168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_D6457 on replicon NC_007337
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007337  Reut_D6457  transposase Tn3  100 
 
 
1008 aa  2086    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4353  transposase Tn3 family protein  82.32 
 
 
1010 aa  1744    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1476  transposase Tn3 family protein  84.92 
 
 
1009 aa  1780    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000034033 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1851  transposase Tn3 family protein  84.92 
 
 
1009 aa  1780    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000277691 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4478  transposase Tn3 family protein  84.92 
 
 
1009 aa  1780    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000650614 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4490  transposase Tn3 family protein  82.32 
 
 
1010 aa  1744    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.666147  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5340  transposase  84.92 
 
 
1009 aa  1780    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0116  transposase Tn3 family protein  35.78 
 
 
1018 aa  633  1e-180  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0215  transposase  34.09 
 
 
1015 aa  627  1e-178  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal  0.20757 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3470  transposase Tn3 family protein  34.95 
 
 
1028 aa  610  1e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4556  transposase Tn3 family protein  34.85 
 
 
1028 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.875652 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0192  transposase Tn3 family protein  34.85 
 
 
1026 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1989  transposase Tn3 family protein  34.85 
 
 
1026 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1962  transposase Tn3 family protein  34.15 
 
 
929 aa  536  1e-151  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3466  transposase Tn3 family protein  30.34 
 
 
992 aa  458  1e-127  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4112  transposase Tn3 family protein  29.71 
 
 
1006 aa  443  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0051  hypothetical protein  27.67 
 
 
1015 aa  417  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.107009  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3469  transposase Tn3 family protein  28.5 
 
 
883 aa  340  7e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02953  Transposase Tn3  28.01 
 
 
831 aa  331  3e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.225091  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4770  Tn5044 transposase  87.85 
 
 
188 aa  326  1e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.653954 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01406  Transposase Tn3  41.04 
 
 
267 aa  196  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6928  transposase Tn3 family protein  24.08 
 
 
1027 aa  192  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_24  transposase  21.82 
 
 
1019 aa  191  7e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.207727  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1970  TnpA family transposase  23.3 
 
 
1020 aa  187  8e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4638  transposase  64.1 
 
 
118 aa  156  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.655234 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  22.06 
 
 
997 aa  146  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  21.3 
 
 
988 aa  144  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  21.3 
 
 
988 aa  144  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  21.3 
 
 
988 aa  144  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  21.3 
 
 
988 aa  144  6e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  27.19 
 
 
968 aa  143  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  21.03 
 
 
988 aa  142  3e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  21.94 
 
 
988 aa  141  6e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  20.94 
 
 
990 aa  141  6e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  20.94 
 
 
990 aa  140  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  21.51 
 
 
988 aa  140  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  22.11 
 
 
988 aa  140  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  20.75 
 
 
990 aa  139  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  20.75 
 
 
990 aa  139  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  20.75 
 
 
990 aa  139  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  24.19 
 
 
983 aa  139  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  20.77 
 
 
990 aa  137  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  20.77 
 
 
990 aa  137  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  21.46 
 
 
989 aa  137  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  21.88 
 
 
983 aa  136  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  21.71 
 
 
994 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  21.71 
 
 
994 aa  135  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  25.39 
 
 
988 aa  135  6e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  25.39 
 
 
988 aa  135  6e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  25.39 
 
 
988 aa  135  6e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  21.54 
 
 
988 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  24.26 
 
 
996 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  21.87 
 
 
862 aa  130  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  21.79 
 
 
988 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  21.79 
 
 
988 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02020  transposase  20 
 
 
1019 aa  127  9e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  21.49 
 
 
964 aa  127  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  24.55 
 
 
988 aa  126  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  21.52 
 
 
994 aa  125  5e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  24.82 
 
 
988 aa  125  6e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  21.35 
 
 
989 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4311  TOBE domain-containing protein  26.2 
 
 
573 aa  123  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  22.36 
 
 
1015 aa  122  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  21.79 
 
 
961 aa  122  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5358  transposase Tn3 family protein  25.06 
 
 
990 aa  122  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17398 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  23.76 
 
 
996 aa  120  9e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  23.76 
 
 
996 aa  120  9e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  23.76 
 
 
996 aa  120  9e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3479  Tn5044 transposase  42.66 
 
 
156 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02954  transposase  42.66 
 
 
156 aa  119  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0191401  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  30.66 
 
 
976 aa  116  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5398  transposase Tn3 family protein  23.35 
 
 
1029 aa  116  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0815937  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3666  transposase Tn3 family protein  30.66 
 
 
924 aa  116  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376312  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  21.32 
 
 
1006 aa  116  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  23.15 
 
 
992 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0072  transposase  23.3 
 
 
546 aa  115  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.520579  normal  0.363066 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0079  transposase  24.38 
 
 
435 aa  112  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.776565  normal  0.783345 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0025  transposase Tn3 family protein  22.53 
 
 
1006 aa  112  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0079  transposase Tn3 family protein  22.53 
 
 
1006 aa  112  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3676  transposase Tn3 family protein  24.16 
 
 
772 aa  112  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.635368 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1226  transposase Tn3  22.04 
 
 
993 aa  111  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6606  transposase Tn3 family protein  22.04 
 
 
993 aa  111  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0187013 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  22.42 
 
 
771 aa  111  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2512  transposase Tn3  20.82 
 
 
989 aa  110  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227381  normal  0.0913005 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  21.95 
 
 
991 aa  110  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  21.95 
 
 
991 aa  110  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  20.59 
 
 
988 aa  110  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  20.04 
 
 
985 aa  110  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  22.69 
 
 
550 aa  108  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  20.63 
 
 
988 aa  107  8e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  20.63 
 
 
988 aa  107  8e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19600  transposase, TnpA family  25.49 
 
 
1028 aa  107  8e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.546457  normal  0.0923144 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  22.19 
 
 
988 aa  107  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  21.87 
 
 
606 aa  107  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  22.43 
 
 
755 aa  107  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  22.22 
 
 
991 aa  107  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  21.87 
 
 
988 aa  107  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  20.19 
 
 
987 aa  104  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  21.75 
 
 
991 aa  103  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  21.75 
 
 
991 aa  103  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>