193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_4112 on replicon NC_008738
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_3466  transposase Tn3 family protein  50.45 
 
 
992 aa  1019    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3469  transposase Tn3 family protein  47.73 
 
 
883 aa  802    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4112  transposase Tn3 family protein  100 
 
 
1006 aa  2095    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02953  Transposase Tn3  47.73 
 
 
831 aa  803    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.225091  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0116  transposase Tn3 family protein  34.69 
 
 
1018 aa  588  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0215  transposase  33.23 
 
 
1015 aa  553  1e-156  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal  0.20757 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3470  transposase Tn3 family protein  32.8 
 
 
1028 aa  511  1e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4556  transposase Tn3 family protein  32.71 
 
 
1028 aa  510  1e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.875652 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0192  transposase Tn3 family protein  32.9 
 
 
1026 aa  512  1e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1989  transposase Tn3 family protein  32.9 
 
 
1026 aa  512  1e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1962  transposase Tn3 family protein  33.7 
 
 
929 aa  496  1e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4490  transposase Tn3 family protein  29.86 
 
 
1010 aa  452  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.666147  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4353  transposase Tn3 family protein  29.86 
 
 
1010 aa  452  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6457  transposase Tn3  29.71 
 
 
1008 aa  443  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4478  transposase Tn3 family protein  28.95 
 
 
1009 aa  437  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000650614 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1851  transposase Tn3 family protein  28.95 
 
 
1009 aa  437  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000277691 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5340  transposase  28.95 
 
 
1009 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1476  transposase Tn3 family protein  28.95 
 
 
1009 aa  437  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000034033 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0051  hypothetical protein  26.97 
 
 
1015 aa  346  1e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.107009  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01406  Transposase Tn3  49.63 
 
 
267 aa  278  4e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01418  Transposase Tn3  40.74 
 
 
458 aa  249  2e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000173243  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_24  transposase  24.01 
 
 
1019 aa  214  9e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.207727  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3479  Tn5044 transposase  65.36 
 
 
156 aa  213  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02954  transposase  64.71 
 
 
156 aa  212  2e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0191401  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1970  TnpA family transposase  22.47 
 
 
1020 aa  197  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6928  transposase Tn3 family protein  23.81 
 
 
1027 aa  195  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02020  transposase  23.97 
 
 
1019 aa  189  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  24.21 
 
 
997 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  27.45 
 
 
968 aa  182  4e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  28.4 
 
 
988 aa  179  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  28.4 
 
 
988 aa  179  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  28.4 
 
 
988 aa  179  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  28.16 
 
 
991 aa  177  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  28.16 
 
 
991 aa  177  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3666  transposase Tn3 family protein  24.35 
 
 
924 aa  169  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376312  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  24.3 
 
 
976 aa  169  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  28.44 
 
 
1006 aa  168  5e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  27.29 
 
 
988 aa  167  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  27.29 
 
 
988 aa  167  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  26.07 
 
 
988 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  26.07 
 
 
988 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  26.39 
 
 
988 aa  163  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  26.75 
 
 
988 aa  162  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  26.75 
 
 
606 aa  162  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5398  transposase Tn3 family protein  28.47 
 
 
1029 aa  162  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0815937  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  28.25 
 
 
999 aa  161  6e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  26.57 
 
 
988 aa  160  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  25.55 
 
 
988 aa  160  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  28.31 
 
 
771 aa  159  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0079  transposase  28.5 
 
 
435 aa  160  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.776565  normal  0.783345 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  25.3 
 
 
964 aa  159  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  25.37 
 
 
988 aa  158  5.0000000000000005e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  27.93 
 
 
990 aa  158  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  27.93 
 
 
990 aa  158  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  25.46 
 
 
988 aa  157  9e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  27.7 
 
 
989 aa  157  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  25.18 
 
 
988 aa  156  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  25.18 
 
 
988 aa  156  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  25.18 
 
 
988 aa  156  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  25.18 
 
 
988 aa  156  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  25.39 
 
 
988 aa  155  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  25.5 
 
 
989 aa  154  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  27.36 
 
 
990 aa  154  8.999999999999999e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  27.36 
 
 
990 aa  154  8.999999999999999e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  27.36 
 
 
990 aa  154  8.999999999999999e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  27.5 
 
 
755 aa  153  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  27.36 
 
 
990 aa  153  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  28.33 
 
 
991 aa  152  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  24.46 
 
 
983 aa  152  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  27.6 
 
 
988 aa  151  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  24.7 
 
 
988 aa  151  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  27.59 
 
 
990 aa  151  6e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  25.05 
 
 
1015 aa  151  8e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  22.06 
 
 
991 aa  150  9e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  22.06 
 
 
991 aa  150  9e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  31.11 
 
 
988 aa  150  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  28.54 
 
 
961 aa  149  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  26.46 
 
 
994 aa  148  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  26.46 
 
 
994 aa  148  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  22.1 
 
 
987 aa  148  5e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  26.46 
 
 
862 aa  147  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  25.62 
 
 
994 aa  147  8.000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5358  transposase Tn3 family protein  23.13 
 
 
990 aa  147  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17398 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  25.7 
 
 
985 aa  147  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0072  transposase  28.54 
 
 
546 aa  146  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.520579  normal  0.363066 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  26.25 
 
 
550 aa  142  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02961  putative transposase  50.4 
 
 
259 aa  138  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000274404  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  24.29 
 
 
992 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4723  transposase, Tn3 family  23.46 
 
 
1075 aa  137  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  25.7 
 
 
983 aa  136  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4311  TOBE domain-containing protein  27.03 
 
 
573 aa  136  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4770  Tn5044 transposase  40.35 
 
 
188 aa  135  5e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.653954 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19600  transposase, TnpA family  23.94 
 
 
1028 aa  135  5e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.546457  normal  0.0923144 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  26.11 
 
 
992 aa  127  8.000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  26.11 
 
 
992 aa  127  8.000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3676  transposase Tn3 family protein  25 
 
 
772 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.635368 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  24.41 
 
 
996 aa  122  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0196  transposase  27.86 
 
 
338 aa  122  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6852  transposase Tn3 family protein  22.23 
 
 
994 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5067  transposase Tn3 family protein  21.18 
 
 
969 aa  118  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0388929  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>