132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3469 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3466  transposase Tn3 family protein  100 
 
 		 992 aa  1726    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3469  transposase Tn3 family protein  100 
 
 		 883 aa  1831    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4112  transposase Tn3 family protein  47.73 
 
 		 1006 aa  802    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02953  Transposase Tn3  98.68 
 
 		 831 aa  1706    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.225091  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01418  Transposase Tn3  92.58 
 
 		 458 aa  591  1e-167  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000173243  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0215  transposase  32 
 
 		 1015 aa  424  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  0.20757 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0116  transposase Tn3 family protein  30.86 
 
 		 1018 aa  411  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3470  transposase Tn3 family protein  30.75 
 
 		 1028 aa  370  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0192  transposase Tn3 family protein  31.31 
 
 		 1026 aa  370  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1989  transposase Tn3 family protein  31.31 
 
 		 1026 aa  370  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4556  transposase Tn3 family protein  30.63 
 
 		 1028 aa  369  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.875652 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1962  transposase Tn3 family protein  31.52 
 
 		 929 aa  352  2e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4353  transposase Tn3 family protein  29.6 
 
 		 1010 aa  342  2e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4490  transposase Tn3 family protein  29.6 
 
 		 1010 aa  342  2e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.666147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4478  transposase Tn3 family protein  28.29 
 
 		 1009 aa  340  5e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000650614 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5340  transposase  28.29 
 
 		 1009 aa  340  5e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1476  transposase Tn3 family protein  28.29 
 
 		 1009 aa  340  5e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000034033 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1851  transposase Tn3 family protein  28.29 
 
 		 1009 aa  340  5e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000277691 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6457  transposase Tn3  28.5 
 
 		 1008 aa  340  5.9999999999999996e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02961  putative transposase  97.71 
 
 		 259 aa  275  2.0000000000000002e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000274404  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0051  hypothetical protein  26.27 
 
 		 1015 aa  260  7e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.107009  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_24  transposase  21.98 
 
 		 1019 aa  140  8.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.207727  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  25.27 
 
 		 968 aa  124  8e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1970  TnpA family transposase  20.44 
 
 		 1020 aa  119  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01406  Transposase Tn3  52.73 
 
 		 267 aa  119  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  22.8 
 
 		 985 aa  110  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3666  transposase Tn3 family protein  23.47 
 
 		 924 aa  103  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376312  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  23.6 
 
 		 976 aa  103  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  26.85 
 
 		 988 aa  101  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  27.97 
 
 		 997 aa  101  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02020  transposase  23.59 
 
 		 1019 aa  100  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  27.2 
 
 		 1006 aa  99.8  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  27.21 
 
 		 988 aa  99.8  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  21.26 
 
 		 990 aa  98.6  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  27.04 
 
 		 771 aa  98.2  6e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  20.97 
 
 		 990 aa  97.1  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  20.97 
 
 		 990 aa  97.1  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  20.97 
 
 		 990 aa  97.1  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  20.97 
 
 		 990 aa  96.7  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  21.31 
 
 		 990 aa  95.5  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6928  transposase Tn3 family protein  24.31 
 
 		 1027 aa  95.9  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  21.31 
 
 		 990 aa  95.5  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5398  transposase Tn3 family protein  27.69 
 
 		 1029 aa  94.7  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0815937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  23.76 
 
 		 988 aa  94.7  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  21.68 
 
 		 988 aa  92.4  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  21.68 
 
 		 988 aa  92.4  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  21.68 
 
 		 988 aa  92.4  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  20.9 
 
 		 988 aa  91.3  6e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  21.61 
 
 		 964 aa  90.5  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19600  transposase, TnpA family  25.99 
 
 		 1028 aa  90.1  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.546457  normal  0.0923144 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  21.34 
 
 		 988 aa  90.5  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0079  transposase  27.27 
 
 		 435 aa  90.5  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.776565  normal  0.783345 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3567  transposase Tn3 family protein  22.14 
 
 		 877 aa  88.2  6e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0660182  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  27.18 
 
 		 991 aa  87.8  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  27.18 
 
 		 991 aa  87.8  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  21.34 
 
 		 989 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  21.31 
 
 		 989 aa  87  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  29.81 
 
 		 988 aa  87.4  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  25.74 
 
 		 991 aa  87.4  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  25.74 
 
 		 991 aa  87.4  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2347  transposase Tn3  29.86 
 
 		 916 aa  86.3  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.669911  normal  0.26387 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  28.2 
 
 		 988 aa  85.5  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  28.2 
 
 		 988 aa  85.5  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  22.75 
 
 		 983 aa  84.3  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  27.76 
 
 		 988 aa  84  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4311  TOBE domain-containing protein  26.23 
 
 		 573 aa  84  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  22.2 
 
 		 755 aa  83.2  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  28.9 
 
 		 988 aa  82  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  20.02 
 
 		 988 aa  81.3  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  20.02 
 
 		 988 aa  81.3  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  20.02 
 
 		 988 aa  81.3  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  23.06 
 
 		 988 aa  81.3  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  23.06 
 
 		 988 aa  81.3  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  20.02 
 
 		 988 aa  81.3  0.00000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  23.41 
 
 		 988 aa  81.3  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  24.03 
 
 		 988 aa  80.9  0.00000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  25.75 
 
 		 1015 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  24.42 
 
 		 606 aa  80.1  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  25.42 
 
 		 994 aa  79.3  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  24.69 
 
 		 999 aa  79.3  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4723  transposase, Tn3 family  23.42 
 
 		 1075 aa  77  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  25.12 
 
 		 994 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  25.12 
 
 		 994 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  25.12 
 
 		 862 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0072  transposase  24.86 
 
 		 546 aa  74.7  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.520579  normal  0.363066 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  24.79 
 
 		 961 aa  74.3  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3676  transposase Tn3 family protein  24.62 
 
 		 772 aa  74.3  0.000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.635368 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  25.06 
 
 		 550 aa  72.8  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  25.32 
 
 		 992 aa  72  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  25.32 
 
 		 992 aa  72  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  22.97 
 
 		 996 aa  69.3  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  21.96 
 
 		 992 aa  66.6  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  23.2 
 
 		 996 aa  65.1  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  23.2 
 
 		 996 aa  65.1  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  23.2 
 
 		 996 aa  65.1  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  21.36 
 
 		 987 aa  64.7  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4775  transposase Tn3 family protein  28.57 
 
 		 838 aa  64.7  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.855357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3764  Tn3 family transposase  33.66 
 
 		 154 aa  64.3  0.000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  20.52 
 
 		 983 aa  63.5  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00623  transposase  28.03 
 
 		 986 aa  62.8  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>