
 		 1026 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1989  transposase Tn3 family protein  44.74 
 
 		 1026 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3470  transposase Tn3 family protein  44.74 
 
 		 1028 aa  239  4e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1962  transposase Tn3 family protein  45.08 
 
 		 929 aa  229  4e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4490  transposase Tn3 family protein  41.11 
 
 		 1010 aa  202  5e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.666147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4353  transposase Tn3 family protein  41.11 
 
 		 1010 aa  202  5e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5340  transposase  40.3 
 
 		 1009 aa  198  6e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1476  transposase Tn3 family protein  40.3 
 
 		 1009 aa  198  6e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000034033 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1851  transposase Tn3 family protein  40.3 
 
 		 1009 aa  198  6e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000277691 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4478  transposase Tn3 family protein  40.3 
 
 		 1009 aa  198  6e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000650614 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6457  transposase Tn3  41.04 
 
 		 1008 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3479  Tn5044 transposase  51.37 
 
 		 156 aa  155  6e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0051  hypothetical protein  36.09 
 
 		 1015 aa  150  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.107009  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02954  transposase  51.77 
 
 		 156 aa  150  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0191401  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4770  Tn5044 transposase  43.41 
 
 		 188 aa  144  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.653954 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  29.64 
 
 		 999 aa  122  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0072  transposase  29.3 
 
 		 546 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.520579  normal  0.363066 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3469  transposase Tn3 family protein  52.73 
 
 		 883 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  29.41 
 
 		 961 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02953  Transposase Tn3  52.29 
 
 		 831 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.225091  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  29.13 
 
 		 991 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  29.13 
 
 		 991 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  27.95 
 
 		 991 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_24  transposase  29.67 
 
 		 1019 aa  112  5e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.207727  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  27.41 
 
 		 983 aa  110  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0196  transposase  29.25 
 
 		 338 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  28.15 
 
 		 997 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  28.03 
 
 		 968 aa  106  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  27.56 
 
 		 988 aa  106  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  27.56 
 
 		 988 aa  106  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  28.63 
 
 		 988 aa  106  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  28.63 
 
 		 988 aa  106  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  28.63 
 
 		 988 aa  106  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  28.87 
 
 		 1006 aa  105  6e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02020  transposase  30.57 
 
 		 1019 aa  105  7e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  28.63 
 
 		 983 aa  105  8e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0239  transposase  31.08 
 
 		 246 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  28.02 
 
 		 988 aa  103  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  28.02 
 
 		 988 aa  103  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0202  transposase  30.63 
 
 		 246 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.295684  hitchhiker  6.17068e-17 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5358  transposase Tn3 family protein  29.6 
 
 		 990 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17398 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  28.63 
 
 		 771 aa  102  9e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  26.85 
 
 		 606 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0150  Tn1721 transposase  26.74 
 
 		 310 aa  101  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.751061 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  27.17 
 
 		 988 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  27.17 
 
 		 988 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  27.35 
 
 		 1015 aa  100  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  27.45 
 
 		 985 aa  99.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  29.32 
 
 		 987 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  29.88 
 
 		 976 aa  99.8  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3666  transposase Tn3 family protein  29.88 
 
 		 924 aa  99.8  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376312  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  29.41 
 
 		 992 aa  98.6  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  26.67 
 
 		 990 aa  98.2  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  26.67 
 
 		 990 aa  98.2  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  26.67 
 
 		 990 aa  98.2  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  26.67 
 
 		 755 aa  97.4  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  26.67 
 
 		 990 aa  97.1  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0035  transposase  27.27 
 
 		 255 aa  97.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.401081  normal  0.351265 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  27.64 
 
 		 550 aa  96.7  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  27.64 
 
 		 862 aa  96.7  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  26.67 
 
 		 990 aa  96.7  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  27.64 
 
 		 994 aa  96.7  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  27.64 
 
 		 994 aa  96.7  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  27.89 
 
 		 988 aa  96.7  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  26.67 
 
 		 990 aa  95.5  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  26.67 
 
 		 990 aa  95.5  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  26.77 
 
 		 988 aa  95.5  9e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1970  TnpA family transposase  27.47 
 
 		 1020 aa  95.1  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  26.38 
 
 		 989 aa  95.1  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  27.24 
 
 		 988 aa  94.7  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  26.38 
 
 		 988 aa  94.7  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3676  transposase Tn3 family protein  25.68 
 
 		 772 aa  94  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.635368 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0079  transposase Tn3 family protein  28.06 
 
 		 1006 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  26.38 
 
 		 964 aa  94  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0025  transposase Tn3 family protein  28.06 
 
 		 1006 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6928  transposase Tn3 family protein  28.57 
 
 		 1027 aa  94  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  25.98 
 
 		 988 aa  93.2  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  27.24 
 
 		 992 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  25.98 
 
 		 988 aa  93.2  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  25.98 
 
 		 988 aa  93.2  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  25.98 
 
 		 988 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6852  transposase Tn3 family protein  25.29 
 
 		 994 aa  93.2  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  27.24 
 
 		 992 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1822  transposase Tn3 family protein  26.95 
 
 		 371 aa  93.2  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  27.03 
 
 		 996 aa  93.2  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  26.95 
 
 		 988 aa  92.8  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4638  transposase  47.57 
 
 		 118 aa  92.8  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.655234 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  26.69 
 
 		 989 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0079  transposase  27.95 
 
 		 435 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.776565  normal  0.783345 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3718  transposase Tn3 family protein  28.24 
 
 		 305 aa  91.7  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.396342  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  27.34 
 
 		 996 aa  91.7  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  27.34 
 
 		 996 aa  91.7  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  27.34 
 
 		 996 aa  91.7  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  25.38 
 
 		 988 aa  90.9  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>